概括?
基因 5567
Symbol PRKACB
同义词 PKA C-beta|PKACB
描述 protein kinase cAMP-activated catalytic subunit beta
参考 MIM:176892|HGNC:HGNC:9381|Ensembl:ENSG00000142875|HPRD:01482|Vega:OTTHUMG00000009975
基因type protein-coding
地图位置 1p31.1
Pascal P值 0.035
Sherlock P值 0.884
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 细胞内信号转导
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS
G2Cdb.humanNRC
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP
COMPOSITESET
Darnell FMRP目标
Potential synaptic genes

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.02692

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID Chromosome Position eGene 基因Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
rs10994209 Chr10 61877705 PRKACB 5567 0.04 trans

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PTP4A1 0.96 0.95
RNF2 0.95 0.96
FAM164A 0.95 0.97
VTA1 0.95 0.98
POLR2B 0.95 0.96
CSNK1A1 0.95 0.94
ZBTB6 0.95 0.94
LRP12 0.95 0.94
PAPOLG 0.95 0.95
PPP2R5E 0.95 0.96
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
hepn1 -0.75 -0.84
AIFM3 -0.75 -0.83
HLA-F -0.75 -0.83
TSC22D4 -0.75 -0.86
FXYD1 -0.73 -0.90
AF347015.33 -0.73 -0.89
AF347015.31 -0.73 -0.88
HSD17B14 -0.72 -0.83
MT-CO2 -0.72 -0.89
S100B -0.72 -0.85

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0000166 核苷酸结合 IEA -
GO:0000287 镁离子结合 艾达 12420224
GO:0005524 ATP结合 艾达 12420224
GO:0005524 ATP结合 IEA -
GO:0004674 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 IEA -
GO:0004691 cAMP-dependent protein kinase activity 艾达 12420224
GO:0016740 transferase activity IEA -
Biological process GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
去:0007188 G蛋白信号传导,耦合到CAMP核苷酸第二信使 塔斯 12420224
GO:0006468 蛋白氨基酸磷酸化 艾达 12420224
GO:0006468 蛋白氨基酸磷酸化 IEA -
去:0007243 protein kinase cascade 经验 12721358
去:0007165 signal transduction 塔斯 2342480
GO:0009755 hormone-mediated signaling 经验 12626323
细胞分量 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005634 IEA -
GO:0005737 细胞质 IEA -
去:0005952 cAMP-dependent protein kinase complex 塔斯 12420224

V.途径注释

Pathway name Pathway size #szgr 2.0基因 Info
KEGG MAPK SIGNALING PATHWAY 267 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG CALCIUM SIGNALING PATHWAY 178 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG CHEMOKINE SIGNALING PATHWAY 190 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG OOCYTE MEIOSIS 114 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg凋亡 88 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg血管平滑肌收缩 115 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg wnt信号通路 151 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG HEDGEHOG SIGNALING PATHWAY 56 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg间隙交界处 90 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg长期增强 70 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG OLFACTORY TRANSDUCTION 389 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg味道转导 52 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG胰岛素信号通路 137 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG GNRH SIGNALING PATHWAY 101 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG PROGESTERONE MEDIATED OOCYTE MATURATION 86 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg黑色素发生 102 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG VASOPRESSIN REGULATED WATER REABSORPTION 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG PRION DISEASES 35 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG霍乱弧菌感染个案N 56 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG DILATED CARDIOMYOPATHY 92 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta No1途径 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA CSK PATHWAY 24 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA AKAP95 PATHWAY 12 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA AGPCR PATHWAY 13 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta CFTR途径 12 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta GATA3途径 16 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA MPR PATHWAY 34 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta McAlpain途径 25 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta PPARA途径 58 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta IGF1R途径 23 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA VIP PATHWAY 29 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta NFAT途径 56 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta NOS1途径 24 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta PLCE途径 12 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA AKAPCENTROSOME PATHWAY 15 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA CHREBP2 PATHWAY 42 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA坏途径 26 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta CK1途径 17 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA DREAM PATHWAY 14 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA AKAP13 PATHWAY 12 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA GPCR PATHWAY 37 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA SHH PATHWAY 16 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Stathmin Pathway 19 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA CREB PATHWAY 27 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA CARM1 PATHWAY 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P73Pathway 79 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID GMCSF途径 37 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid reg gr途径 82 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P75 NTR PATHWAY 69 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL3途径 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID整合素A4B1途径 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NGF的Reactome信号传导 217 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome DAG和IP3信令 32 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2的Reactome信号传导 101 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY EGFR IN CANCER 109 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NGF信号通过TRKA从质膜发出 137 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGFR在疾病中的反应组信号传导 127 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
跨化学突触的反应组传播 186 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经元系统 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INTEGRATION OF ENERGY METABOLISM 120 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GLUCONEOGENESIS 34 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME OPIOID SIGNALLING 78 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome CA依赖性事件 30 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DARPP 32 EVENTS 25 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NEUROTRANSMITTER RECEPTOR BINDING AND DOWNSTREAM TRANSMISSION IN THE POSTSYNAPTIC CELL 137 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome PLC Beta介导的事件 43 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome PKA介导的CREB磷酸化 18 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TRANSMEMBRANE TRANSPORT OF SMALL MOLECULES 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
代谢调节中的反应组胰高血糖素信号传导 34 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PDGF的Reactome信号传导 122 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome下游信号转导 95 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胰岛素分泌的反应组调节BY GLUCAGON LIKE PEPTIDE1 43 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胰岛素分泌的反应组调节 93 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NMDA受体在谷氨酸结合和突触后事件上的反应组激活 37 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME POST NMDA RECEPTOR ACTIVATION EVENTS 33 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome的下游信号传导激活的FGFR 100 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PHOSPHOLIPASE C MEDIATED CASCADE 54 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY ILS 107 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome IL 3 5和GM CSF信号传导 43 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Aquaporin介导的运输 51 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME RAP1 SIGNALLING 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME REGULATION OF WATER BALANCE BY RENAL AQUAPORINS 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME FACTORS INVOLVED IN MEGAKARYOCYTE DEVELOPMENT AND PLATELET PRODUCTION 132 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME METABOLISM OF CARBOHYDRATES 247 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME HORMONE SENSITIVE LIPASE HSL MEDIATED TRIACYLGLYCEROL HYDROLYSIS 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME LIPID DIGESTION MOBILIZATION AND TRANSPORT 46 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GLUCOSE METABOLISM 69 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome适应性免疫系统 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY FGFR 112 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FULCHER INFLAMMATORY RESPONSE LECTIN VS LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期DN 367 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 48HR UP 128 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kokkinakis甲硫氨酸剥夺96小时 117 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌DN 232 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BARRIER CANCER RELAPSE NORMAL SAMPLE UP 32 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL BREAST 3 4WK UP 214 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL BREAST 4 5WK DN 196 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房6 7WK UP 197 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL TGFB1 TARGETS UP 169 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Appierto对Fenretinide的反应 38 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARMER BREAST CANCER APOCRINE VS BASAL 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 COMMON DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
曼恩对amifostine DN的反应 10 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险高与低DN 32 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRUETZMANN PANCREATIC CANCER UP 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOTZMANN EPITHELIAL TO MESENCHYMAL TRANSITION DN 206 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PASQUALUCCI LYMPHOMA BY GC STAGE DN 165 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM GERMINAL CENTER T HELPER UP 66 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANA TNF信号DN 90 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WONG IFNA2 RESISTANCE DN 34 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lenaour树突状细胞成熟 114 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petrova内皮淋巴与血液DN 162 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PETROVA PROX1 TARGETS DN 64 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JIANG AGING HYPOTHALAMUS DN 40 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IVANOVA HEMATOPOIESIS STEM CELL 254 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAELDE DIABETIC NEPHROPATHY DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JIANG AGING CEREBRAL CORTEX DN 54 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RESPONSE TO TRABECTEDIN DN 271 175 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR UP 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 24HR DN 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 TARGETS UP 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ TP53 TARGETS UP 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
de yy1靶向DN 92 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRADE COLON AND RECTAL CANCER DN 101 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Firestein增殖 175 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤C D 139 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GUTIERREZ CHRONIC LYMPHOCYTIC LEUKEMIA UP 12 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM ALL DISORDERS CALB1 CORR UP 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hirsch细胞转化特征dn 103 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IKEDA MIR1 TARGETS UP 53 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

miRNA family 目标位置 mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
miR-1/206 104 110 1a HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ UGGAAUGUAAGGAAGUGUGUGG
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
mir-141/200a 342 349 1a,m8 HSA-MIR-141 uaacacugucugugugugugaugg
HSA-MIR-200A uaacacugucuguguguguaaacgaugu
mir-18 3012 3018 m8 HSA-MIR-18a uaagguggaugugcagaua
HSA-MIR-18b uaaggugcaucuagugcagua
mir-182 480 487 1a,m8 HSA-MIR-182 UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA
HSA-MIR-182 UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA
mir-19 1404 1411 1a,m8 HSA-MIR-19a ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19b ugugcaaauccaugcaaaacuga
mir-193 853 859 1a HSA-MIR-193a Aacuggccuacaaagucccag
HSA-MIR-193b AACUGGCCCUCAAAGUCCCGCUUU
MiR-200BC/429 855 861 m8 HSA-MIR-200B uaauacugccugguaaugaugac
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
mir-324-3p 340 346 m8 HSA-MIR-324-3P ccacugccccaggugcugcugg
miR-329 3051 3057 m8 HSA-MIR-329 aacacaccugguaaccucuuu
mir-34/449 1204 1210 1a HSA-MIR-34A UGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUU
HSA-MIR-34C AGGCAGUGUAGUUAGCUGAUUGC
HSA-MIR-449 uggcaguguauuguagcuggu
HSA-MIR-449b Aggcaguguauuguuagcuggc
mir-381 2024 2030 1a hsa-miR-381 UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU
mir-384 3115 3122 1a,m8 hsa-miR-384 AUUCCUAGAAAUUGUUCAUA
mir-96 481 487 1a HSA-MIR-96 UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC