总结吗?
GeneID 5581年
象征 PRKCE
同义词 PKCE | nPKC-epsilon
描述 蛋白激酶Cε
参考 MIM: 176975|HGNC: HGNC: 9401|运用:ENSG00000171132|HPRD: 01500|织女:OTTHUMG00000128817
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 p21 2
帕斯卡假定值 0.002
胎儿β -1.365
DMG 1(#研究)
eGene 迈尔斯的顺式和反式
支持 CANABINOID
细胞内信号转导
METABOTROPIC谷氨酸受体
5 -羟色胺
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2Cdb.humanNRC
G2Cdb.humanPSD
G2Cdb.humanPSP
CompositeSet
达内尔FMRP目标

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:GWASdb 全基因组关联研究 精神分裂症GWASdb记录
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了DNA的甲基化概要首发精神分裂症患者外周血细胞从18岁(FESZ)和15名正常对照组。 1
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 点击显示详细信息
网络 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 贡献在PPI网络最短路径:6.2183

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg11476211 2 45879284 PRKCE -0.026 0.43 DMG: Nishioka_2013

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs3851333 chr2 45545406 PRKCE 5581年 0.18 独联体
rs12473388 chr2 45549304 PRKCE 5581年 0.06 独联体
rs11681887 chr2 45549659 PRKCE 5581年 0.02 独联体
rs17211786 chr4 182548238 PRKCE 5581年 0.09 反式
rs16930362 chr10 74890320 PRKCE 5581年 0.17 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
MYT1 0.93 0.82
PHF21B 0.91 0.84
VANGL2 0.91 0.89
MED12基因 0.91 0.87
CTBP2 0.90 0.87
SERINC2 0.90 0.82
NUP188 0.90 0.89
PLAGL2 0.90 0.84
FANCC 0.89 0.85
ABL1 0.89 0.87
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
C5orf53 -0.58 -0.79
HLA-F -0.55 -0.71
FBXO2 -0.55 -0.64
PTH1R -0.54 -0.66
AIFM3 -0.54 -0.69
SLC16A11 -0.54 -0.61
LHPP -0.54 -0.58
TNFSF12 -0.53 -0.61
ALDOC -0.53 -0.63
TMEM54 -0.53 -0.57

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0000166 核苷酸绑定 国际能源机构 - - - - - -
去:0004871 信号传感器活动 助教 1382605|10438519
去:0004699 calcium-independent蛋白激酶C活性 国际能源机构 - - - - - -
去:0005515 蛋白结合 新闻学会 10801826|17668322
去:0005524 ATP结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0004674 蛋白质的丝氨酸/苏氨酸激酶活性 国际能源机构 - - - - - -
去:0016740 转移酶的活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0008270 锌离子结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0019992 二酰基甘油绑定 国际能源机构 - - - - - -
去:0046872 金属离子结合 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0006468 蛋白质磷酸化氨基酸 国际能源机构 - - - - - -
去:0006468 蛋白质磷酸化氨基酸 助教 1382605
去:0007242 细胞内的信号级联 国际能源机构 - - - - - -
去:0006917 诱导细胞凋亡 助教 10438519
去:0050730 监管peptidyl-tyrosine磷酸化 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005624 膜分数 助教 7935319
去:0005634 国际能源机构 - - - - - -
去:0005737 细胞质 国际能源机构 - - - - - -

第四部分,注释蛋白质间交互作用

扶少团团员 别名B 官方全名B 实验 PubMed ID
ACTA1 ACTA | ASMA | CFTD | CFTD1 | CFTDM | MPFD | NEM1 | NEM2 | NEM3 肌动蛋白α1,骨骼肌 亲和力Capture-MS
亲和力Capture-Western
BioGRID 11897493
ACTC1 ACTC | CMD1R | CMH11 α肌动蛋白,心肌1 - - - - - - HPRD 11968018
ADAP1 CENTA1 | GCS1L | p42IP4 ArfGAP PH值和双域1 生化活动 BioGRID 12893243
AFAP1 AFAP | AFAP - 110 | FLJ56849 肌动蛋白丝相关蛋白1 - - - - - - HPRD, BioGRID 12134071
AKAP9 AKAP350 | AKAP450 | CG-NAP | HYPERION | KIAA0803 |μ- rms - 40.16 - | PRKA9 | YOTIAO 一个激酶(PRKA)锚蛋白(yotiao) 9 - - - - - - HPRD 10945988
雌性生殖道 ABC35 | ABCC7 | CF |雌性生殖道/ MRP | MRP7 | TNR-CFTR | dJ760C5.1 囊性纤维化跨膜电导调节(磷酸腺苷盒式sub-family C,成员7) - - - - - - HPRD, BioGRID 11956211
CNN1 SMCC | Sm-Calp calponin 1基本平滑肌 - - - - - - HPRD 9312127
COPB1 COPB | DKFZp761K102 | FLJ10341 coatomer蛋白质复合体,β亚基1 - - - - - - HPRD 11897493
COPB2 β的警察 coatomer蛋白质复合体亚基β2(β') 亲和力Capture-MS
亲和力Capture-Western
BioGRID 11897493
COPB2 β的警察 coatomer蛋白质复合体亚基β2(β') - - - - - - HPRD 9360998
GAD1 迦得FLJ45882 | | SCP 谷氨酸脱羧酶1(大脑,67 kda) 生化活动 BioGRID 15147202
GAD2 GAD65 | MGC161605 | MGC161607 谷氨酸脱羧酶2(胰岛细胞和大脑,65 kda) - - - - - - HPRD, BioGRID 15147202
GJA1 CX43 | DFNB38 | GJAL | ODDD 缝隙连接蛋白、α1,43 kda - - - - - - HPRD, BioGRID 10679481
GNA12 MGC104623 | MGC99644 | NNX3 | RMP |创业计划 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白)α12 生化活动 BioGRID 8824244
GNA13 G13 | MGC46138 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),α13 - - - - - - HPRD, BioGRID 8824244
GNB2L1 Gnb2-rs1 | H12.3 | HLC-7 | PIG21 | RACK1 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),β多肽2 1 亲和力Capture-Western
西部
重新组成复杂
BioGRID 11956211
GRIN1 NMDA1 | NMDAR1 | NR1 谷氨酸受体,ionotropic N-methyl D-aspartate 1 - - - - - - HPRD 10862698
HK2 DKFZp686M1669 | HKII | HXK2 己糖激酶2 亲和力Capture-Western BioGRID 12663490
KRT1 CK1 | EHK1 | K1 | KRT1A 角蛋白1 - - - - - - HPRD, BioGRID 11897493
KRT18 CYK18 | K18 角蛋白18 - - - - - - HPRD, BioGRID 1374067
MAPK1 ERK | ERK2 | ERT1 | MAPK2 | P42MAPK | PRKM1 | PRKM2 | p38 | p40 | p41 | p41mapk 增殖蛋白激酶1 亲和力Capture-Western BioGRID 11350735
MYH2 MYH2A | MYHSA2 | MYHas8 | MyHC-2A | MyHC-IIa 肌凝蛋白重链2、骨骼肌、成人 - - - - - - HPRD 11897493
MYH9 DFNA17 | EPSTS | ftn | MGC104539 |尼古拉斯| NMHC-II-A | NMMHCA 肌凝蛋白重链9,non-muscle 亲和力Capture-MS
亲和力Capture-Western
BioGRID 11897493
PDLIM5 掺| ENH1 | L9 | LIM PDZ和LIM域5 - - - - - - HPRD, BioGRID 8940095
PDPK1 MGC20087 | MGC35290 |基因| PRO0461 3-phosphoinositide依赖性蛋白激酶1 不详的同种型PDPK1(基因)磷酸化PRKCE (PKC-epsilon)。之间的交互是仿照了交互PDPK1从物种和PRKCE不详不详的物种。 绑定 12223477
PIK3CB DKFZp779K1237 | MGC133043 | PI3K | PI3KCB | PI3Kbeta | PIK3C1 | p110-BETA phosphoinositide-3-kinase、催化β多肽 - - - - - - HPRD, BioGRID 9822674
PPP1R14A CPI-17 | CPI17 | PPP1INL 蛋白磷酸酶1,监管(抑制剂)亚基14 - - - - - - HPRD 15003508
PRKCE MGC125656 | MGC125657 | PKCE | nPKC-epsilon 蛋白激酶C,ε PRKCE autophosphorylates (PKC-epsilon)。这种交互是仿照了交互使用PRKCE从一个未指明的物种。 绑定 12223477
PRKD1 PKC-MU | PKCM | PKD | PRKCM 蛋白激酶D1 PRKCE (PKC-epsilon)磷酸化PRKD1 (PKC-mu)。之间的交互是仿照了交互从一个未指明的物种和人类PRKD1 PRKCE。 绑定 12223477
RAF1 CRAF | NS5 | Raf-1 | c-Raf v-raf-1小鼠白血病病毒致癌基因同族体1 - - - - - - HPRD, BioGRID 11350735
RASGRP3 GRP3 | KIAA0846 RAS脒基释放蛋白3(钙和DAG-regulated) 生化活动 BioGRID 15213298
SLC25A4 蚂蚁AAC1 | | ANT1 | PEO2 | PEO3 | T1 溶质载体家族25(线粒体载体;腺嘌呤核苷转运蛋白),成员4 亲和力Capture-Western BioGRID 12663490
SNCA MGC110988 |有色人种协进会| PARK1 | PARK4 | PD1 α-核蛋白(非淀粉样前体的A4组件) - - - - - - HPRD 10407019
SRC c - src ASV | SRC1 | | p60-Src v - src肉瘤(Schmidt-Ruppin a)病毒致癌基因相同器官(禽流感) - - - - - - HPRD 11834516
TIAM1 FLJ36302 t细胞淋巴瘤浸润和转移1 - - - - - - HPRD, BioGRID 10212259
VDAC1 MGC111064 |孔蛋白| PORIN-31-HL 压敏电阻器阴离子通道1 - - - - - - HPRD, BioGRID 12663490
YWHAZ KCIP-1 | MGC111427 | MGC126532 | MGC138156 酪氨酸3-monooxygenase /色氨酸5-monooxygenase激活蛋白质、ζ多肽 亲和力Capture-Western BioGRID 11950841


部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
KEGG血管平滑肌收缩 115年 81年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG紧密连接 134年 86年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG FCεRI信号通路 79年 58 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG FCγR介导的吞噬作用 97年 71年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG II型糖尿病 47 41 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA角化细胞通路 46 38 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA PTDINS通路 23 16 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA AKAPCENTROSOME通路 15 14 所有SZGR 2.0基因通路
PID内皮素途径 63年 52 所有SZGR 2.0基因通路
PID LYSOPHOSPHOLIPID通路 66年 53 所有SZGR 2.0基因通路
PID细胞通路 66年 51 所有SZGR 2.0基因通路
PID LPA4通路 15 10 所有SZGR 2.0基因通路
PID CDC42通路 70年 51 所有SZGR 2.0基因通路
PID CD8细胞通路 53 42 所有SZGR 2.0基因通路
PID TXA2PATHWAY 57 43 所有SZGR 2.0基因通路
PID NFAT 3通路 54 47 所有SZGR 2.0基因通路
PID IL2 1通路 55 43 所有SZGR 2.0基因通路
PID PDGFRB通路 129年 103年 所有SZGR 2.0基因通路
PID IL8 CXCR1通路 28 19 所有SZGR 2.0基因通路
PID RAS途径 30. 22 所有SZGR 2.0基因通路
PID CD8细胞受体下游通路 65年 56 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME信号通过神经生长因子 217年 167年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME DAG和IP3信号 32 25 所有SZGR 2.0基因通路
由ERBB2 REACTOME信号 101年 78年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME表皮生长因子受体信号的癌症 109年 80年 所有SZGR 2.0基因通路
从质膜通过TRKA REACTOME神经生长因子信号 137年 105年 所有SZGR 2.0基因通路
FGFR REACTOME信号的疾病 127年 88年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME胃泌激素分子通过PKC和MAPK信号通路 205年 136年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME GPCR信号的 920年 449年 所有SZGR 2.0基因通路
由PDGF REACTOME信号 122年 93年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME下游信号转导 95年 76年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME GαQ信号事件 184年 116年 所有SZGR 2.0基因通路
下游REACTOME GPCR信号 805年 368年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME GαZ信号事件 44 29日 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME FGFR下游信号激活 One hundred. 74年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME磷脂酶C介导的级联 54 40 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME PIP2水解的影响 25 17 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME止血 466年 331年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME血小板激活信号和聚合 208年 138年 所有SZGR 2.0基因通路
由FGFR REACTOME信号 112年 80年 所有SZGR 2.0基因通路
MCBRYAN发育期乳房3 4周 214年 144年 所有SZGR 2.0基因通路
MCBRYAN发育期乳房4 5周DN 196年 131年 所有SZGR 2.0基因通路
NUYTTEN EZH2的目标了 1037年 673年 所有SZGR 2.0基因通路
多亏尤文和NFKB目标了 43 33 所有SZGR 2.0基因通路
多亏尤文和病毒GPCR信号 86年 54 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH SUZ12目标 1038年 678年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH速度的目标 1062年 725年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH ES与H3K27ME3 1118年 744年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH PRC2目标 652年 441年 所有SZGR 2.0基因通路
BYSTRYKH造血干细胞和大脑QTL CIS 65年 38 所有SZGR 2.0基因通路
CHESLER大脑最高表达 40 29日 所有SZGR 2.0基因通路
GOLDRATH免疫记忆 65年 42 所有SZGR 2.0基因通路
布朗感染14小时血巨细胞病毒DN 298年 200年 所有SZGR 2.0基因通路
伊万诺娃造血干细胞 254年 164年 所有SZGR 2.0基因通路
伯顿脂肪生成2 72年 52 所有SZGR 2.0基因通路
伊万诺娃造血干细胞和祖 681年 420年 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯RB1 DN的目标 543年 317年 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯TP53的目标了 602年 364年 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯RB1和TP53的目标 601年 369年 所有SZGR 2.0基因通路
由喀斯特DN IWANAGA致癌 120年 81年 所有SZGR 2.0基因通路
YAUCH刺猬信号旁分泌DN 264年 159年 所有SZGR 2.0基因通路
甜蜜的肺癌喀斯特DN 435年 289年 所有SZGR 2.0基因通路
黄成人组织干细胞模块 721年 492年 所有SZGR 2.0基因通路
TORCHIA EWSR1 FLI1融合的目标 271年 165年 所有SZGR 2.0基因通路
若林史江脂肪生成PPARG 8 d 658年 397年 所有SZGR 2.0基因通路
PEDRIOLI MIR31目标了 221年 120年 所有SZGR 2.0基因通路
由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 1839年 928年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 101 3040年 3047年 1、m8 hsa - mir - 101 UACAGUACUGUGAUAACUGAAG
miR-103/107 1564年 1570年 1 hsa - mir - 103大脑 AGCAGCAUUGUACAGGGCUAUGA
hsa - mir - 107大脑 AGCAGCAUUGUACAGGGCUAUCA
miR-141/200a 1289年 1296年 1、m8 hsa - mir - 141 UAACACUGUCUGGUAAAGAUGG
hsa - mir - 200 a UAACACUGUCUGGUAACGAUGU
mir - 143 2180年 2187年 1、m8 hsa - mir - 143大脑 UGAGAUGAAGCACUGUAGCUCA
mir - 144 3041年 3047年 1 hsa - mir - 144 UACAGUAUAGAUGAUGUACUAG
mir - 181 3060年 3066年 m8 hsa - mir - 181 a大脑 AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU
hsa - mir - 181 b深圳 AACAUUCAUUGCUGUCGGUGGG
hsa - mir - 181 c大脑 AACAUUCAACCUGUCGGUGAGU
hsa - mir - 181 d大脑 AACAUUCAUUGUUGUCGGUGGGUU
mir - 182 3032年 3038年 1 hsa - mir - 182 UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA
hsa - mir - 182 UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA
mir - 205 2732年 2739年 1、m8 hsa - mir - 205 UCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG
mir - 216 1495年 1501年 m8 hsa - mir - 216 UAAUCUCAGCUGGCAACUGUG
mir - 218 2153年 2159年 m8 hsa - mir - 218大脑 UUGUGCUUGAUCUAACCAUGU
miR-23 3057年 3063年 1 hsa-miR-23a大脑 AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC
hsa-miR-23b大脑 AUCACAUUGCCAGGGAUUACC
miR-25/32/92/363/367 1628年 1635年 1、m8 hsa-miR-25大脑 CAUUGCACUUGUCUCGGUCUGA
hsa-miR-32 UAUUGCACAUUACUAAGUUGC
hsa - mir - 92 UAUUGCACUUGUCCCGGCCUG
hsa - mir - 367 AAUUGCACUUUAGCAAUGGUGA
hsa - mir - 92 b深圳 UAUUGCACUCGUCCCGGCCUC
mir - 362 2735年 2741年 1 hsa - mir - 362 AAUCCUUGGAACCUAGGUGUGAGU
mir - 363 2879年 2885年 1 hsa - mir - 363 AUUGCACGGUAUCCAUCUGUAA
mir - 381 1503年 1509年 1 hsa - mir - 381 UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU
mir - 500 1626年 1633年 1、m8 hsa - mir - 500 AUGCACCUGGGCAAGGAUUCUG
mir - 543 1838年 1844年 m8 hsa - mir - 543 AAACAUUCGCGGUGCACUUCU
mir - 96 614年 620年 1 hsa - mir - 96大脑 UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC
hsa - mir - 96大脑 UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC