基因页面:PRKAB1
总结吗?
| GeneID | 5564年 |
| 象征 | PRKAB1 |
| 同义词 | AMPK | HAMPKb |
| 描述 | 蛋白激酶活化非催化亚基β1 |
| 参考 | MIM: 602740|HGNC: HGNC: 9378|运用:ENSG00000111725|HPRD: 04116|织女:OTTHUMG00000168954 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 12 q24.1-q24.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.001 |
| 胎儿β | 0.41 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs13291971 | chr9 | 12861064 | PRKAB1 | 5564年 | 0.16 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PDE7B | 0.80 | 0.78 |
| INF2 | 0.79 | 0.74 |
| FBXL16 | 0.78 | 0.77 |
| IL17RA | 0.77 | 0.77 |
| SMAD3 | 0.76 | 0.79 |
| SLC6A1 | 0.75 | 0.85 |
| STIM1 | 0.75 | 0.77 |
| AGFG2 | 0.75 | 0.75 |
| ACTN1 | 0.74 | 0.71 |
| RAP1GAP | 0.73 | 0.66 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RPL24 | -0.48 | -0.59 |
| RPS3AP47 | -0.47 | -0.55 |
| RPL31 | -0.46 | -0.57 |
| RPL27 | -0.46 | -0.56 |
| RPL35A | -0.46 | -0.61 |
| C12orf45 | -0.46 | -0.54 |
| RPS23 | -0.46 | -0.57 |
| RPS20 | -0.46 | -0.61 |
| EXOSC8 | -0.46 | -0.50 |
| C9orf46 | -0.45 | -0.54 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 18403135 | |
| 去:0004553 | 水解酶活性,水解O-glycosyl化合物 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005975 | 碳水化合物代谢过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0007165 | 信号转导 | 助教 | 9575201 | |
| 去:0006633 | 脂肪酸生物合成的过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
| 扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 中国国际皮革展 | ACL | ATPCL | CLATP | ATP柠檬酸裂解酶 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| DHX36 | DDX36 | G4R1 | KIAA1488 | MLEL1 | RHAU | DEAH (Asp-Glu-Ala-His)盒子多肽36 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| EZR | CVIL | CVL | DKFZp762H157 | FLJ26216 | MGC1584 | VIL2 | ezrin | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| F10 | 外汇——| | 凝血因子X | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| FNIP1 | DKFZp686E18167 | DKFZp781P0215 | KIAA1961 | MGC667 | 经酮相互作用蛋白1 | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 17028174 |
| GYS1 | GSY | gy | 糖原合酶1(肌肉) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| 火星 | FLJ35667 | METRS | MTRNS | methionyl-tRNA合成酶 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| MYH10 | MGC134913 | MGC134914 | NMMHCB | 肌凝蛋白重链10,non-muscle | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| NDUFA7 | B14.5a | NADH脱氢酶(辅酶q) 1α复形,7日,14.5 kda | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| PRKAB2 | MGC61468 | 活化蛋白激酶,β2非催化亚基 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| PRKAG1 | AMPKG | MGC8666 | 活化蛋白激酶,γ1非催化亚基 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10698692 |
| PRKAG2 | AAKG | AAKG2 | CMH6 | H91620p | wpw | 活化蛋白激酶,γ2非催化亚基 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10698692 |
| SNRNP200 | ASCC3L1 | BRR2 | HELIC2 | u5 - 200 kd | 小核200 kda核糖核蛋白(U5) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG胰岛素信号通路 | 137年 | 103年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG ADIPOCYTOKINE信号通路 | 67年 | 57 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HCM KEGG肥厚性心肌病 | 85年 | 65年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BIOCARTA CHREBP2通路 | 42 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BIOCARTA瘦素途径 | 11 | 11 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID LKB1的途径 | 47 | 37 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID P53下游通路 | 137年 | 94年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID VEGFR1 2通道 | 69年 | 57 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME激活AMPK刺激肌肉脂肪酸氧化 | 19 | 16 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME胰岛素受体信号级联 | 87年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过LKB1 REACTOME调控AMPK活性 | 15 | 13 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME LKB1 AMPK MTOR的能源依赖监管 | 18 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| AMPK REACTOME RHEB GTPASE活动的监管 | 10 | 9 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME PKB介导的事件 | 29日 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME通过胰岛素受体信号 | 108年 | 72年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME PI3K级联 | 71年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病 | 1382年 | 904年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN BASAKI YBX1目标 | 384年 | 230年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MULLIGHAN NPM1突变特征2 | 139年 | 83年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MULLIGHAN NPM1签名3 | 341年 | 197年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ENK紫外线反应表皮 | 293年 | 179年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SPIELMAN淋巴母细胞欧洲和亚洲的DN | 584年 | 395年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH MYC最大目标 | 775年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KANNAN TP53的目标了 | 58 | 40 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 韦斯顿VEGFA目标6小时 | 59 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 韦斯顿VEGFA目标 | 108年 | 71年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CREIGHTON内分泌治疗抵抗3 | 720年 | 440年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由4 nqo或紫外线KYNG DNA损伤 | 63年 | 44 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KYNG DNA损伤DN | 195年 | 135年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 安布罗西尼FLAVOPIRIDOL治疗TP53 | 109年 | 63年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝癌了 | 973年 | 570年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 尼克应对PROC治疗DN | 27 | 18 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 蒋介石肝癌子类未经DN | 193年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KYNG WERNER通气和正常老化 | 93年 | 62年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 党受MYC | 1103年 | 714年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 么时间响应黄体酮集群9 | 76年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒4 hr DN | 254年 | 158年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 斯米尔诺夫红外反应6小时 | 166年 | 97年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 137 | 704年 | 710年 | 1 | hsa - mir - 137 | UAUUGCUUAAGAAUACGCGUAG |
| mir - 539 | 748年 | 754年 | m8 | hsa - mir - 539 | GGAGAAAUUAUCCUUGGUGUGU |