基因页:UTP6
概括?
基因 | 55813 |
象征 | UTP6 |
同义词 | C17orf40 | HCA66 |
描述 | UTP6,小亚基processom组件 |
参考 | HGNC:HGNC:18279|HPRD:11020| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17q11.2 |
Pascal P值 | 0.093 |
Sherlock P值 | 0.579 |
胎儿β | 1.037 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑半球 |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG13453082 | 17 | 30228694 | UTP6 | 2.74E-8 | -0.014 | 8.65e-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/UTP6_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
是的 | 0.92 | 0.93 |
GLOD4 | 0.92 | 0.91 |
tada1l | 0.90 | 0.90 |
MRPL3 | 0.90 | 0.88 |
ptges3 | 0.90 | 0.87 |
UBA3 | 0.90 | 0.87 |
MSL3 | 0.90 | 0.88 |
EIF4E2 | 0.90 | 0.88 |
COPS3 | 0.90 | 0.86 |
C1orf149 | 0.90 | 0.89 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.80 | -0.78 |
AF347015.31 | -0.77 | -0.77 |
mt-cyb | -0.77 | -0.78 |
AF347015.2 | -0.76 | -0.78 |
AF347015.33 | -0.76 | -0.77 |
AF347015.8 | -0.76 | -0.77 |
AF347015.26 | -0.75 | -0.77 |
higd1b | -0.72 | -0.75 |
AF347015.15 | -0.72 | -0.76 |
AF347015.9 | -0.71 | -0.78 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
GAZDA钻石黑芬贫血红细胞侵蚀 | 25 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤复制编号 | 181 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标60小时DN | 277 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bakker FOXO3靶向DN | 187 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
双龙通过TSC1敏感血清 | 23 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |