基因页:PRPF40A
Summary?
GeneID | 55660 |
Symbol | PRPF40A |
同义词 | fbp-11 | fbp11 | flaf1 | fnbp3 | hip-10 | hip10 | hypa | ny-ren-6 | prp40 |
描述 | 前MRNA处理因子40同源物A |
参考 | MIM:612941|HGNC:HGNC:16463|Ensembl:ENSG00000196504|Vega:Otthumg00000154031 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2q23.3 |
Pascal P值 | 2.395E-4 |
支持 | Ascano FMRP目标 |
Gene in Data Sources
Section I. Genetics and epigenetics annotation
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PRPF40A_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 15383276|17353931 | |
Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006397 | mRNA处理 | IEA | - | |
去:0008380 | RNA剪接 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | IEA | - | |
GO:0016607 | 核斑点 | IEA | - |
Section IV. Protein-protein interaction annotation
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
CHD3 | Mi-2a |mi2-alpha |ZFH | 染色体群酶DNA结合蛋白3 | - | HPRD | 15383276 |
Cul1 | MGC149834 |MGC149835 | cullin 1 | - | HPRD | 14603323 |
faslg | APT1LG1 |CD178 |CD95L |fasl |TNFSF6 | FAS配体(TNF超家族,成员6) | - | HPRD | 11741599 |
FMN1 | DKFZP686C2281 |DKFZP686G2387 |FLJ45135 |FMN |LD |MGC125288 |MGC125289 | FORMIN 1 | 蛋白质肽 | Biogrid | 11604498 |
FMNL3 | DKFZp762B245 | FHOD3 | FLJ45265 | MGC45819 | WBP3 | 形状样3 | - | HPRD,Biogrid | 9171351 |
hnrnpul1 | E1B-AP5 |e1bap5 |FLJ12944 |HNRPUL1 | 异质核核糖核蛋白U样1 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
htt | 高清|IT15 | 亨廷顿 | - | HPRD,Biogrid | 9700202 |
htt | 高清|IT15 | 亨廷顿 | Huntingtin与HYPA相互作用 | 绑定 | 9700202 |
map1lc3a | LC3 |LC3A |map1alc3 |MAP1BLC3 | microtubule-associated protein 1 light chain 3 alpha | - | HPRD | 15383276 |
MECP2 | autsx3 |DKFZP686A24160 |MRX16 |MRX79 |MRXS13 |mrxsl |ppmx |RTS |RTT | methyl CpG binding protein 2 (Rett syndrome) | - | HPRD,Biogrid | 9171351 |
Mll4 | hrx2 |KIAA0304 |mll2 |trx2 |WBP7 | 髓样/淋巴或混合乳突白血病4 | - | HPRD | 9171351 |
PIAS4 | FLJ12419 | MGC35296 | PIASY | Piasg | ZMIZ6 | 活化统计的蛋白质抑制剂,4 | - | HPRD | 15383276 |
RNPS1 | E5.1 |MGC117332 | RNA binding protein S1, serine-rich domain | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
RNU1A | Hu1-1 |RNU1 |RNU1G4 |RNU1A1 |U1 | RNA,U1A小核 | 亲和力捕获-RNA | Biogrid | 15456888 |
RNU2-1 | RNU2 |U2 | RNA,U2小核1 | 亲和力捕获-RNA | Biogrid | 15456888 |
serpinb9 | CAP-3 |cap3 |PI9 | Serpin肽酶抑制剂,进化枝B(椭圆蛋白),成员9 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
SF1 | D11S636 |ZFM1 |ZNF162 | 剪接因子1 | - | HPRD | 15456888 |
SRPK2 | FLJ36101 |SFRSK2 | SFRS蛋白激酶2 | - | HPRD | 9171351 |
U2AF2 | U2AF65 | U2小核RNA辅助因子2 | - | HPRD | 15456888 |
Wasl | DKFZP779G0847 |MGC48327 |n-wasp |nwasp | Wiskott-Aldrich综合征样 | - | HPRD | 14697212 |
WBP11 | DKFZp779M1063 | NPWBP | SIPP1 | WW结构域结合蛋白11 | - | HPRD | 10744724 |
WBP5 | DKFZp313K1940 | TCEAL9 | WW结构域结合蛋白5 | - | HPRD,Biogrid | 9171351 |
是的 | 14-3-3-GAMMA | 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白,伽马多肽 | - | HPRD | 15324660 |
ZFHX3 | ATBF1 |ATBT | 锌指同源3 | - | HPRD,Biogrid | 9171351 |
ZHX1 | - | 锌的手指和同源蛋白酶1 | - | HPRD | 15383276 |