基因页:depdc1b
概括?
基因 | 55789 |
象征 | depdc1b |
同义词 | BRCC3 | XTP1 |
描述 | 包含1B的DEP域 |
参考 | MIM:616073|HGNC:HGNC:24902|Ensembl:ENSG0000000035499|HPRD:16794|Vega:Otthumg0000000097083 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 5q12.1 |
Pascal P值 | 0.001 |
主持人 | 小脑 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DEPDC1B_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PROM1 | 0.79 | 0.73 |
L3MBTL3 | 0.76 | 0.74 |
CCBE1 | 0.75 | 0.70 |
rasgef1c | 0.75 | 0.72 |
THSD7B | 0.74 | 0.74 |
MDGA1 | 0.74 | 0.75 |
AC079953.2 | 0.74 | 0.79 |
lphn3 | 0.73 | 0.78 |
nkain2 | 0.73 | 0.83 |
axin2 | 0.72 | 0.73 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.56 | -0.64 |
MT-CO2 | -0.55 | -0.63 |
HSD17B14 | -0.53 | -0.61 |
ifi27 | -0.52 | -0.60 |
AF347015.21 | -0.52 | -0.67 |
AF347015.27 | -0.52 | -0.58 |
AIFM3 | -0.52 | -0.52 |
增强 | -0.51 | -0.67 |
higd1b | -0.51 | -0.62 |
Metrn | -0.51 | -0.65 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Rho GTPases的Reactome信号传导 | 113 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌 | 294 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Basaki YBX1靶向 | 290 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌早期 | 430 | 232 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Odonnell TFRC靶向DN | 139 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MYC和TFRC DN的ODONNELL目标 | 45 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤PR | 45 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XU GH1外源目标 | 85 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Xu GH1自分泌目标 | 268 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fujii YBX1靶向DN | 202 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chang Cycling基因 | 148 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类增殖 | 178 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期g2 m | 216 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应24小时 | 324 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇6 | 140 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化 | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |