基因页：BDP1
概括？
| 基因 | 55814 |
| 象征 | BDP1 |
| 同义词 | hsa238520 | taf3b1 | tfc5 | tfiiib''| tfiiib150 | tfiiib90 | tfnr |
| 描述 | B双素1，RNA聚合酶III转录起始因子IIIB的亚基 |
| 参考 | MIM：607012|HGNC：HGNC：13652|ENSEMBL：ENSG00000145734|HPRD：06114|Vega：Otthumg00000162506 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 5Q13 |
| Pascal P值 | 0.466 |
| 胎儿β | 0.81 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG07851057 | 5 | 70751686 | BDP1 | 4.11E-7 | -0.437 | 0.006 | DMG：Wockner_2014 |
| CG22034268 | 5 | 70848529 | BDP1 | 1.67E-5 | 0.314 | 0.015 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS16829545 | CHR2 | 151977407 | BDP1 | 55814 | 0.11 | 反式 | ||
| RS758989 | CHR7 | 44203005 | BDP1 | 55814 | 0.06 | 反式 | ||
| RS1303722 | CHR7 | 44219073 | BDP1 | 55814 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| 赫兹 | 0.92 | 0.93 |
| UBN2 | 0.91 | 0.92 |
| SLC12A6 | 0.91 | 0.92 |
| BIRC6 | 0.91 | 0.91 |
| PCNX | 0.91 | 0.92 |
| KIAA1632 | 0.91 | 0.91 |
| KIAA2018 | 0.91 | 0.92 |
| kif1b | 0.90 | 0.92 |
| crkrs | 0.90 | 0.92 |
| Huwe1 | 0.90 | 0.90 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.69 | -0.77 |
| higd1b | -0.68 | -0.78 |
| MT-CO2 | -0.68 | -0.76 |
| ifi27 | -0.67 | -0.75 |
| AF347015.21 | -0.66 | -0.79 |
| FXYD1 | -0.66 | -0.74 |
| CXCL14 | -0.64 | -0.72 |
| CST3 | -0.64 | -0.74 |
| C1orf54 | -0.63 | -0.80 |
| S100A16 | -0.63 | -0.71 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Senese HDAC1靶向 | 457 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wamunyokoli卵巢癌LMP | 265 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由组蛋白乙酰化DN调节的玛丽亚达森 | 54 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 双龙通过TSC2敏感血清 | 39 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |