基因页面:TSNAXIP1
总结吗?
| GeneID | 55815年 |
| 象征 | TSNAXIP1 |
| 同义词 | TXI1 |
| 描述 | translin-associated因子X相互作用蛋白1 |
| 参考 | MIM: 607720|HGNC: HGNC: 18586|运用:ENSG00000102904|HPRD: 09656|织女:OTTHUMG00000137545 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 16 q22.1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.002 |
| 夏洛克假定值 | 0.083 |
| 胎儿β | -0.467 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 前扣带皮层BA24 小脑半球 额叶皮质BA9 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg05253326 | 16 | 67850616 | TSNAXIP1 | 3.77 e-5 | -0.526 | 0.02 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs4380312 | chr20 | 2239006 | TSNAXIP1 | 55815年 | 0.17 | 反式 | ||
| rs9922934 | 16 | 68258981 | TSNAXIP1 | ENSG00000102904.10 | 8.26203 e-6 | 0.05 | 418313年 | gtex_brain_ba24 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| YWHAZ | 0.88 | 0.86 |
| ANKRD46 | 0.88 | 0.87 |
| PRKRA | 0.87 | 0.86 |
| AASDHPPT | 0.87 | 0.88 |
| FBXO3 | 0.87 | 0.85 |
| ORC4L | 0.86 | 0.87 |
| RAP1GDS1 | 0.86 | 0.87 |
| B3GALNT1 | 0.86 | 0.86 |
| DYNC1LI1 | 0.86 | 0.87 |
| UBA3 | 0.86 | 0.88 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-CO2 | -0.69 | -0.67 |
| AF347015.2 | -0.68 | -0.70 |
| AF347015.8 | -0.68 | -0.68 |
| AF347015.31 | -0.67 | -0.66 |
| MT-CYB | -0.66 | -0.66 |
| AF347015.33 | -0.66 | -0.65 |
| AF347015.15 | -0.64 | -0.65 |
| AF347015.26 | -0.64 | -0.66 |
| AF347015.27 | -0.64 | -0.63 |
| AF347015.21 | -0.63 | -0.60 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GAUSSMANN MLL AF4融合目标C | 170年 | 114年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MOREAUX TACI了多发性骨髓瘤 | 412年 | 249年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马森受FOXP3刺激 | 1022年 | 619年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森ES与H3K4ME3 ICP | 718年 | 401年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森人大与H3K4ME3 ICP | 445年 | 257年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |