概括
基因 55632
象征 G2E3
同义词 KIAA1333 | PHF7B
描述 G2/M期特异性E3泛素蛋白连接酶
参考 MIM:611299|HGNC:HGNC:20338|ENSEMBL:ENSG0000000092140|HPRD:13851|Vega:Otthumg00000140204
基因类型 蛋白质编码
地图位置 14Q12
Pascal P值 0.198
Sherlock P值 0.049
胎儿β 1.308
主持人

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
DGCR8 0.95 0.92
HDAC6 0.93 0.92
ILF3 0.93 0.94
vav2 0.93 0.90
WDR6 0.93 0.92
ZCCHC8 0.93 0.91
ZNF509 0.93 0.92
ZNF333 0.93 0.92
chfr 0.93 0.93
axin1 0.92 0.90
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.75 -0.89
AF347015.27 -0.75 -0.89
MT-CO2 -0.74 -0.88
HLA-F -0.72 -0.74
AIFM3 -0.72 -0.75
C5orf53 -0.72 -0.74
AF347015.33 -0.72 -0.85
mt-cyb -0.71 -0.86
TSC22D4 -0.71 -0.77
S100B -0.71 -0.80

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IPI 14667819
GO:0016874 连接酶活性 IEA -
GO:0016881 酸 - 氨基酸连接酶活性 IEA -
去:0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006464 蛋白质修饰过程 IEA -
去:0006511 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005794 高尔基体 艾达 18029348
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005634 IEA -
去:0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌 404 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血成熟细胞 293 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamazaki TCEB3靶向DN 215 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
克拉斯的iwanaga致癌作用 170 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Cycling基因 148 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期G2 182 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期g2 m 216 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reichert有丝分裂LIN9目标 28 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-15/16/195/424/497 36 42 1a HSA-MIR-15A uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-503 36 42 1a HSA-MIR-503 uagcagcgggaacaguucugcag