基因页:hhat
概括?
基因 | 55733 |
象征 | hhat |
同义词 | mart2 | ski1 | skn |
描述 | 刺猬酰基转移酶 |
参考 | MIM:605743|HGNC:HGNC:18270|Ensembl:ENSG00000054392|HPRD:12041|Vega:Otthumg0000000036447 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1q32 |
胎儿β | -1.271 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 皮质 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG21147040 | 1 | 210655903 | hhat | 1.479E-4 | -0.639 | 0.032 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17029291 | CHR3 | 32402138 | hhat | 55733 | 7.944e-6 | 反式 | ||
RS16958358 | CHR17 | 55502410 | hhat | 55733 | 0.07 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/HHAT_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
mpp7 | 0.60 | 0.62 |
EPB41L4B | 0.59 | 0.56 |
diras2 | 0.58 | 0.59 |
Plekha1 | 0.58 | 0.52 |
Mkx | 0.58 | 0.52 |
nipal2 | 0.57 | 0.52 |
NLK | 0.57 | 0.59 |
TMEM155 | 0.57 | 0.55 |
FGFR1OP2 | 0.56 | 0.55 |
RIMS2 | 0.56 | 0.53 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
EFEMP2 | -0.34 | -0.39 |
SEMA4B | -0.31 | -0.30 |
metrnl | -0.29 | -0.38 |
pde9a | -0.29 | -0.32 |
WDR86 | -0.29 | -0.31 |
emid1 | -0.29 | -0.31 |
AC006028.3 | -0.28 | -0.31 |
cdc42ep4 | -0.28 | -0.30 |
sigirr | -0.28 | -0.33 |
SMTN | -0.28 | -0.32 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID刺猬2 Pathway | 22 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇3 DN | 229 | 142 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和血清剥夺的反应 | 211 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌基础与仙女 | 330 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标 | 212 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vantveer乳腺癌ESR1 UP | 167 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌子类CTNNB1 UP | 176 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Keshelava多种耐药性 | 88 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pedrioli mir31靶向DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Durand Stroma ns | 162 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |