基因页:SLC30A6
概括?
基因 | 55676 |
象征 | SLC30A6 |
同义词 | MST103 | MSTP103 | Znt6 |
描述 | Solute Carrier家族30成员6 |
参考 | MIM:611148|HGNC:HGNC:19305|ENSEMBL:ENSG00000152683|HPRD:15368|Vega:Otthumg00000128456 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2P22.3 |
Pascal P值 | 0.433 |
胎儿β | 0.672 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | 离子平衡 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG22548000 | 2 | 32391035 | SLC30A6 | 3.42e-9 | -0.014 | 2.26E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SLC30A6_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TPI1 | 0.90 | 0.85 |
ALKBH6 | 0.90 | 0.88 |
RHBDL1 | 0.86 | 0.86 |
MECR | 0.86 | 0.85 |
ACOT8 | 0.86 | 0.84 |
PGP | 0.85 | 0.86 |
DHRS7B | 0.85 | 0.84 |
FDX1L | 0.85 | 0.86 |
SH3GLB2 | 0.84 | 0.81 |
哈格 | 0.84 | 0.83 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
thoc2 | -0.57 | -0.60 |
KIAA1949 | -0.56 | -0.54 |
tubb2b | -0.55 | -0.59 |
Smurf2 | -0.54 | -0.53 |
RBMX2 | -0.53 | -0.64 |
SH3BP2 | -0.53 | -0.60 |
ZNF551 | -0.53 | -0.45 |
ZNF300 | -0.53 | -0.43 |
Tigd1 | -0.53 | -0.48 |
AC004017.1 | -0.53 | -0.46 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤复制编号 | 181 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕色髓样细胞的发育 | 165 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
等级结肠和直肠癌DN | 101 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿隆索转移 | 198 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MILI假足趋化性DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应很晚 | 317 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1和SATB1 DN的Purbey目标 | 180 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |