基因页:Yeats2
概括?
基因 | 55689 |
象征 | Yeats2 |
同义词 | - |
描述 | 包含2的Yeats域 |
参考 | MIM:613373|HGNC:HGNC:25489|ENSEMBL:ENSG00000163872|HPRD:07652|Vega:Otthumg00000156898 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3Q27.1 |
Pascal P值 | 0.029 |
Sherlock P值 | 0.133 |
胎儿β | 0.91 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG11368597 | 3 | 183415483 | Yeats2 | 1.21E-8 | -0.02 | 4.98E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/YEATS2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PDIA6 | 0.87 | 0.84 |
DHX40 | 0.86 | 0.82 |
C1orf124 | 0.86 | 0.80 |
AGPAT5 | 0.85 | 0.84 |
COPB2 | 0.85 | 0.82 |
FAM114A2 | 0.84 | 0.77 |
C1orf55 | 0.83 | 0.78 |
SMU1 | 0.83 | 0.78 |
TSN | 0.83 | 0.81 |
txnrd1 | 0.83 | 0.81 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.65 | -0.67 |
AF347015.21 | -0.64 | -0.62 |
AF347015.8 | -0.63 | -0.66 |
AF347015.33 | -0.63 | -0.65 |
AF347015.31 | -0.62 | -0.65 |
mt-cyb | -0.61 | -0.64 |
AF347015.27 | -0.61 | -0.63 |
FXYD1 | -0.60 | -0.64 |
AF347015.2 | -0.60 | -0.63 |
AF347015.15 | -0.59 | -0.63 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kim WT1靶向DN | 459 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
埃尔维奇缺氧 | 171 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DMOG的Elvidge缺氧 | 130 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Elvidge Hif1a靶向DN | 91 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Elvidge HIF1A和HIF2A靶向DN | 104 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌根源与基础 | 330 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌基础与仙女 | 330 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
杨乳腺癌ESR1 DN | 25 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath ES核心九相关 | 100 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌的生存率差A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smirnov对IR 2小时DN的响应 | 55 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |