基因页：PRKD1

概括？
基因 5587
象征 PRKD1
同义词 PKC-MU | PKCM | PKD | PRKCM
描述 蛋白激酶D1
参考 MIM：605435|HGNC：HGNC：9407|Ensembl：ENSG00000184304|HPRD：05668|Vega：Otthumg00000140203
基因类型 蛋白质编码
地图位置 14Q11
Pascal P值 3.488e-6
Sherlock P值 0.724
胎儿β 0.716

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
简历：PGC128 全基因组协会研究 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.047

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历：PGC128

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS2068012 CHR14 30190316 TC 4.142E-8 内含子 PRKD1


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0000166 核苷酸结合 IEA -
去：0004700 非典型蛋白激酶C活性 塔斯 8119958
去：0005515 蛋白质结合 IPI 12893243
去：0005524 ATP结合 IEA -
GO：0016740 转移酶活性 IEA -
去：0008270 锌离子结合 IEA -
GO：0019992 二酰基甘油结合 IEA -
GO：0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0006468 蛋白氨基酸磷酸化 塔斯 8119958
去：0007242 细胞内信号传导级联 IEA -
去：0008283 细胞增殖 塔斯 8119958
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005829 细胞质 塔斯 10856238
去：0005886 质膜 塔斯 8119958|10856238
去：0005887 质膜的积分 塔斯 8119958

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
ADAP1 Centa1 |GCS1L |P42IP4 带有双pH域1的arfgap 1 - HPRD，Biogrid 12893243
AKAP13 AKAP-LBC |brx |FLJ11952 |FLJ43341 |ha-3 |HT31 |LBC |原始-LB |原始-LBC |C-LBC 激酶（PRKA）锚蛋白13 AKAP-LBC与PKD相互作用。 绑定 15383279
btk AGMX1 |在|ATK |bpk |IMD1 |MGC126261 |MGC126262 |PSCTK1 |XLA 布鲁顿阿氨基葡萄糖酸酪氨酸激酶 - HPRD，Biogrid 10561498
C1QBP GC1QBP |HABP1 |sf2p32 |GC1Q-R |GC1QR |p32 补体组件1，Q子分量结合蛋白 - HPRD，Biogrid 10831594
GNB2L1 GNB2-RS1 |H12.3 |HLC-7 |PIG21 |机架1 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白（G蛋白），β多肽2类样1 PKC-MU与RACK1相互作用。 绑定 11884618
HDAC5 FLJ90614 |HD5 |NY-CO-9 组蛋白脱乙酰基酶5 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 15367659
IGF1R CD221 |igfir |JTK13 |MGC142170 |MGC142172 |MGC18216 胰岛素样生长因子1受体 PKC-MU与IGF-IR相互作用。 绑定 11884618
六月 AP-1 |AP1 |C-Jun Jun Oncogene - HPRD，Biogrid 11948398
MAPK8 jnk |JNK1 |JNK1A2 |JNK21B1/2 |prkm8 |SAPK1 有丝分裂原激活的蛋白激酶8 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11948398
MAPK9 JNK-55 |jnk2 |jnk2a |jnk2alpha |JNK2B |jnk2beta |prkm9 |SAPK |p54a |P54ASAPK 有丝分裂原激活的蛋白激酶9 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11948398
MT2A MT2 金属硫蛋白2a - HPRD，Biogrid 14550308
PLCG1 PLC-II |PLC1 |PLC148 |Plcgamma1 磷脂酶C，伽马1 - HPRD，Biogrid 8885868
PLCG2 - 磷脂酶C，伽马2（磷脂酰肌醇特异性） - HPRD，Biogrid 8885868
PPP1R14A CPI-17 |CPI17 |ppp1inl 蛋白质磷酸酶1，调节（抑制剂）亚基14A - HPRD 15003508
prkce MGC125656 |MGC125657 |PKCE |npkc-epsilon 蛋白激酶C，Epsilon PRKCE（PKC-EPSILON）磷酸化PRKD1（PKC-MU）。这种相互作用是根据未指定物种与人PRKD1的PRKCE之间的相互作用进行建模的。 绑定 12223477
prkch MGC26269 |MGC5363 |PKC-L |PKCL |prkcl |npkc-eta 蛋白激酶C，ETA PRKCH（PKC-ETA）磷酸化PRKD1（PKC-MU）。这种相互作用是根据未指定物种与人PRKD1的PRKCH之间的相互作用进行建模的。 绑定 12223477
PRKD1 PKC-MU |PKCM |PKD |prkcm 蛋白激酶D1 PRKD1（PKC-MU）自磷酸化。 绑定 12223477
Syk dkfzp313n1010 |FLJ25043 |FLJ37489 脾酪氨酸激酶 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 8885868
USP15 KIAA0529 |MGC131982 |MGC149838 |MGC74854 |UNPH4 泛素特异性肽酶15 PKD磷酸化USP15。 绑定 16005295
ywhaq 14-3-3 |1c5 |HS1 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白，theta多肽 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物		 Biogrid 10092600|10831594
ywhaz KCIP-1 |MGC111427 |MGC126532 |MGC138156 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白，Zeta多肽 重构的复合物 Biogrid 12893243


V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
St GA13途径 37 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID溶物磷脂途径 66 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IGF1途径 30 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome鞘脂从头生物合成 31 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组磷脂代谢 198 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组鞘脂代谢 69 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basaki YBX1靶向DN 384 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向DN 536 332 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chebotaev gr目标dn 120 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼转移 344 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2目标 424 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼尔森对雄激素DN的反应 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML生存 129 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制性新皮层 83 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acevedo肝癌，H3K27me3 UP 295 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Firestein增殖 175 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌BRCA1 DN 44 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McMurray TP53 HRAS合作响应DN 67 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤 207 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson对促性腺营养蛋白DN的反应 87 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson对Forskolin DN的反应 88 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoelzel NF1靶向DN 115 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过p38完成的phong TNF响应 227 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durand Stroma S向上 297 194 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124.1 618 624 M8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 618 624 1a HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-128 27 33 M8 HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
mir-132/212 119 125 1a HSA-MIR-212SZ uaacagucuccagucacgccc
HSA-MIR-132脑 uaacagucuacccaugggg
mir-182 146 152 M8 HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
mir-335 397 403 1a HSA-MIR-335脑 UCAAGAGCAAUAACGAAAAAUAUGU
mir-34/449 79 85 1a HSA-MIR-34A脑 uggcaguguuaguguguuuu
HSA-MIR-34C Aggcaguguaguagcugauugc
HSA-MIR-449 uggcaguguauuguagcuggu
HSA-MIR-449B Aggcaguguauuguuagcuggc
mir-375 104 110 1a HSA-MIR-375 uuuguucguucggcucgcguga
mir-377 180 186 M8 HSA-MIR-377 aucacacaaaggaacuuuuugu
mir-431 150 156 1a HSA-MIR-431 uguugcaggccguauga
mir-544 73 79 M8 HSA-MIR-544 auucugcauuuuuuagcaagu