概括
基因 5583
象征 prkch
同义词 pkc-l | pkcl | prkcl | npkc-eta
描述 蛋白激酶C ETA
参考 MIM:605437|HGNC:HGNC:9403|Ensembl:ENSG00000027075|HPRD:05669|Vega:Otthumg00000152341
基因类型 蛋白质编码
地图位置 14Q23.1
Pascal P值 0.008
Sherlock P值 0.394
胎儿β -0.514
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2096481 CHR8 36570335 prkch 5583 0.16 反式
RS16885322 CHR8 36598931 prkch 5583 0.16 反式
RS10907032 Chrx 117784719 prkch 5583 0.1 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg血管平滑肌收缩 115 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg thright连接点 134 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
生物质体角质形成细胞途径 46 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID内皮素路径 63 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TXA2 Pathway 57 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID NFAT 3 Pathway 54 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胃胃CREB信号传导途径通过PKC和MAPK 205 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha Q信号事件 184 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha z信号事件 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PIP2水解的反应组作用 25 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome血小板激活信号传导和聚集 208 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu Sox4靶向DN 309 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莱茵所有糖皮质激素治疗DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 DN 281 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向12小时 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hahtola兄弟姐妹fungoides DN 16 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP63目标 355 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2B 392 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过ELK3 UP总缺氧 209 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤分化中等程度与不良 121 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANA TNF信号DN 90 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung Creb1靶向DN 57 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江VHL目标 138 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ehrlich ICF综合症 13 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乔治塔斯HSC标记 71 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P3 160 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng由Foxp3绑定 491 310 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng Foxp3目标 26 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞DN 216 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌复制号 298 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee区分T淋巴细胞 200 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带有Inv 16易位 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤课程DN 210 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ewsr1 fli1融合的骨靶标 271 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因