基因页面:FOXJ2
总结吗?
GeneID | 55810年 |
象征 | FOXJ2 |
同义词 | FHX |
描述 | forkhead盒J2 |
参考 | HGNC: HGNC: 24818|运用:ENSG00000065970|HPRD: 17014|织女:OTTHUMG00000168526 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 12 p13.31 |
帕斯卡假定值 | 0.369 |
夏洛克假定值 | 0.486 |
胎儿β | 0.037 |
DMG | 2(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了DNA的甲基化概要首发精神分裂症患者外周血细胞从18岁(FESZ)和15名正常对照组。 | 2 |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg13863617 | 12 | 8186708 | FOXJ2 | 4.41的军医 | 0.39 | 0.045 | DMG: Wockner_2014 |
cg12958836 | 12 | 8185024 | FOXJ2 | -0.022 | 0.26 | DMG: Nishioka_2013 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs16827037 | chr3 | 117203284 | FOXJ2 | 55810年 | 0.08 | 反式 | ||
rs1020772 | chr9 | 76532511 | FOXJ2 | 55810年 | 0.02 | 反式 | ||
rs3025425 | chr9 | 136523165 | FOXJ2 | 55810年 | 0.18 | 反式 | ||
rs10834670 | chr11 | 25404015 | FOXJ2 | 55810年 | 0.08 | 反式 | ||
rs1230712 | chr18 | 54992531 | FOXJ2 | 55810年 | 0.12 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FOXJ2_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HSPA6 | 0.55 | -0.05 |
CARD16 | 0.53 | 0.50 |
CLEC2B | 0.52 | 0.46 |
处于受控 | 0.49 | 0.30 |
HSPA1A | 0.48 | 0.02 |
SERTAD1 | 0.48 | 0.49 |
BAG3 | 0.46 | 0.31 |
PIGB | 0.46 | 0.43 |
DNAJB1 | 0.45 | -0.02 |
EAF2 | 0.45 | 0.52 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
WDR81 | -0.43 | -0.45 |
TNKS1BP1 | -0.42 | -0.50 |
ZBTB3 | -0.42 | -0.48 |
NDST2 | -0.42 | -0.44 |
MAP2K7 | -0.42 | -0.41 |
HIP1R | -0.41 | -0.51 |
ARHGAP1 | -0.41 | -0.39 |
FAM129B | -0.41 | -0.54 |
PTPN23 | -0.41 | -0.48 |
C4orf42 | -0.41 | -0.48 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
BERTUCCI髓与乳腺癌导管 | 206年 | 111年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PROVENZANI转移DN | 136年 | 94年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH NANOG目标 | 988年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH SOX2目标 | 734年 | 436年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿尔茨海默病了布莱洛克的 | 1691年 | 1088年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KRIGE TOSEDOSTAT反应6小时 | 953年 | 554年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KRIGE TOSEDOSTAT反应24小时 | 783年 | 442年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝癌H3K27ME3 DN | 228年 | 114年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RUTELLA CSF2RB和IL4 | 338年 | 225年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RUTELLA应对HGF | 418年 | 282年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RUTELLA HGF VS CSF2RB和IL4 DN | 245年 | 150年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
卡MIR302A目标 | 77年 | 62年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
JUBAN SPI1和FLI1的目标 | 115年 | 73年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RAO受SALL4同种型 | 182年 | 108年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |