基因页面:LMBRD1
总结吗?
GeneID | 55788年 |
象征 | LMBRD1 |
同义词 | 内西C6orf209 | LMBD1 | MAHCF | |
描述 | LMBR1域包含1 |
参考 | MIM: 612625|HGNC: HGNC: 23038|运用:ENSG00000168216|HPRD: 12877|织女:OTTHUMG00000014985 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 6个问题 |
帕斯卡假定值 | 0.022 |
夏洛克假定值 | 0.003 |
胎儿β | -0.72 |
DMG | 2(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 2 |
DMG: Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了DNA的甲基化概要首发精神分裂症患者外周血细胞从18岁(FESZ)和15名正常对照组。 | 2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg10796979 | 6 | 70506998 | LMBRD1 | -0.022 | 0.46 | DMG: Nishioka_2013 | |
cg10796979 | 6 | 70506998 | LMBRD1 | 8.08 e-11 | -0.016 | 4.34 e - | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs1570589 | chr9 | 116874354 | LMBRD1 | 55788年 | 0.1 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/LMBRD1_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
王LMO4目标了 | 372年 | 227年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
沈SMARCA2目标了 | 424年 | 268年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
崔TCF21目标2 DN | 830年 | 547年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
山崎TCEB3目标了 | 175年 | 116年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CREIGHTON内分泌治疗抵抗3 | 720年 | 440年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
研究包括 | 420年 | 269年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米利伪足趋化性DN | 457年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
蒙特罗甲状腺癌穷人生存DN | 11 | 6 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DUTERTRE雌二醇响应24小时DN | 505年 | 328年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
通过AKT1 DN BHAT ESR1目标 | 82年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
棕熊短波紫外线反应早期晚了 | 317年 | 190年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GOBERT少突细胞分化DN | 1080年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
若林史江脂肪生成PPARG RXRA 36小时 | 152年 | 88年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
若林史江脂肪生成PPARG RXRA 8 d | 882年 | 506年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |