基因页面:GLT8D1
总结吗?
| GeneID | 55830年 |
| 象征 | GLT8D1 |
| 同义词 | 广告- 017 | MSTP139 |
| 描述 | 糖基转移酶8域包含1 |
| 参考 | HGNC: HGNC: 24870|运用:ENSG00000016864|HPRD: 12423|织女:OTTHUMG00000158759 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 3 p21.1 |
| 帕斯卡假定值 | 1.631 e - |
| 夏洛克假定值 | 1.106 e-6 |
| 胎儿β | 0.558 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWAScat | 全基因组关联研究 | 这个数据集包含560个snp与精神分裂症有关。总共有486个基因映射到这些snp在50 kb。 | |
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| 路:是的 | 全基因组关联研究 | 这个数据集包括99个基因映射到22个地区。前24个snp也包括在简历:Ripke_2013 | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs352169 | chr3 | 52236761 | GLT8D1 | 55830年 | 3.609 e-5 | 独联体 | ||
| rs352167 | chr3 | 52238655 | GLT8D1 | 55830年 | 0 | 独联体 | ||
| rs352166 | chr3 | 52238676 | GLT8D1 | 55830年 | 1.477的军医 | 独联体 | ||
| rs11712164 | chr3 | 52244050 | GLT8D1 | 55830年 | 4.831 e-9 | 独联体 | ||
| rs6445528 | chr3 | 52572446 | GLT8D1 | 55830年 | 1.745 e - | 独联体 | ||
| rs2878628 | chr3 | 52584714 | GLT8D1 | 55830年 | 5.91 e-11 | 独联体 | ||
| rs2251219 | chr3 | 52584786 | GLT8D1 | 55830年 | 1.291平台以及 | 独联体 | ||
| rs1961958 | chr3 | 52585989 | GLT8D1 | 55830年 | 6.363 e-13 | 独联体 | ||
| rs6778844 | chr3 | 52596397 | GLT8D1 | 55830年 | 2.932 e-12 | 独联体 | ||
| rs12487591 | chr3 | 52642935 | GLT8D1 | 55830年 | 2.187 e-11 | 独联体 | ||
| rs3755806 | chr3 | 52643684 | GLT8D1 | 55830年 | 4.695 e-11 | 独联体 | ||
| rs1561337 | chr3 | 52659962 | GLT8D1 | 55830年 | 2.187 e-11 | 独联体 | ||
| rs2289250 | chr3 | 52682945 | GLT8D1 | 55830年 | 2.336 e-9 | 独联体 | ||
| rs2289247 | chr3 | 52727256 | GLT8D1 | 55830年 | 2.716 e-11 | 独联体 | ||
| rs12635140 | chr3 | 52738164 | GLT8D1 | 55830年 | 9.134 e-11 | 独联体 | ||
| rs2072390 | chr3 | 52780508 | GLT8D1 | 55830年 | 2.534平台以及 | 独联体 | ||
| rs2336545 | chr3 | 52787602 | GLT8D1 | 55830年 | 3.301 e-11 | 独联体 | ||
| rs2240920 | chr3 | 52831008 | GLT8D1 | 55830年 | 3.317平台以及 | 独联体 | ||
| rs2256332 | chr3 | 52855864 | GLT8D1 | 55830年 | 0.01 | 独联体 | ||
| rs2276817 | chr3 | 52860935 | GLT8D1 | 55830年 | 0.01 | 独联体 | ||
| rs3733047 | chr3 | 52871928 | GLT8D1 | 55830年 | 6.838 e-5 | 独联体 | ||
| rs6803519 | chr3 | 52889770 | GLT8D1 | 55830年 | 6.741的军医 | 独联体 | ||
| rs6795646 | chr3 | 52922620 | GLT8D1 | 55830年 | 0 | 独联体 | ||
| rs2581815 | chr3 | 52982158 | GLT8D1 | 55830年 | 8.82的军医 | 独联体 | ||
| rs2336669 | chr3 | 52994137 | GLT8D1 | 55830年 | 9.718的军医 | 独联体 | ||
| rs4519686 | chr3 | 52997870 | GLT8D1 | 55830年 | 9.312的军医 | 独联体 | ||
| rs9823697 | chr3 | 53002149 | GLT8D1 | 55830年 | 0.04 | 独联体 | ||
| rs17304995 | chr3 | 53070754 | GLT8D1 | 55830年 | 6.679的军医 | 独联体 | ||
| rs352169 | chr3 | 52236761 | GLT8D1 | 55830年 | 0 | 反式 | ||
| rs352167 | chr3 | 52238655 | GLT8D1 | 55830年 | 0.09 | 反式 | ||
| rs352166 | chr3 | 52238676 | GLT8D1 | 55830年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs11712164 | chr3 | 52244050 | GLT8D1 | 55830年 | 1.185 e-6 | 反式 | ||
| rs6445528 | chr3 | 52572446 | GLT8D1 | 55830年 | 3.783 e-5 | 反式 | ||
| rs2878628 | chr3 | 52584714 | GLT8D1 | 55830年 | 1.531 e-8 | 反式 | ||
| rs2251219 | chr3 | 52584786 | GLT8D1 | 55830年 | 3.298 e-8 | 反式 | ||
| rs1961958 | chr3 | 52585989 | GLT8D1 | 55830年 | 1.596平台以及 | 反式 | ||
| rs6778844 | chr3 | 52596397 | GLT8D1 | 55830年 | 7.25平台以及 | 反式 | ||
| rs12487591 | chr3 | 52642935 | GLT8D1 | 55830年 | 5.729 e-9 | 反式 | ||
| rs2289247 | chr3 | 52727256 | GLT8D1 | 55830年 | 7.145 e-9 | 反式 | ||
| rs12635140 | chr3 | 52738164 | GLT8D1 | 55830年 | 2.356 e-8 | 反式 | ||
| rs2072390 | chr3 | 52780508 | GLT8D1 | 55830年 | 6.25 e-8 | 反式 | ||
| rs2336545 | chr3 | 52787602 | GLT8D1 | 55830年 | 8.707 e-9 | 反式 | ||
| rs2240920 | chr3 | 52831008 | GLT8D1 | 55830年 | 8.149 e-8 | 反式 | ||
| snp_a - 2288026 | 0 | GLT8D1 | 55830年 | 0.02 | 反式 | |||
| rs3733047 | chr3 | 52871928 | GLT8D1 | 55830年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs6803519 | chr3 | 52889770 | GLT8D1 | 55830年 | 0.05 | 反式 | ||
| rs6795646 | chr3 | 52922620 | GLT8D1 | 55830年 | 0.14 | 反式 | ||
| rs2581815 | chr3 | 52982158 | GLT8D1 | 55830年 | 0.06 | 反式 | ||
| rs2336669 | chr3 | 52994137 | GLT8D1 | 55830年 | 0.07 | 反式 | ||
| rs4519686 | chr3 | 52997870 | GLT8D1 | 55830年 | 0.07 | 反式 | ||
| rs17304995 | chr3 | 53070754 | GLT8D1 | 55830年 | 0.05 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| TTBK1 | 0.92 | 0.94 |
| AC115090.1 | 0.91 | 0.92 |
| MGAT3 | 0.91 | 0.94 |
| EPB41L1 | 0.90 | 0.92 |
| 上 | 0.89 | 0.91 |
| 计画 | 0.89 | 0.91 |
| AL117209.1 | 0.88 | 0.92 |
| KIF1A | 0.88 | 0.90 |
| PHLPP2 | 0.87 | 0.90 |
| C11orf41 | 0.87 | 0.90 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.59 | -0.62 |
| GNG11 | -0.59 | -0.65 |
| C1orf54 | -0.59 | -0.70 |
| AF347015.31 | -0.56 | -0.57 |
| AL139819.3 | -0.56 | -0.62 |
| MT-CO2 | -0.54 | -0.56 |
| HIGD1B | -0.54 | -0.56 |
| SYCP3 | -0.54 | -0.64 |
| PLA2G5 | -0.54 | -0.54 |
| DBI | -0.53 | -0.62 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 周炎症反应生活的DN | 384年 | 220年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病 | 1382年 | 904年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 周炎症反应费马DN | 284年 | 156年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金正日WT1 DN的目标 | 459年 | 276年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LASTOWSKA神经母细胞瘤拷贝数DN | 800年 | 473年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DARWICHE乳头状瘤风险高和低 | 6 | 6 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CEBALLOS TP53的目标和MYC DN | 38 | 31日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN NUYTTEN EZH2目标 | 1024年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里克曼肿瘤分化适度VS差 | 121年 | 71年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH MYC最大目标 | 775年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MOREAUX TACI多发性骨髓瘤的DN | 172年 | 107年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病DN布莱洛克的 | 1237年 | 837年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王SMARCE1 DN的目标 | 371年 | 218年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染14小时血巨细胞病毒DN | 298年 | 200年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DAZARD应对紫外线这些DN | 318年 | 220年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 瑞士POSTRADIATION肿瘤逃避DN | 373年 | 196年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CREIGHTON内分泌治疗抵抗3 | 720年 | 440年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 罗斯白血病MLL融合 | 78年 | 49 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 八木AML和11 q23处重新安排 | 351年 | 238年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 党由MYC DN | 253年 | 192年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 党受MYC | 1103年 | 714年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马顿斯维甲酸反应DN | 841年 | 431年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 格雷戈里合成与伊马替尼致命 | 145年 | 83年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| THILLAINADESAN ZNF217目标了 | 44 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |