基因页:DCAF6
概括?
基因 | 55827 |
象征 | DCAF6 |
同义词 | 1200006M05RIK | ARCAP | IQWD1 | MSTP055 | NRIP | PC326 |
描述 | DDB1和CUL4相关因子6 |
参考 | MIM:610494|HGNC:HGNC:30002|ENSEMBL:ENSG00000143164|HPRD:17156|Vega:Otthumg0000000034572 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1q24.2 |
Sherlock P值 | 0.474 |
胎儿β | -1.462 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG07684150 | 1 | 167906751 | DCAF6 | 1.48e-8 | -0.013 | 5.67E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DCAF6_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
NDEL1 | 0.89 | 0.87 |
AFG3L2 | 0.89 | 0.86 |
pitpna | 0.88 | 0.90 |
CMAS | 0.88 | 0.88 |
C14orf153 | 0.88 | 0.86 |
ywhab | 0.87 | 0.82 |
USP14 | 0.87 | 0.85 |
ARMCX3 | 0.87 | 0.83 |
PNMA2 | 0.87 | 0.88 |
是的 | 0.87 | 0.88 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.66 | -0.43 |
MT-CO2 | -0.61 | -0.44 |
AF347015.2 | -0.60 | -0.40 |
AF347015.8 | -0.60 | -0.43 |
AF347015.31 | -0.60 | -0.44 |
higd1b | -0.60 | -0.44 |
AP002478.3 | -0.59 | -0.49 |
AF347015.18 | -0.59 | -0.41 |
mt-cyb | -0.58 | -0.40 |
AF347015.33 | -0.58 | -0.40 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
tien肠益生菌24小时 | 557 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌根源与基础 | 330 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘普通癌基因 | 79 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shen Smarca2目标 | 424 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血干细胞长期 | 302 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江缺氧正常 | 311 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张乳腺癌祖细胞DN | 145 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌肉中的罗马胰岛素靶标 | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hirsch细胞转化特征dn | 103 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标2 UP | 140 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |