概括
基因 55813
象征 UTP6
同义词 C17orf40 | HCA66
描述 UTP6,小亚基processom组件
参考 HGNC:HGNC:18279|HPRD:11020|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17q11.2
Pascal P值 0.093
Sherlock P值 0.579
胎儿β 1.037
DMG 1(#研究)
主持人 小脑半球
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG13453082 17 30228694 UTP6 2.74E-8 -0.014 8.65e-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
是的 0.92 0.93
GLOD4 0.92 0.91
tada1l 0.90 0.90
MRPL3 0.90 0.88
ptges3 0.90 0.87
UBA3 0.90 0.87
MSL3 0.90 0.88
EIF4E2 0.90 0.88
COPS3 0.90 0.86
C1orf149 0.90 0.89
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.80 -0.78
AF347015.31 -0.77 -0.77
mt-cyb -0.77 -0.78
AF347015.2 -0.76 -0.78
AF347015.33 -0.76 -0.77
AF347015.8 -0.76 -0.77
AF347015.26 -0.75 -0.77
higd1b -0.72 -0.75
AF347015.15 -0.72 -0.76
AF347015.9 -0.71 -0.78

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
GAZDA钻石黑芬贫血红细胞侵蚀 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤复制编号 181 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标60小时DN 277 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bakker FOXO3靶向DN 187 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
双龙通过TSC1敏感血清 23 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因