概括
基因 55789
象征 depdc1b
同义词 BRCC3 | XTP1
描述 包含1B的DEP域
参考 MIM:616073|HGNC:HGNC:24902|Ensembl:ENSG0000000035499|HPRD:16794|Vega:Otthumg0000000097083
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5q12.1
Pascal P值 0.001
主持人 小脑

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PROM1 0.79 0.73
L3MBTL3 0.76 0.74
CCBE1 0.75 0.70
rasgef1c 0.75 0.72
THSD7B 0.74 0.74
MDGA1 0.74 0.75
AC079953.2 0.74 0.79
lphn3 0.73 0.78
nkain2 0.73 0.83
axin2 0.72 0.73
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.56 -0.64
MT-CO2 -0.55 -0.63
HSD17B14 -0.53 -0.61
ifi27 -0.52 -0.60
AF347015.21 -0.52 -0.67
AF347015.27 -0.52 -0.58
AIFM3 -0.52 -0.52
增强 -0.51 -0.67
higd1b -0.51 -0.62
Metrn -0.51 -0.65

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Rho GTPases的Reactome信号传导 113 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌 294 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basaki YBX1靶向 290 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期 430 232 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Odonnell TFRC靶向DN 139 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MYC和TFRC DN的ODONNELL目标 45 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤PR 45 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1外源目标 85 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Xu GH1自分泌目标 268 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fujii YBX1靶向DN 202 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Cycling基因 148 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类增殖 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期g2 m 216 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时 324 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇6 140 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因