基因页:PKIB
概括?
基因 | 5570 |
象征 | PKIB |
同义词 | prkacn2 |
描述 | 蛋白激酶(依赖CAMP,催化)抑制剂β |
参考 | MIM:606914|HGNC:HGNC:9018|ENSEMBL:ENSG00000135549|HPRD:06075|Vega:Otthumg0000000015488 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6Q22.31 |
Pascal P值 | 0.024 |
胎儿β | -2.387 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG03902233 | 6 | 122792987 | PKIB; serinc1 | 1.358E-4 | -0.338 | 0.031 | DMG:Wockner_2014 |
CG20242210 | 6 | 122931702 | PKIB | 2.816E-4 | -0.196 | 0.039 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1954436 | CHR1 | 62248194 | PKIB | 5570 | 0.14 | 反式 | ||
RS13447530 | CHR1 | 91983798 | PKIB | 5570 | 0.09 | 反式 | ||
RS17022378 | CHR1 | 206654057 | PKIB | 5570 | 0.05 | 反式 | ||
RS6734526 | CHR2 | 5616370 | PKIB | 5570 | 0.16 | 反式 | ||
RS6753473 | CHR2 | 26526418 | PKIB | 5570 | 0.03 | 反式 | ||
RS17028363 | CHR2 | 41913161 | PKIB | 5570 | 0 | 反式 | ||
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | PKIB | 5570 | 1.061E-40 | 反式 | ||
RS16841750 | CHR2 | 158288461 | PKIB | 5570 | 2.226E-4 | 反式 | ||
RS16846743 | CHR2 | 163321013 | PKIB | 5570 | 0.17 | 反式 | ||
RS16863816 | CHR2 | 177292762 | PKIB | 5570 | 0.03 | 反式 | ||
RS7584986 | CHR2 | 184111432 | PKIB | 5570 | 3.741E-6 | 反式 | ||
RS6741060 | CHR2 | 217169088 | PKIB | 5570 | 0.01 | 反式 | ||
RS10183246 | CHR2 | 237187882 | PKIB | 5570 | 0.05 | 反式 | ||
RS10195546 | CHR2 | 237187933 | PKIB | 5570 | 0.15 | 反式 | ||
RS9810143 | CHR3 | 5060209 | PKIB | 5570 | 2.828e-7 | 反式 | ||
RS6797307 | CHR3 | 8601563 | PKIB | 5570 | 0 | 反式 | ||
RS4831224 | CHR3 | 115754105 | PKIB | 5570 | 0.14 | 反式 | ||
RS6773248 | CHR3 | 174790333 | PKIB | 5570 | 0.06 | 反式 | ||
RS6797728 | CHR3 | 174790417 | PKIB | 5570 | 0.06 | 反式 | ||
RS12642340 | CHR4 | 35390674 | PKIB | 5570 | 0.15 | 反式 | ||
SNP_A-1815771 | 0 | PKIB | 5570 | 0.02 | 反式 | |||
RS7654426 | CHR4 | 86236933 | PKIB | 5570 | 0.2 | 反式 | ||
RS17008119 | CHR4 | 125321425 | PKIB | 5570 | 0.02 | 反式 | ||
RS7692715 | CHR4 | 125335209 | PKIB | 5570 | 0 | 反式 | ||
RS2183142 | CHR4 | 159232695 | PKIB | 5570 | 0.09 | 反式 | ||
RS170776 | CHR4 | 173276735 | PKIB | 5570 | 0.05 | 反式 | ||
RS1396222 | CHR4 | 173279496 | PKIB | 5570 | 0.03 | 反式 | ||
RS335993 | CHR4 | 173321789 | PKIB | 5570 | 0.09 | 反式 | ||
RS335980 | CHR4 | 173329784 | PKIB | 5570 | 0.02 | 反式 | ||
RS335982 | CHR4 | 173330945 | PKIB | 5570 | 0.08 | 反式 | ||
RS337984 | CHR4 | 173411662 | PKIB | 5570 | 0.18 | 反式 | ||
RS4488887 | CHR4 | 177695833 | PKIB | 5570 | 0.08 | 反式 | ||
RS10491487 | CHR5 | 80323367 | PKIB | 5570 | 0.08 | 反式 | ||
RS10474151 | CHR5 | 84286402 | PKIB | 5570 | 0 | 反式 | ||
RS13360496 | 0 | PKIB | 5570 | 0.01 | 反式 | |||
RS13191953 | CHR6 | 24151042 | PKIB | 5570 | 0.01 | 反式 | ||
RS3789226 | CHR6 | 24286501 | PKIB | 5570 | 0.1 | 反式 | ||
RS6907864 | CHR6 | 24293323 | PKIB | 5570 | 0.17 | 反式 | ||
RS12196880 | CHR6 | 24313746 | PKIB | 5570 | 0 | 反式 | ||
RS10806988 | CHR6 | 24341768 | PKIB | 5570 | 0 | 反式 | ||
RS16890367 | CHR6 | 38078448 | PKIB | 5570 | 9.85e-5 | 反式 | ||
RS12706918 | CHR7 | 80266147 | PKIB | 5570 | 0.05 | 反式 | ||
RS7787830 | CHR7 | 98797019 | PKIB | 5570 | 0.17 | 反式 | ||
RS6996695 | CHR8 | 77540580 | PKIB | 5570 | 1.254E-4 | 反式 | ||
RS3118341 | Chr9 | 25185518 | PKIB | 5570 | 0 | 反式 | ||
RS1126130 | Chr9 | 25209346 | PKIB | 5570 | 0.06 | 反式 | ||
RS1998746 | Chr9 | 25211761 | PKIB | 5570 | 0.06 | 反式 | ||
RS9406868 | Chr9 | 25223372 | PKIB | 5570 | 9.538E-4 | 反式 | ||
RS11139334 | Chr9 | 84209393 | PKIB | 5570 | 1.407E-4 | 反式 | ||
RS2393316 | Chr10 | 59333070 | PKIB | 5570 | 0.03 | 反式 | ||
RS17124813 | Chr10 | 110347464 | PKIB | 5570 | 0.08 | 反式 | ||
RS11061703 | CHR12 | 1436977 | PKIB | 5570 | 0.09 | 反式 | ||
RS7972699 | CHR12 | 105155290 | PKIB | 5570 | 0.06 | 反式 | ||
RS7488439 | CHR12 | 105155814 | PKIB | 5570 | 0.02 | 反式 | ||
RS17036489 | CHR12 | 105292283 | PKIB | 5570 | 0.01 | 反式 | ||
RS7337967 | CHR13 | 53519044 | PKIB | 5570 | 0.02 | 反式 | ||
RS1530404 | CHR13 | 64207519 | PKIB | 5570 | 0.1 | 反式 | ||
RS17289777 | CHR13 | 64223062 | PKIB | 5570 | 0.1 | 反式 | ||
RS9989228 | CHR14 | 37809252 | PKIB | 5570 | 0.04 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | PKIB | 5570 | 1.22E-36 | 反式 | ||
RS2077735 | CHR15 | 58479024 | PKIB | 5570 | 0.02 | 反式 | ||
RS9941296 | CHR16 | 2759498 | PKIB | 5570 | 0.05 | 反式 | ||
RS16945437 | CHR17 | 11797650 | PKIB | 5570 | 0.14 | 反式 | ||
RS4795850 | CHR17 | 32383815 | PKIB | 5570 | 0.18 | 反式 | ||
RS4795851 | CHR17 | 32384050 | PKIB | 5570 | 0.15 | 反式 | ||
RS1003837 | CHR17 | 32453154 | PKIB | 5570 | 0.16 | 反式 | ||
RS11873184 | CHR18 | 1584081 | PKIB | 5570 | 2.111E-4 | 反式 | ||
RS17681878 | CHR18 | 34767223 | PKIB | 5570 | 0.07 | 反式 | ||
RS7274477 | CHR20 | 1676942 | PKIB | 5570 | 0.01 | 反式 | ||
RS1041786 | CHR21 | 22617710 | PKIB | 5570 | 2.129E-7 | 反式 | ||
RS16986332 | Chrx | 10958354 | PKIB | 5570 | 0.15 | 反式 | ||
RS16990575 | Chrx | 32691327 | PKIB | 5570 | 1.775E-4 | 反式 | ||
RS16993189 | Chrx | 144666166 | PKIB | 5570 | 0.02 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PKIB_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MAPK9 | 0.92 | 0.89 |
IQWD1 | 0.91 | 0.90 |
NAPB | 0.91 | 0.90 |
ATP6V1C1 | 0.90 | 0.89 |
IDH3A | 0.90 | 0.90 |
Gabra1 | 0.90 | 0.92 |
NSF | 0.90 | 0.88 |
Glrb | 0.90 | 0.86 |
PAK1 | 0.90 | 0.85 |
OXR1 | 0.89 | 0.91 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Bcl7c | -0.46 | -0.54 |
透明2 | -0.42 | -0.42 |
SH2D2A | -0.42 | -0.45 |
SH3BP2 | -0.41 | -0.44 |
anp32c | -0.41 | -0.41 |
NME4 | -0.41 | -0.53 |
SLC38A5 | -0.40 | -0.45 |
CLEC3B | -0.39 | -0.46 |
AF347015.18 | -0.39 | -0.18 |
FADS2 | -0.39 | -0.32 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004862 | cAMP依赖性蛋白激酶抑制剂活性 | IEA | - | |
去:0004860 | 蛋白激酶抑制剂活性 | IEA | - | |
去:0016301 | 激酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006469 | 蛋白激酶活性的负调控 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌早期DN | 367 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 16D的Takeda目标 | 175 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC1和HDAC2靶向DN | 232 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC2靶向DN | 133 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
剑麻结肠直肠腺瘤DN | 291 | 176 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林格伦膀胱癌群集3 | 329 | 196 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM5 | 94 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
威廉姆斯ESR1瞄准 | 26 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
狮子转移 | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
UEDA中央时钟 | 88 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏没有血液 | 222 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性4 | 307 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh他莫昔芬抵抗DN | 258 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
iwanaga癌变由Kras Pten Up | 181 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍夫曼(Hoffmann | 75 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍夫曼大到小的BII淋巴细胞DN | 72 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应6小时 | 229 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应24小时 | 324 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 | 211 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 | 281 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |