概括
基因 55827
象征 DCAF6
同义词 1200006M05RIK | ARCAP | IQWD1 | MSTP055 | NRIP | PC326
描述 DDB1和CUL4相关因子6
参考 MIM:610494|HGNC:HGNC:30002|ENSEMBL:ENSG00000143164|HPRD:17156|Vega:Otthumg0000000034572
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q24.2
Sherlock P值 0.474
胎儿β -1.462
DMG 1(#研究)
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG07684150 1 167906751 DCAF6 1.48e-8 -0.013 5.67E-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
NDEL1 0.89 0.87
AFG3L2 0.89 0.86
pitpna 0.88 0.90
CMAS 0.88 0.88
C14orf153 0.88 0.86
ywhab 0.87 0.82
USP14 0.87 0.85
ARMCX3 0.87 0.83
PNMA2 0.87 0.88
是的 0.87 0.88
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.66 -0.43
MT-CO2 -0.61 -0.44
AF347015.2 -0.60 -0.40
AF347015.8 -0.60 -0.43
AF347015.31 -0.60 -0.44
higd1b -0.60 -0.44
AP002478.3 -0.59 -0.49
AF347015.18 -0.59 -0.41
mt-cyb -0.58 -0.40
AF347015.33 -0.58 -0.40

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与基础 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘普通癌基因 79 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2目标 424 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血干细胞长期 302 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江缺氧正常 311 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞DN 145 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足 518 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉中的罗马胰岛素靶标 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hirsch细胞转化特征dn 103 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标2 UP 140 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因