概括
基因 5570
象征 PKIB
同义词 prkacn2
描述 蛋白激酶(依赖CAMP,催化)抑制剂β
参考 MIM:606914|HGNC:HGNC:9018|ENSEMBL:ENSG00000135549|HPRD:06075|Vega:Otthumg0000000015488
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6Q22.31
Pascal P值 0.024
胎儿β -2.387
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG03902233 6 122792987 PKIB; serinc1 1.358E-4 -0.338 0.031 DMG:Wockner_2014
CG20242210 6 122931702 PKIB 2.816E-4 -0.196 0.039 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1954436 CHR1 62248194 PKIB 5570 0.14 反式
RS13447530 CHR1 91983798 PKIB 5570 0.09 反式
RS17022378 CHR1 206654057 PKIB 5570 0.05 反式
RS6734526 CHR2 5616370 PKIB 5570 0.16 反式
RS6753473 CHR2 26526418 PKIB 5570 0.03 反式
RS17028363 CHR2 41913161 PKIB 5570 0 反式
RS16829545 CHR2 151977407 PKIB 5570 1.061E-40 反式
RS16841750 CHR2 158288461 PKIB 5570 2.226E-4 反式
RS16846743 CHR2 163321013 PKIB 5570 0.17 反式
RS16863816 CHR2 177292762 PKIB 5570 0.03 反式
RS7584986 CHR2 184111432 PKIB 5570 3.741E-6 反式
RS6741060 CHR2 217169088 PKIB 5570 0.01 反式
RS10183246 CHR2 237187882 PKIB 5570 0.05 反式
RS10195546 CHR2 237187933 PKIB 5570 0.15 反式
RS9810143 CHR3 5060209 PKIB 5570 2.828e-7 反式
RS6797307 CHR3 8601563 PKIB 5570 0 反式
RS4831224 CHR3 115754105 PKIB 5570 0.14 反式
RS6773248 CHR3 174790333 PKIB 5570 0.06 反式
RS6797728 CHR3 174790417 PKIB 5570 0.06 反式
RS12642340 CHR4 35390674 PKIB 5570 0.15 反式
SNP_A-1815771 0 PKIB 5570 0.02 反式
RS7654426 CHR4 86236933 PKIB 5570 0.2 反式
RS17008119 CHR4 125321425 PKIB 5570 0.02 反式
RS7692715 CHR4 125335209 PKIB 5570 0 反式
RS2183142 CHR4 159232695 PKIB 5570 0.09 反式
RS170776 CHR4 173276735 PKIB 5570 0.05 反式
RS1396222 CHR4 173279496 PKIB 5570 0.03 反式
RS335993 CHR4 173321789 PKIB 5570 0.09 反式
RS335980 CHR4 173329784 PKIB 5570 0.02 反式
RS335982 CHR4 173330945 PKIB 5570 0.08 反式
RS337984 CHR4 173411662 PKIB 5570 0.18 反式
RS4488887 CHR4 177695833 PKIB 5570 0.08 反式
RS10491487 CHR5 80323367 PKIB 5570 0.08 反式
RS10474151 CHR5 84286402 PKIB 5570 0 反式
RS13360496 0 PKIB 5570 0.01 反式
RS13191953 CHR6 24151042 PKIB 5570 0.01 反式
RS3789226 CHR6 24286501 PKIB 5570 0.1 反式
RS6907864 CHR6 24293323 PKIB 5570 0.17 反式
RS12196880 CHR6 24313746 PKIB 5570 0 反式
RS10806988 CHR6 24341768 PKIB 5570 0 反式
RS16890367 CHR6 38078448 PKIB 5570 9.85e-5 反式
RS12706918 CHR7 80266147 PKIB 5570 0.05 反式
RS7787830 CHR7 98797019 PKIB 5570 0.17 反式
RS6996695 CHR8 77540580 PKIB 5570 1.254E-4 反式
RS3118341 Chr9 25185518 PKIB 5570 0 反式
RS1126130 Chr9 25209346 PKIB 5570 0.06 反式
RS1998746 Chr9 25211761 PKIB 5570 0.06 反式
RS9406868 Chr9 25223372 PKIB 5570 9.538E-4 反式
RS11139334 Chr9 84209393 PKIB 5570 1.407E-4 反式
RS2393316 Chr10 59333070 PKIB 5570 0.03 反式
RS17124813 Chr10 110347464 PKIB 5570 0.08 反式
RS11061703 CHR12 1436977 PKIB 5570 0.09 反式
RS7972699 CHR12 105155290 PKIB 5570 0.06 反式
RS7488439 CHR12 105155814 PKIB 5570 0.02 反式
RS17036489 CHR12 105292283 PKIB 5570 0.01 反式
RS7337967 CHR13 53519044 PKIB 5570 0.02 反式
RS1530404 CHR13 64207519 PKIB 5570 0.1 反式
RS17289777 CHR13 64223062 PKIB 5570 0.1 反式
RS9989228 CHR14 37809252 PKIB 5570 0.04 反式
RS16955618 CHR15 29937543 PKIB 5570 1.22E-36 反式
RS2077735 CHR15 58479024 PKIB 5570 0.02 反式
RS9941296 CHR16 2759498 PKIB 5570 0.05 反式
RS16945437 CHR17 11797650 PKIB 5570 0.14 反式
RS4795850 CHR17 32383815 PKIB 5570 0.18 反式
RS4795851 CHR17 32384050 PKIB 5570 0.15 反式
RS1003837 CHR17 32453154 PKIB 5570 0.16 反式
RS11873184 CHR18 1584081 PKIB 5570 2.111E-4 反式
RS17681878 CHR18 34767223 PKIB 5570 0.07 反式
RS7274477 CHR20 1676942 PKIB 5570 0.01 反式
RS1041786 CHR21 22617710 PKIB 5570 2.129E-7 反式
RS16986332 Chrx 10958354 PKIB 5570 0.15 反式
RS16990575 Chrx 32691327 PKIB 5570 1.775E-4 反式
RS16993189 Chrx 144666166 PKIB 5570 0.02 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MAPK9 0.92 0.89
IQWD1 0.91 0.90
NAPB 0.91 0.90
ATP6V1C1 0.90 0.89
IDH3A 0.90 0.90
Gabra1 0.90 0.92
NSF 0.90 0.88
Glrb 0.90 0.86
PAK1 0.90 0.85
OXR1 0.89 0.91
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Bcl7c -0.46 -0.54
透明2 -0.42 -0.42
SH2D2A -0.42 -0.45
SH3BP2 -0.41 -0.44
anp32c -0.41 -0.41
NME4 -0.41 -0.53
SLC38A5 -0.40 -0.45
CLEC3B -0.39 -0.46
AF347015.18 -0.39 -0.18
FADS2 -0.39 -0.32

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004862 cAMP依赖性蛋白激酶抑制剂活性 IEA -
去:0004860 蛋白激酶抑制剂活性 IEA -
去:0016301 激酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006469 蛋白激酶活性的负调控 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期DN 367 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 16D的Takeda目标 175 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1和HDAC2靶向DN 232 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC2靶向DN 133 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
剑麻结肠直肠腺瘤DN 291 176 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林格伦膀胱癌群集3 329 196 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM5 94 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
威廉姆斯ESR1瞄准 26 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UEDA中央时钟 88 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏没有血液 222 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性4 307 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh他莫昔芬抵抗DN 258 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
iwanaga癌变由Kras Pten Up 181 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼(Hoffmann 75 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼大到小的BII淋巴细胞DN 72 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时 229 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时 324 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 211 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因