Summary
GeneID 55660
Symbol PRPF40A
同义词 fbp-11 | fbp11 | flaf1 | fnbp3 | hip-10 | hip10 | hypa | ny-ren-6 | prp40
描述 前MRNA处理因子40同源物A
参考 MIM:612941|HGNC:HGNC:16463|Ensembl:ENSG00000196504|Vega:Otthumg00000154031
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q23.3
Pascal P值 2.395E-4
支持 Ascano FMRP目标

Gene in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.02395
表达 基因表达的荟萃分析 p价值:2
网络 最短路径距离核心基因in the Human protein-protein interaction network PPI网络中最短路径的贡献:0.1276

Section I. Genetics and epigenetics annotation


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IPI 15383276|17353931
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006397 mRNA处理 IEA -
去:0008380 RNA剪接 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 IEA -
GO:0016607 核斑点 IEA -

Section IV. Protein-protein interaction annotation

互动者 别名b 官方全名b 实验 Source PubMed ID
CHD3 Mi-2a |mi2-alpha |ZFH 染色体群酶DNA结合蛋白3 - HPRD 15383276
Cul1 MGC149834 |MGC149835 cullin 1 - HPRD 14603323
faslg APT1LG1 |CD178 |CD95L |fasl |TNFSF6 FAS配体(TNF超家族,成员6) - HPRD 11741599
FMN1 DKFZP686C2281 |DKFZP686G2387 |FLJ45135 |FMN |LD |MGC125288 |MGC125289 FORMIN 1 蛋白质肽 Biogrid 11604498
FMNL3 DKFZp762B245 | FHOD3 | FLJ45265 | MGC45819 | WBP3 形状样3 - HPRD,Biogrid 9171351
hnrnpul1 E1B-AP5 |e1bap5 |FLJ12944 |HNRPUL1 异质核核糖核蛋白U样1 Two-hybrid Biogrid 16169070
htt 高清|IT15 亨廷顿 - HPRD,Biogrid 9700202
htt 高清|IT15 亨廷顿 Huntingtin与HYPA相互作用 绑定 9700202
map1lc3a LC3 |LC3A |map1alc3 |MAP1BLC3 microtubule-associated protein 1 light chain 3 alpha - HPRD 15383276
MECP2 autsx3 |DKFZP686A24160 |MRX16 |MRX79 |MRXS13 |mrxsl |ppmx |RTS |RTT methyl CpG binding protein 2 (Rett syndrome) - HPRD,Biogrid 9171351
Mll4 hrx2 |KIAA0304 |mll2 |trx2 |WBP7 髓样/淋巴或混合乳突白血病4 - HPRD 9171351
PIAS4 FLJ12419 | MGC35296 | PIASY | Piasg | ZMIZ6 活化统计的蛋白质抑制剂,4 - HPRD 15383276
RNPS1 E5.1 |MGC117332 RNA binding protein S1, serine-rich domain 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
RNU1A Hu1-1 |RNU1 |RNU1G4 |RNU1A1 |U1 RNA,U1A小核 亲和力捕获-RNA Biogrid 15456888
RNU2-1 RNU2 |U2 RNA,U2小核1 亲和力捕获-RNA Biogrid 15456888
serpinb9 CAP-3 |cap3 |PI9 Serpin肽酶抑制剂,进化枝B(椭圆蛋白),成员9 Two-hybrid Biogrid 16169070
SF1 D11S636 |ZFM1 |ZNF162 剪接因子1 - HPRD 15456888
SRPK2 FLJ36101 |SFRSK2 SFRS蛋白激酶2 - HPRD 9171351
U2AF2 U2AF65 U2小核RNA辅助因子2 - HPRD 15456888
Wasl DKFZP779G0847 |MGC48327 |n-wasp |nwasp Wiskott-Aldrich综合征样 - HPRD 14697212
WBP11 DKFZp779M1063 | NPWBP | SIPP1 WW结构域结合蛋白11 - HPRD 10744724
WBP5 DKFZp313K1940 | TCEAL9 WW结构域结合蛋白5 - HPRD,Biogrid 9171351
是的 14-3-3-GAMMA 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白,伽马多肽 - HPRD 15324660
ZFHX3 ATBF1 |ATBT 锌指同源3 - HPRD,Biogrid 9171351
ZHX1 - 锌的手指和同源蛋白酶1 - HPRD 15383276


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg剪接体 128 72 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang LMO4靶向DN 352 225 All SZGR 2.0 genes in this pathway
王攀登目标DN 186 114 All SZGR 2.0 genes in this pathway
奥斯曼膀胱癌 404 246 All SZGR 2.0 genes in this pathway
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim WT1靶向DN 459 276 All SZGR 2.0 genes in this pathway
多德鼻咽癌DN 1375 806 All SZGR 2.0 genes in this pathway
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pujana ATM PCC网络 1442 892 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ferreira Ewings肉瘤不稳定与稳定 167 92 All SZGR 2.0 genes in this pathway
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 6HR DN 514 330 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schaeffer前列腺开发和癌症Box1 15 10 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schaeffer前列腺开发和癌症Box4 DN 32 22 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath ES 1 379 235 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Iizuka肝癌进展G1 G2 DN 25 18 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Peng Leucine剥夺DN 187 122 All SZGR 2.0 genes in this pathway
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 All SZGR 2.0 genes in this pathway
彭雷帕霉素反应dn 245 154 All SZGR 2.0 genes in this pathway
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LEI MYB目标 318 215 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 DN 163 115 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病初期 390 242 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病 1691 1088 All SZGR 2.0 genes in this pathway
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 All SZGR 2.0 genes in this pathway
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Fujii YBX1靶向DN 202 132 All SZGR 2.0 genes in this pathway
活化B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 81 66 All SZGR 2.0 genes in this pathway
米利假足 518 299 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ROME INSULIN TARGETS IN MUSCLE DN 204 114 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yagi AML带8 21易位 368 247 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAGI AML WITH INV 16 TRANSLOCATION 422 277 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Fournier腺泡开发2 277 172 All SZGR 2.0 genes in this pathway
钱德兰转移DN 306 191 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Li DCP2绑定mRNA 89 57 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 All SZGR 2.0 genes in this pathway
棕熊UVC响应迟到 1137 655 All SZGR 2.0 genes in this pathway
pasini suz12靶向DN 315 215 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee BMP2靶向DN 882 538 All SZGR 2.0 genes in this pathway
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 All SZGR 2.0 genes in this pathway