基因页：Lyar
概括？
| 基因 | 55646 |
| 象征 | Lyar |
| 同义词 | ZC2HC2 | Zlyar |
| 描述 | LY1抗体反应性 |
| 参考 | HGNC：HGNC：26021|Ensembl：ENSG00000145220|HPRD：10064|Vega：Otthumg00000125477 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 4P16.3 |
| Pascal P值 | 0.745 |
| Sherlock P值 | 8.849e-6 |
| 胎儿β | 0.64 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS4689885 | CHR4 | 4560775 | Lyar | 55646 | 0.19 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| KDR | 0.73 | 0.64 |
| FLVCR2 | 0.68 | 0.56 |
| ETS1 | 0.66 | 0.62 |
| 喇嘛4 | 0.66 | 0.56 |
| CD93 | 0.66 | 0.59 |
| procr | 0.64 | 0.47 |
| 埃德拉 | 0.64 | 0.50 |
| FN1 | 0.64 | 0.56 |
| htra3 | 0.63 | 0.54 |
| Eln | 0.63 | 0.57 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C5orf53 | -0.37 | -0.40 |
| NPIPL2 | -0.33 | -0.45 |
| C11orf51 | -0.33 | -0.38 |
| crybb2 | -0.33 | -0.30 |
| UQCRB | -0.32 | -0.43 |
| ACOT13 | -0.32 | -0.37 |
| SCRG1 | -0.31 | -0.30 |
| SH3BGR | -0.31 | -0.30 |
| ZBTB8OS | -0.31 | -0.38 |
| FAM162A | -0.31 | -0.33 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| BXDC2 | brix |FLJ11100 | 包含2的brix域 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| DDX21 | DKFZP686F21172 |Gua |gurdb |rh-ii/gu |RH-II/GUA | 死亡（ASP-GLU-ALA-ASP）盒多肽21 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| DDX27 | DKFZP667N057 |FLJ12917 |FLJ20596 |FLJ22238 |HSPC259 |MGC1018 |MGC163147 |pp3241 |RHLP |rrp3p | dJ686N3.1 | 死亡（ASP-GLU-ALA-ASP）盒多肽27 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| DHX57 | DDX57 |FLJ32861 | DEAH（ASP-GLU-ALA-ASP/HIS）盒多肽57 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| DHX9 | ddx9 |LKP |ndhii |RHA | DEAH（ASP-GLU-ALA-HIS）盒多肽9 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| EBNA1BP2 | EBP2 |nobp |P40 | EBNA1结合蛋白2 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| EIF3I | EIF3S2 |Pro2242 |Trip-1 |Trip1 |eif3-beta |EIF3-P36 | 真核翻译引发因子3，亚基I | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| GNL2 | FLJ40906 |Humauantig |NGP1 |NGP-1 |DJ423B22.6 | 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白样2（核仁） | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| GTPBP4 | CRFG |FLJ10686 |FLJ10690 |FLJ39774 |NGB |NOG1 | GTP结合蛋白4 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| KPNA1 | IPOA5 |NPI-1 |RCH2 |SRP1 | 核桃蛋白α1（importin alpha 5） | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| KRT31 | ha1 |ha-1 |krtha1 |MGC138630 |HHA1 | 角蛋白31 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| KRT82 | HB2 |HB-2 |KRTHB2 | 角蛋白82 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| KRT85 | HB5 |HB-5 |krthb5 |HHB5 | 角蛋白85 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| mybbp1a | FLJ37886 |P160 |pap2 | MYB结合蛋白（P160）1A | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| NAT10 | ALP |DKFZP434C116 |FLJ10774 |FLJ12179 |FLJ23850 |KIAA1709 |哈普 | N-乙酰基转移酶10（与GCN5相关） | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| NPM1 | B23 |MGC104254 |NPM | 核素蛋白（核酸磷酸蛋白B23，numatrin） | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| RPL18A | - | 核糖体蛋白L18A | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| RPL21 | DKFZP686C06101 |FLJ27458 |L21 |MGC104274 |MGC104275 |MGC71252 | 核糖体蛋白L21 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| RPL23A | FLJ27455 |MDA20 | 核糖体蛋白L23A | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| RPL3 | MGC104284 |TARBP-B | 核糖体蛋白L3 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| RPL31 | MGC88191 | 核糖体蛋白L31 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| RPS3A | fte1 |mftl |MGC23240 | 核糖体蛋白S3A | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| RPS9 | - | 核糖体蛋白S9 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| SRP14 | alurbp |MGC14326 | 信号识别粒子14KDA（同源ALU RNA结合蛋白） | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| TSR1 | FLJ10534 |KIAA1401 |MGC131829 | TSR1，20S rRNA积累，同源物（S. cerevisiae） | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| TWF2 | A6RP |A6r |MSTP011 |ptk9l | 双胞胎蛋白，肌动蛋白结合蛋白，同源2（果蝇） | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| ZBTB16 | PLZF |ZNF145 | 锌指和包含16的BTB结构域 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| ZHX1 | - | 锌的手指和同源蛋白酶1 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Sengupta鼻咽癌，LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| vecchi胃癌早期 | 430 | 232 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche皮肤肿瘤启动子DN | 185 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche Papilloma风险低DN | 165 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche Papilloma风险高DN | 180 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| darwiche鳞状细胞癌DN | 181 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim Myc放大靶向 | 201 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 唱机转移基质DN | 54 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性4 | 307 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 等级结肠和直肠癌 | 285 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee Liver Cancer生存DN | 175 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chang Core血清反应 | 212 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chang Cycling基因 | 148 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张TLX目标36小时DN | 185 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张TLX目标60小时DN | 277 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张TLX目标DN | 89 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 惠特菲尔德细胞周期M G1 | 148 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Karlsson TGFB1靶向 | 127 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 | 374 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dutertre雌二醇反应6小时 | 229 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化 | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |