基因页:ngly1
概括?
基因 | 55768 |
象征 | ngly1 |
同义词 | CDDG | CDG1V | PNG1 | PNGase |
描述 | n-糖果酶1 |
参考 | MIM:610661|HGNC:HGNC:17646|Ensembl:ENSG00000151092|HPRD:10118|Vega:Otthumg00000155600 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3P24.2 |
Pascal P值 | 0.029 |
Sherlock P值 | 0.231 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.006 | |
表达 | 基因表达的荟萃分析 | p价值:1.638 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NGLY1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ctnnd2 | 0.81 | 0.74 |
TMEM167B | 0.81 | 0.76 |
NDRG1 | 0.81 | 0.77 |
GPD1L | 0.80 | 0.76 |
HERC3 | 0.80 | 0.74 |
nnt | 0.80 | 0.75 |
FAM124A | 0.79 | 0.74 |
MARS2 | 0.79 | 0.77 |
RP1-21O18.1 | 0.79 | 0.77 |
WASF1 | 0.79 | 0.70 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.62 | -0.62 |
C11orf67 | -0.58 | -0.58 |
MT-CO2 | -0.58 | -0.58 |
AF347015.8 | -0.55 | -0.55 |
鼻孔 | -0.55 | -0.53 |
GNG11 | -0.55 | -0.52 |
AC098691.2 | -0.54 | -0.55 |
AF347015.27 | -0.54 | -0.55 |
AF347015.31 | -0.54 | -0.54 |
AL138743.2 | -0.54 | -0.52 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
GO:0000224 | 肽-N4-(N-乙酰β-葡萄糖胺基)天冬酰胺酰胺酶活性 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 15358861 | |
GO:0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006516 | 糖蛋白分解代谢过程 | 艾达 | 15358861 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005737 | 细胞质 | 艾达 | 15358861 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
钟对偶氮丁丁和TSA DN的反应 | 70 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘vmyb的目标 | 127 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王对雄激素的反应 | 29 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王对福斯科林的反应 | 23 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ingram SHH目标 | 127 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HADDAD B淋巴细胞祖细胞 | 293 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1定位DN的Alcalay AML | 184 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向DN | 314 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
抗原演示中的pellicciotta HDAC DN | 49 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mitsiades对aplidin DN的反应 | 249 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝脏发展DN | 222 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG结合了36小时 | 29 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA ECM监管机构 | 238 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |