基因页面:ZNF446
总结吗?
GeneID | 55663年 |
象征 | ZNF446 |
同义词 | ZKSCAN20 | ZSCAN30 | ZSCAN52 |
描述 | 锌指蛋白446 |
参考 | HGNC: HGNC: 21036|运用:ENSG00000083838|HPRD: 07934|织女:OTTHUMG00000183541 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 19 q13.43 |
帕斯卡假定值 | 0.06 |
夏洛克假定值 | 1.128的军医 |
胎儿β | -0.134 |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs6709022 | chr2 | 159359411 | ZNF446 | 55663年 | 0.17 | 反式 | ||
rs6999126 | chr8 | 60651104 | ZNF446 | 55663年 | 0.19 | 反式 | ||
rs10504300 | chr8 | 60714730 | ZNF446 | 55663年 | 0.18 | 反式 | ||
rs7832367 | chr8 | 60779647 | ZNF446 | 55663年 | 0.19 | 反式 | ||
rs6471839 | chr8 | 60791647 | ZNF446 | 55663年 | 0.17 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ZNF446_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
REACTOME通用转录途径 | 352年 | 181年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MULLIGHAN MLL签名2 | 418年 | 263年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
费雷拉尤因肉瘤不稳定和稳定的DN | 98年 | 59 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
萧述三乳腺癌复发脑DN | 85年 | 58 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
萧述三乳腺癌基本DN | 701年 | 446年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
经典VERHAAK胶质母细胞瘤 | 162年 | 122年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |