概括
基因 5588
象征 prkcq
同义词 prkct | npkc-theta
描述 蛋白激酶C theta
参考 MIM:600448|HGNC:HGNC:9410|Ensembl:ENSG0000000065675|HPRD:02710|Vega:Otthumg0000000017623
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10p15
Pascal P值 0.369
主持人
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0000287 镁离子结合 IEA -
去:0004697 蛋白激酶C活性 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 10383400|10636891|11788586
|17588663
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0005524 ATP结合 nas -
去:0004674 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 IEA -
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
去:0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0019992 二酰基甘油结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0001558 细胞生长调节 nas 8444877
去:0006468 蛋白氨基酸磷酸化 IEA -
去:0006468 蛋白氨基酸磷酸化 nas -
去:0007242 细胞内信号传导级联 IEA -
去:0007242 细胞内信号传导级联 nas 7686153
去:0051092 NF-kappab转录因子活性的正调控 艾达 15790681
GO:0042102 T细胞增殖的阳性调节 IEA -
GO:0045086 白介素-2生物合成过程的积极调节 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0001772 免疫突触 IEA 突触(GO期限:7) -
去:0005622 细胞内 nas -
去:0005737 细胞质 IEA -
去:0005886 质膜 IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
AKT1 akt |MGC99656 |PKB |pkb-alpha |Prkba |RAC |Rac-Alpha V-Akt鼠胸腺瘤病毒癌基因同源1 - HPRD,Biogrid 11410591
卡11 Bimp3 |Carma1 |MGC133069 caspase招聘域家庭,成员11 PRKCQ(PKC-THETA)与Card11(Carma1)相互作用。 绑定 14673152
楚克 ikbka |ikk-alpha |ikk1 |ikka |nfkbika |TCF16 保守的螺旋环螺旋无处不在激酶 PKC-Theta与IKK-Alpha相互作用。 绑定 15802604
Fyn MGC45350 |SLK |syn Fyn Oncogene与SRC,FGR,是的 - HPRD,Biogrid 10383400
GLRX3 FLJ11864 |glrx4 |grx3 |grx4 |picot |txnl2 |txnl3 |BA500G10.4 谷毒素3 - HPRD,Biogrid 10636891
HABP4 ihabp4 |Ki-1/57 |MGC825 |serbp1l 透明质酸结合蛋白4 - HPRD 14699138
ikbkb FLJ40509 |ikk-beta |ikk2 |ikkb |MGC131801 |nfkbikb B细胞,激酶β的Kappa光多肽基因增强子的抑制剂 PKC-Theta与Ikk-Beta相互作用。 绑定 15802604
ikbkb FLJ40509 |ikk-beta |ikk2 |ikkb |MGC131801 |nfkbikb B细胞,激酶β的Kappa光多肽基因增强子的抑制剂 - HPRD,Biogrid 11120819
ikbkg AMCBX1 |FIP-3 |fip3 |fip3p |ikk-gamma |IP |IP1 |IP2 |IPD2 |Nemo B细胞,激酶γ中Kappa光多肽基因增强子的抑制剂 PKC-Theta与Nemo相互作用。 绑定 15802604
LCK yt16 |p56lck |pp58lck 淋巴细胞特异性蛋白酪氨酸激酶 两个杂交 Biogrid 10383400
林恩 FLJ26625 |JTK8 V-YES-1 Yamaguchi肉瘤病毒相关的癌基因同源物 - HPRD 11358993
PDPK1 MGC20087 |MGC35290 |PDK1 |Pro0461 3-磷酸​​肌醇依赖蛋白激酶-1 PDK1与PKC-Theta相互作用。 绑定 15802604
CD62L |Lam-1 |LAM1 |lecam1 |lnhr |LSEL |lyam1 |Leu-8 |lyam-1 |plnhr | TQ1 | hLHRc selectin l L-选择素与PKC-Theta相互作用并磷酸化。 绑定 15192100
tal1 SCL |TCL5 |BHLHA17 |TAL-1 T细胞急性淋巴细胞性白血病1 两个杂交 Biogrid 10383400
vav1 VAV VAV 1鸟嘌呤核苷酸交换因子 PRKCQ(PKC-THETA)与VAV1相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人类PRKCQ和VAV1之间的相互作用建模的。 绑定 14673152
vav1 VAV VAV 1鸟嘌呤核苷酸交换因子 - HPRD,Biogrid 10725744
是的 14-3-3-GAMMA 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白,伽马多肽 - HPRD,Biogrid 10433554


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg血管平滑肌收缩 115 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg thright连接点 134 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg t细胞受体信号通路 108 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG脂肪细胞信号传导途径 67 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
生物质体角质形成细胞途径 46 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID内皮素路径 63 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TCR途径 66 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid nfat tfpathway 47 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CD8 TCR途径 53 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TXA2 Pathway 57 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID NFAT 3 Pathway 54 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CD8 TCR下游途径 65 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组凋亡的细胞蛋白裂解 40 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胃胃CREB信号传导途径通过PKC和MAPK 205 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome TCR信号传导 54 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome下游TCR信号传导 37 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Axon指导 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha Q信号事件 184 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha z信号事件 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PIP2水解的反应组作用 25 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Netrin1信号传导 41 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组凋亡 148 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome适应性免疫系统 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome血小板激活信号传导和聚集 208 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome凋亡执行阶段 54 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名1 DN 242 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 DN 281 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌DN 232 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌群集1 121 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2A DN 141 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ozanne AP1靶向 18 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX3 FOXO1融合的Ebauer目标 207 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LOH在CHR9Q中与LOH的Lindgren膀胱癌 116 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana BRCA2 PCC网络 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿斯顿主要抑郁症DN 160 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Radaeva对IFNA1的响应 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cheok对汞和LD MTX DN的反应 21 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MLL AF9融合的Kumar目标 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血干细胞长期 302 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng由Foxp3绑定 491 310 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Finetti乳腺癌绿色 16 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acevedo肝癌,H3K27me3 UP 295 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌正常 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤C D DN 252 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee区分T淋巴细胞 200 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与11q23重新排列 351 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nielsen Gist vs滑膜肉瘤DN 20 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼尔森·吉斯特(Nielsen Gist) 98 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gregory合成致死与伊马替尼 145 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3靶向 387 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ewsr1 fli1融合的骨靶标 271 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOSCO TH1细胞毒性模块 114 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因