基因页面:MAP7D1
总结吗?
GeneID | 55700年 |
象征 | MAP7D1 |
同义词 | PARCC1 | RPRC1 |
描述 | MAP7域包含1 |
参考 | HGNC: HGNC: 25514|运用:ENSG00000116871|HPRD: 07666|织女:OTTHUMG00000007714 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 1 p34.3 |
帕斯卡假定值 | 4.422 e-5 |
夏洛克假定值 | 0.999 |
支持 | CompositeSet 达内尔FMRP目标 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MAP7D1_DE_GTEx.png)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TRIM39 | 0.96 | 0.95 |
LSM7 | 0.91 | 0.93 |
RPL36 | 0.91 | 0.85 |
RPS15P5 | 0.90 | 0.85 |
PQBP1 | 0.90 | 0.91 |
POLR2F | 0.90 | 0.87 |
RPL28 | 0.90 | 0.83 |
RPL8 | 0.89 | 0.90 |
MYL6 | 0.89 | 0.87 |
MRPS34 | 0.89 | 0.87 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ABCB1 | -0.58 | -0.67 |
AF347015.27 | -0.57 | -0.72 |
AF347015.33 | -0.57 | -0.71 |
AF347015.15 | -0.57 | -0.74 |
AF347015.26 | -0.56 | -0.76 |
ABCG2 | -0.56 | -0.63 |
MT-CYB | -0.56 | -0.72 |
AF347015.8 | -0.56 | -0.72 |
EPB41L2 | -0.56 | -0.66 |
PTPRB | -0.55 | -0.62 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS间充质DN | 460年 | 312年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN UDAYAKUMAR MED1目标 | 240年 | 171年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由阿霉素GRAESSMANN细胞凋亡 | 1142年 | 669年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
LASTOWSKA神经母细胞瘤拷贝数DN | 800年 | 473年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
魏MYCN目标与E箱 | 795年 | 478年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
里克曼肿瘤分化和管理不善的DN | 382年 | 224年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SCHAEFFER前列腺癌发展6小时DN | 514年 | 330年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
《图片报》极品致癌签名 | 261年 | 166年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
黄达沙替尼耐了 | 81年 | 53 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
甜蜜的肺癌喀斯特DN | 435年 | 289年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN FORTSCHEGGER PHF8目标 | 784年 | 464年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
冯氏TNF通过P38完成响应 | 227年 | 151年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
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UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir - 101 | 330年 | 336年 | 1 | hsa - mir - 101 | UACAGUACUGUGAUAACUGAAG |
miR-141/200a | 538年 | 545年 | 1、m8 | hsa - mir - 141 | UAACACUGUCUGGUAAAGAUGG |
hsa - mir - 200 a | UAACACUGUCUGGUAACGAUGU | ||||
mir - 144 | 329年 | 336年 | 1、m8 | hsa - mir - 144 | UACAGUAUAGAUGAUGUACUAG |
miR-18 | 141年 | 148年 | 1、m8 | hsa-miR-18a | UAAGGUGCAUCUAGUGCAGAUA |
hsa-miR-18b | UAAGGUGCAUCUAGUGCAGUUA | ||||
miR-23 | 323年 | 329年 | 1 | hsa-miR-23a大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC |
hsa-miR-23b大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUACC |