基因页:bex1
概括?
基因 | 55859 |
象征 | bex1 |
同义词 | bex2 | hbex2 | hgr74-h |
描述 | 大脑表达X连锁1 |
参考 | MIM:300690|HGNC:HGNC:1036|Ensembl:ENSG00000133169|HPRD:06460|Vega:Otthumg0000000022708 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | XQ22.1 | XQ22 |
Sherlock P值 | 0.571 |
DEG P值 | DEG:ZHAO_2015:P = 4.32E-04:Q = 0.0926 |
胎儿β | -0.441 |
支持 | 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DEG:Zhao_2015 | RNA测序分析 | 转录组测序和全基因组的关联分析揭示了精神分裂症和躁郁症中的溶酶体功能和肌动蛋白细胞骨架重塑。 | |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/BEX1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0007399 | 神经系统的发展 | IEA | 神经突(GO期限:5) | - |
去:0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
去:0030154 | 细胞分化 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID P75 NTR途径 | 69 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Horiuchi WTAP靶向 | 306 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌早期DN | 367 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoebeke淋巴干细胞DN | 86 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC1和HDAC2靶向DN | 232 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC2靶向DN | 133 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房4 5WK | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LA MEN1目标 | 24 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向神经上皮 | 176 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Borlak肝癌EGF UP | 57 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mohankumar TLX1靶向DN | 193 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM3 | 70 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Khetchoumian Trim24靶向 | 47 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼转移 | 344 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼头颈癌B | 48 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜Kras靶向DN | 66 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ROSS AML与AML1 ETO融合 | 76 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Haddad T淋巴细胞和NK祖细胞 | 78 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Affar YY1目标 | 214 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lian Lipa目标6m | 74 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nielsen Gist和滑膜肉瘤 | 20 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 | 250 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌克拉斯 | 491 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标60小时DN | 277 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McMurray TP53 HRAS合作响应DN | 67 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤 | 207 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇5的时间反应5 | 30 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
verhaak胶质母细胞瘤pro | 177 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1靶向衰老 | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 | 374 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHYLA CBFA2T3靶向 | 387 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vandesluis Commd1目标3 | 89 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 | 321 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-495 | 167 | 173 | 1a | HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu |