基因页面:TRERF1
总结吗?
| GeneID | 55809年 |
| 象征 | TRERF1 |
| 同义词 | BCAR2 | HSA277276 |拉伯| TREP132 | trep - 132 | dJ139D8.5 |
| 描述 | 转录调节因子1 |
| 参考 | MIM: 610322|HGNC: HGNC: 18273|运用:ENSG00000124496|HPRD: 11647|织女:OTTHUMG00000014698 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 6 p21.1-p12.1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.623 |
| 胎儿β | -0.872 |
| DMG | 1(#研究) |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.033 | |
| GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.04433 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg13256491 | 6 | 42231123 | TRERF1 | 4.089的军医 | 0.372 | 0.044 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SLC30A9 | 0.92 | 0.91 |
| RAB2A | 0.91 | 0.90 |
| USP33 | 0.91 | 0.91 |
| SHOC2 | 0.91 | 0.91 |
| ARMC1 | 0.91 | 0.92 |
| ATF2 | 0.91 | 0.90 |
| LRPPRC | 0.91 | 0.90 |
| SCAMP1 | 0.90 | 0.92 |
| UGCG | 0.90 | 0.89 |
| UBQLN1 | 0.90 | 0.89 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-CO2 | -0.76 | -0.73 |
| FXYD1 | -0.74 | -0.75 |
| AF347015.33 | -0.74 | -0.71 |
| MT-CYB | -0.74 | -0.71 |
| AF347015.8 | -0.73 | -0.72 |
| AF347015.31 | -0.72 | -0.70 |
| HIGD1B | -0.72 | -0.71 |
| AF347015.2 | -0.72 | -0.69 |
| AF347015.26 | -0.72 | -0.68 |
| AF347015.21 | -0.71 | -0.69 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0003700 | 转录因子的活动 | 艾达 | 11349124 | |
| 去:0008270 | 锌离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0008301 | DNA弯曲活动 | NAS | 11349124 | |
| 去:0008134 | 转录因子结合 | 新闻学会 | 11349124 | |
| 去:0016455 | RNA聚合酶II转录中介活动 | NAS | 11349124 | |
| 去:0030374 | ligand-dependent核受体转录辅激活活动 | NAS | 11349124 | |
| 去:0046872 | 金属离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006350 | 转录 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006707 | 胆固醇的分解过程 | NAS | 11349124 | |
| 去:0006694 | 类固醇生物合成的过程 | NAS | 11349124 | |
| 去:0007275 | 多细胞有机体的发展 | NAS | 11349124 | |
| 去:0042592 | 自我平衡的过程 | NAS | 11349124 | |
| 去:0045893 | 积极的调控转录,依赖dna的 | 艾达 | 11349124 | |
| 去:0046885 | 调节激素生物合成的过程 | NAS | 11349124 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005622 | 细胞内的 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005634 | 核 | 艾达 | 11349124 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DN NUYTTEN NIPP1目标 | 848年 | 527年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 汉SATB1目标了 | 395年 | 249年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陈代谢症侯群网络 | 1210年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 气缺氧 | 140年 | 96年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHYLA CBFA2T3目标了 | 387年 | 225年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 约翰斯通PARVB目标2 DN | 336年 | 211年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZWANG EGF间隔DN | 214年 | 124年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 196 | 97年 | 103年 | m8 | hsa - mir - 196 a | UAGGUAGUUUCAUGUUGUUGG |
| hsa - mir - 196 b | UAGGUAGUUUCCUGUUGUUGG | ||||