基因页：猪
概括？
| 基因 | 55650 |
| 象征 | 猪 |
| 同义词 | gpi-mt-ii | hpmrs1 | pig-v |
| 描述 | 磷脂酰肌醇聚糖锚固生物合成V类V |
| 参考 | MIM：610274|HGNC：HGNC：26031|Ensembl：ENSG0000000060642|HPRD：07912|Vega：Otthumg00000004005 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1p36.11 |
| Pascal P值 | 0.004 |
| Sherlock P值 | 0.614 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG02375201 | 1 | 27114675 | 猪 | 2.064E-4 | -0.207 | 0.035 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS12548622 | CHR8 | 140121235 | 猪 | 55650 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| VAC14 | 0.90 | 0.87 |
| DTX3 | 0.89 | 0.87 |
| MRPS2 | 0.89 | 0.90 |
| sgta | 0.89 | 0.88 |
| SCAMP3 | 0.89 | 0.88 |
| PPP2R1A | 0.88 | 0.85 |
| GLTPD1 | 0.88 | 0.89 |
| RNF126 | 0.88 | 0.87 |
| KLHL22 | 0.88 | 0.87 |
| lypla2 | 0.88 | 0.87 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.8 | -0.75 | -0.73 |
| AF347015.21 | -0.74 | -0.78 |
| AF347015.27 | -0.74 | -0.73 |
| MT-CO2 | -0.74 | -0.72 |
| AF347015.31 | -0.74 | -0.71 |
| mt-cyb | -0.72 | -0.71 |
| AF347015.33 | -0.72 | -0.70 |
| MT-ATP8 | -0.70 | -0.78 |
| AF347015.15 | -0.70 | -0.69 |
| AF347015.2 | -0.69 | -0.68 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG糖基磷脂酰肌醇GPI锚固生物合成 | 25 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome的翻译后修饰合成GPI锚定蛋白 | 26 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome术后翻译蛋白修饰 | 188 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组合成糖基磷脂酰肌醇GPI | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 中村肿瘤区周围与中央DN | 634 | 384 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| sotiriou乳腺癌1级vs 3 DN | 52 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 | 391 | 222 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向 | 317 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Aguirre胰腺癌拷贝编号DN | 238 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang EGF持续DN | 61 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |