基因页：prkab2

概括？
基因 5565
象征 prkab2
同义词 -
描述 蛋白激酶AMP激活的非催化亚基β2
参考 MIM：602741|HGNC：HGNC：9379|ENSEMBL：ENSG00000131791|HPRD：04117|Vega：Otthumg0000000014032
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q21.1
胎儿β 1.481
DMG 1（＃研究）
主持人 小脑半球

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CNV：是的 拷贝数变异研究 手动策划
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 1
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.0235
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） PSR：0.00814
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG15188491 1 146644106 prkab2 3E-9 -0.018 2.08E-6 DMG：JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MATR3 0.95 0.95
STX7 0.94 0.94
CAND1 0.94 0.95
FYTTD1 0.93 0.94
Exoc5 0.93 0.94
DNAJC18 0.93 0.92
ube3a 0.93 0.95
IPO7 0.93 0.94
SMEK2 0.92 0.92
ABCE1 0.92 0.93
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FXYD1 -0.70 -0.87
AC018755.7 -0.68 -0.77
MT-CO2 -0.67 -0.82
AF347015.33 -0.67 -0.81
TSC22D4 -0.66 -0.78
AF347015.31 -0.66 -0.80
ifi27 -0.66 -0.82
higd1b -0.66 -0.83
AIFM3 -0.65 -0.75
hepn1 -0.65 -0.75

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005515 蛋白质结合 IPI 17353931
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007165 信号转导 塔斯 9575201
去：0006633 脂肪酸生物合成过程 IEA -
去：0046320 调节脂肪酸氧化 经验 16054041
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005829 细胞质 经验 15060529
去：0005654 核质 经验 10698692

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
KEGG胰岛素信号通路 137 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG脂肪细胞信号传导途径 67 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG肥厚性心肌病HCM 85 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Chrebp2途径 42 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
生物卡塔尔瘦素途径 11 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组激活的AMPK刺激肌肉中的脂肪酸氧化 19 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胰岛素受体信号传导级联 87 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
能量代谢的反应组整合 120 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过LKB1对AMPK活性的反应组调节 15 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lkb1 ampk对MTOR的反应组能量依赖性调节 18 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMPK对RHEB GTPase活性的反应组调节 10 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 168 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome PKB介导的事件 29 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胰岛素受体的反应组信号传导 108 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome PI3K级联 71 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钟对偶氮替丁的反应和tsa 183 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Horiuchi WTAP靶向 306 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rodrigues DCC目标DN 121 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除 195 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染24小时DN 148 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时DN 298 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kyng DNA损坏紫外线 62 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损伤DN 195 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤相邻 174 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN NPAS4靶向 163 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng Werner综合征和正常衰老 93 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移 221 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染30分钟DN 150 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染4小时DN 254 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gabriely miR21靶标 289 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg KDM3A靶向缺氧 208 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-153 3322 3328 1a HSA-MIR-153 Uugcauagucacaaaaguga
mir-217 3886 3892 1a HSA-MIR-217 uacugcaucagaacugauuggau
mir-25/32/92/363/367 3324 3330 1a HSA-MIR-25脑 Cauugcacuugucucggucuga
HSA-MIR-32 uauugcacauacuaaguugc
HSA-MIR-92 uauugcacuugucccgcgcug
HSA-MIR-367 Aauugcacuuuagcaaugga
HSA-MIR-92BSZ uauugcacucgucccgcgcuc
mir-29 4249 4255 M8 HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu
mir-320 167 173 1a HSA-MIR-320 aaaagcugggugagaggggcgaa
mir-448 3321 3328 1A，M8 HSA-MIR-448 uugcauauguaggauguccccau