概括
基因 55676
象征 SLC30A6
同义词 MST103 | MSTP103 | Znt6
描述 Solute Carrier家族30成员6
参考 MIM:611148|HGNC:HGNC:19305|ENSEMBL:ENSG00000152683|HPRD:15368|Vega:Otthumg00000128456
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2P22.3
Pascal P值 0.433
胎儿β 0.672
DMG 1(#研究)
支持 离子平衡

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG22548000 2 32391035 SLC30A6 3.42e-9 -0.014 2.26E-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TPI1 0.90 0.85
ALKBH6 0.90 0.88
RHBDL1 0.86 0.86
MECR 0.86 0.85
ACOT8 0.86 0.84
PGP 0.85 0.86
DHRS7B 0.85 0.84
FDX1L 0.85 0.86
SH3GLB2 0.84 0.81
哈格 0.84 0.83
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
thoc2 -0.57 -0.60
KIAA1949 -0.56 -0.54
tubb2b -0.55 -0.59
Smurf2 -0.54 -0.53
RBMX2 -0.53 -0.64
SH3BP2 -0.53 -0.60
ZNF551 -0.53 -0.45
ZNF300 -0.53 -0.43
Tigd1 -0.53 -0.48
AC004017.1 -0.53 -0.46

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤复制编号 181 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕色髓样细胞的发育 165 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌DN 101 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿隆索转移 198 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应很晚 317 190 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1和SATB1 DN的Purbey目标 180 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因