基因页：prkar2A
概括?
| 基因ID | 5576 |
| Symbol | prkar2A |
| 同义词 | PKR2|PRKAR2 |
| 描述 | 蛋白激酶cAMP依赖性II型调节亚基α |
| 参考 | MIM：176910|HGNC:HGNC:9391|Ensembl：ENSG00000114302|HPRD:01484|Vega：Otthumg00000133540 |
| 基因type | protein-coding |
| 地图位置 | 3P21.3-P21.2 |
| Pascal P值 | 0.021 |
| Fetal beta | 1.025 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 支持 | canabinoid DOPAMINE 细胞内信号转导 SEROTONIN G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET |
数据源中的基因
| 基因set name | 基因组方法 | 描述 | Info |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG:Wockner_2014 | Genome-wide DNA methylation analysis | This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24). | 1 |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | Contribution to shortest path in PPI network: 0.0096 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | Chromosome | Position | 最近的基因 | P (dis) | beta（dis） | FDR (dis) | Study |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG22934568 | 3 | 48884614 | prkar2A | 4.48E-4 | -0.278 | 0.045 | DMG:Wockner_2014 |
Section II. Transcriptome annotation
基因ral gene expression (GTEx)
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
Top co-expressed genes in brain regions
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| NCBP1 | 0.90 | 0.89 |
| WDR3 | 0.89 | 0.90 |
| Zmym4 | 0.89 | 0.90 |
| CTDSPL2 | 0.89 | 0.91 |
| CAND1 | 0.89 | 0.89 |
| scyl2 | 0.89 | 0.90 |
| KIAA1430 | 0.89 | 0.90 |
| IPO5 | 0.89 | 0.89 |
| NUDT21 | 0.89 | 0.89 |
| VEZT | 0.89 | 0.90 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-CO2 | -0.73 | -0.83 |
| AF347015.33 | -0.72 | -0.83 |
| FXYD1 | -0.72 | -0.84 |
| HLA-F | -0.71 | -0.79 |
| AF347015.31 | -0.71 | -0.81 |
| MT-CYB | -0.70 | -0.81 |
| AIFM3 | -0.70 | -0.77 |
| hepn1 | -0.70 | -0.78 |
| AF347015.8 | -0.70 | -0.82 |
| AF347015.27 | -0.69 | -0.81 |
Section III. Gene Ontology annotation
| Molecular function | GO term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| GO:0008603 | cAMP-dependent protein kinase regulator activity | IEA | - | |
| GO:0008603 | cAMP-dependent protein kinase regulator activity | NAS | 9003463 | |
| GO:0016301 | 激酶活性 | IEA | - | |
| GO:0030552 | 营地约束 | IEA | - | |
| Biological process | GO term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
| 去：0001932 | 调节蛋白氨基酸磷酸化 | IEA | - | |
| 去：0007165 | signal transduction | IEA | - | |
| GO:0009755 | hormone-mediated signaling | EXP | 12626323 | |
| 细胞分量 | GO term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
| GO:0005624 | 膜分数 | 塔斯 | 10799517 | |
| GO:0005737 | 细胞质 | 塔斯 | 10799517 | |
| 去：0005952 | cAMP-dependent protein kinase complex | IEA | - | |
| GO:0005886 | 质膜 | 塔斯 | 10799517 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| Interactors | Aliases B | Official full name B | Experimental | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| AKAP1 | AKAP | AKAP121 | AKAP149 | AKAP84 | D-AKAP1 | MGC1807 | PRKA1 | SAKAP84 | 激酶（PRKA）锚蛋白1 | - | HPRD | 9065479|10764601 |
| AKAP1 | AKAP | AKAP121 | AKAP149 | AKAP84 | D-AKAP1 | MGC1807 | PRKA1 | SAKAP84 | 激酶（PRKA）锚蛋白1 | 远西方 Reconstituted Complex |
BioGRID | 10413680|10764601 |
| AKAP10 | D-AKAP2 | MGC9414 | PRKA10 | 激酶（PRKA）锚蛋白10 | - | HPRD | 9326583 |
| AKAP11 | AKAP220| DKFZp781I12161 | FLJ11304 | KIAA0629 | PRKA11 | 激酶（PRKA）锚蛋白11 | - | HPRD，Biogrid | 8621616 |
| AKAP12 | AKAP250 | DKFZp686M0430 | DKFZp686O0331 | FLJ20945 | FLJ97621 | 激酶（PRKA）锚蛋白12 | - | HPRD，Biogrid | 11316952 |
| AKAP13 | AKAP-Lbc | BRX | FLJ11952 | FLJ43341 | HA-3 | Ht31 | LBC | PROTO-LB | PROTO-LBC | c-lbc | 激酶（PRKA）锚蛋白13 | - | HPRD | 1618839|7929081 |
| AKAP13 | AKAP-Lbc | BRX | FLJ11952 | FLJ43341 | HA-3 | Ht31 | LBC | PROTO-LB | PROTO-LBC | c-lbc | 激酶（PRKA）锚蛋白13 | - | HPRD，Biogrid | 12672969 |
| AKAP14 | AKAP28 | 激酶（PRKA）锚蛋白14 | - | HPRD，Biogrid | 12475942 |
| AKAP2 | AKAPKL | FLJ53197 | PALM2 | PRKA2 | 激酶（PRKA）锚蛋白2 | 远西方 Protein-peptide Reconstituted Complex |
BioGRID | 9497389|12672969 |
| AKAP3 | AKAP110 | FSP95 | PRKA3 | SOB1 | 激酶（PRKA）锚蛋白3 | - | HPRD，Biogrid | 10319321|11278869 |11696326 |
| AKAP4 | AKAP82 | FSC1 | HI | hAKAP82 | p82 | 激酶（PRKA）锚蛋白4 | Reconstituted Complex | BioGRID | 9852104 |
| AKAP5 | AKAP75 |AKAP79 |H21 | 激酶（PRKA）锚蛋白5 | - | HPRD，Biogrid | 12672969 |
| AKAP6 | ADAP100 |ADAP6 |AKAP100 |KIAA0311 |MGC165020 |prka6 |makap | 激酶（PRKA）锚蛋白6 | - | HPRD | 10413680 |
| AKAP6 | ADAP100 |ADAP6 |AKAP100 |KIAA0311 |MGC165020 |prka6 |makap | 激酶（PRKA）锚蛋白6 | Protein-peptide | BioGRID | 12672969 |
| AKAP7 | AKAP18 | 激酶（PRKA）锚蛋白7 | - | HPRD，Biogrid | 12672969 |
| AKAP8 | AKAP95 |DKFZP586B1222 | 激酶（PRKA）锚蛋白8 | - | HPRD，Biogrid | 9473338|10601332 |
| AKAP9 | AKAP350 |AKAP450 |cg-nap |Hyperion |KIAA0803 |MU-RMS-40.16A |prka9 |Yotiao | A kinase (PRKA) anchor protein (yotiao) 9 | - | HPRD，Biogrid | 10358086 |
| AKAP9 | AKAP350 |AKAP450 |cg-nap |Hyperion |KIAA0803 |MU-RMS-40.16A |prka9 |Yotiao | A kinase (PRKA) anchor protein (yotiao) 9 | - | HPRD | 10358086|11799244 |
| arfgef2 | BIG2 | FLJ23723 | dJ1164I10.1 | ADP-核糖基化因子鸟嘌呤核苷酸 - 交换因子2（Brefeldin A抑制） | Reconstituted Complex 两个杂交 |
BioGRID | 12571360 |
| CBFA2T3 | ETO2 |MTG16 |mtgr2 |zmynd4 | core-binding factor, runt domain, alpha subunit 2; translocated to, 3 | - | HPRD，Biogrid | 11823486 |
| CFTR | ABC35 |ABCC7 |CF |CFTR/MRP |MRP7 |TNR-CFTR |DJ760C5.1 | 囊性纤维化跨膜电导调节剂（ATP结合盒子亚家族C，成员7） | PKA II与CFTR相互作用并磷酸化。 | BIND | 10799517 |
| EZR | cvil |CVL |DKFZP762H157 |FLJ26216 |MGC1584 |vil2 | ezrin | PKA II interacts with Ezrin. | BIND | 9009265|10799517 |12080047 |
| GNA13 | G13 |MGC46138 | 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白（G蛋白），α13 | Affinity Capture-Western | BioGRID | 11696326 |
| GSK3B | - | glycogen synthase kinase 3 beta | Affinity Capture-Western | BioGRID | 12147701 |
| KCNQ1 | ATFB1 |FLJ26167 |JLNS1 |kcna8 |KCNA9 |KVLQT1 |KV1.9 |KV7.1 |LQT |LQT1 | RWS | SQT2 | WRS | potassium voltage-gated channel, KQT-like subfamily, member 1 | Affinity Capture-Western | BioGRID | 11799244 |
| MYCBPAP | AMAP-1 |Amap1 |DKFZP434N1415 | MYCBP associated protein | - | HPRD | 12151104 |
| NBEA | bcl8b |lyst2 | neurobeachin | - | HPRD | 11102458 |
| PALM2-AKAP2 | AKAP2 |DKFZP686H1948 | PALM2-AKAP2读取笔录 | - | HPRD | 9497389|12672969 |
| PDE4A | DPDE2 | PDE4 | PDE46 | phosphodiesterase 4A, cAMP-specific (phosphodiesterase E2 dunce homolog, Drosophila) | Affinity Capture-Western | BioGRID | 11296225 |
| prkar2A | MGC3606 |PKR2 |prkar2 | 蛋白激酶，cAMP依赖性，调节性，II型，α | PKA形成二聚体。这种相互作用是在鼠标PKA（PDB ID：1L6E_B）和鼠标PKA（PDB ID：1L6E_A）之间的相互作用上建模的。 | BIND | 9295304|10074940 |11985580 |
| RAB32 | - | Rab32，成员Ras Oncogene家族 | 远西方 Protein-peptide 两个杂交 |
BioGRID | 12186851|12672969 |
| RUNX1T1 | AML1T1 |CBFA2T1 |CDR |Eto |MGC2796 |mtg8 |mtg8b |zmynd2 | runt-related transcription factor 1; translocated to, 1 (cyclin D-related) | - | HPRD，Biogrid | 11593431 |
| RYR2 | ARVC2 | ARVD2 | VTSIP | ryanodine受体2（心脏） | - | HPRD，Biogrid | 10830164 |
| WASF1 | FLJ31482 |KIAA0269 |Scar1 |波|Wave1 | 是蛋白质家族，成员1 | WAVE-1 interacts with PKA. | BIND | 10970852 |
V.途径注释
| Pathway name | Pathway size | ＃szgr 2.0基因 | Info |
|---|---|---|---|
| kegg凋亡 | 88 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG胰岛素信号通路 | 137 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA NO1 PATHWAY | 33 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA CSK PATHWAY | 24 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA AKAP95 PATHWAY | 12 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA AGPCR PATHWAY | 13 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta CFTR途径 | 12 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta GATA3途径 | 16 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA MPR PATHWAY | 34 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta McAlpain途径 | 25 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta PPARA途径 | 58 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta IGF1R途径 | 23 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA VIP PATHWAY | 29 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta NFAT途径 | 56 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta NOS1途径 | 24 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA PLCE PATHWAY | 12 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA AKAPCENTROSOME PATHWAY | 15 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA CHREBP2 PATHWAY | 42 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA坏途径 | 26 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta CK1途径 | 17 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA DREAM PATHWAY | 14 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA AKAP13 PATHWAY | 12 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA GPCR PATHWAY | 37 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA SHH PATHWAY | 16 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta Stathmin Pathway | 19 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA CREB PATHWAY | 27 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA CARM1 PATHWAY | 13 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NGF的Reactome信号传导 | 217 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome DAG和IP3信令 | 32 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ERBB2的Reactome信号传导 | 101 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME SIGNALING BY EGFR IN CANCER | 109 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome NGF信号通过TRKA从质膜发出 | 137 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FGFR在疾病中的反应组信号传导 | 127 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME集成OF ENERGY METABOLISM | 120 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME OPIOID SIGNALLING | 78 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome CA依赖性事件 | 30 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME DARPP 32 EVENTS | 25 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome PLC Beta介导的事件 | 43 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome PKA介导的CREB磷酸化 | 18 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME TRANSMEMBRANE TRANSPORT OF SMALL MOLECULES | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 代谢调节中的反应组胰高血糖素信号传导 | 34 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PDGF的Reactome信号传导 | 122 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome下游信号转导 | 95 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 胰岛素分泌的反应组调节BY GLUCAGON LIKE PEPTIDE1 | 43 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 胰岛素分泌的反应组调节 | 93 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome的下游信号传导激活的FGFR | 100 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME PHOSPHOLIPASE C MEDIATED CASCADE | 54 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Aquaporin介导的运输 | 51 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME REGULATION OF WATER BALANCE BY RENAL AQUAPORINS | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME FACTORS INVOLVED IN MEGAKARYOCYTE DEVELOPMENT AND PLATELET PRODUCTION | 132 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME SIGNALING BY FGFR | 112 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FULCHER INFLAMMATORY RESPONSE LECTIN VS LPS DN | 463 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rashi对电离辐射4的响应4 | 61 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MARTORIATI MDM4 TARGETS FETAL LIVER DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过ELK3 UP总缺氧 | 209 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 约瑟夫对丁酸钠DN的反应 | 64 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SU TESTIS | 76 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MITSIADES RESPONSE TO APLIDIN DN | 249 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BONCI TARGETS OF MIR15A AND MIR16 1 | 91 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Firestein增殖 | 175 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hofmann骨髓增生综合征高风险 | 10 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染4小时DN | 254 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PILON KLF1 TARGETS UP | 504 | 321 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BRUINS UVC RESPONSE LATE | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GOBERT OLIGODENDROCYTE DIFFERENTIATION DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PLASARI TGFB1 TARGETS 10HR UP | 199 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| miRNA family | 目标位置 | mirna id | miRNA seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR start | UTR end | Match method | |||
| mir-149 | 842 | 848 | m8 | hsa-miR-149脑 | UCUGGCUCCGUGUCUUCACUCC |
| mir-15/16/195/424/497 | 341 | 348 | 1a,m8 | hsa-miR-15a脑 | UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG |
| HSA-MIR-16脑 | uagcagcacguaaauauuggcg | ||||
| hsa-miR-15b脑 | uagcagcacaucaugguuaca | ||||
| hsa-miR-195SZ | UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC | ||||
| HSA-MIR-424 | Cagcagcaauucauguuuugaa | ||||
| hsa-miR-497 | CAGCAGCACACUGUGGUUUGU | ||||
| mir-185 | 278 | 285 | 1a,m8 | hsa-miR-185脑 | Uggagaaaggcaguuc |
| mir-378* | 307 | 314 | 1a,m8 | HSA-MIR-422B | cuggacuuggagagaaggcc |
| HSA-MIR-422A | cuggacuagggucagaaggcc | ||||
| miR-503 | 342 | 348 | 1a | HSA-MIR-503 | uagcagcgggaacaguucugcag |
| miR-504 | 846 | 852 | m8 | HSA-MIR-504 | AGACCCUGGUCUGCACUCUAU |