基因页：prkcsh
概括？
| 基因 | 5589 |
| 象征 | prkcsh |
| 同义词 | age-r2 | g19p1 | giib | pcld | pkcsh | pld1 | vasap-60 |
| 描述 | 蛋白激酶C底物80K-H |
| 参考 | MIM：177060|HGNC：HGNC：9411|Ensembl：ENSG00000130175|HPRD：03518|Vega：Otthumg00000182029 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 19p13.2 |
| Pascal P值 | 0.626 |
| Sherlock P值 | 0.457 |
| 胎儿β | -0.068 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG00598858 | 19 | 11545966 | prkcsh | -0.016 | 0.95 | DMG：Nishioka_2013 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS2088983 | CHR4 | 160643773 | prkcsh | 5589 | 0.19 | 反式 | ||
| RS7830259 | CHR8 | 14087643 | prkcsh | 5589 | 0.05 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Serinc3 | 0.91 | 0.83 |
| EHD3 | 0.90 | 0.92 |
| TMEM130 | 0.90 | 0.89 |
| PPP2R2C | 0.90 | 0.92 |
| NPTN | 0.89 | 0.86 |
| Stim1 | 0.89 | 0.91 |
| TPRG1L | 0.89 | 0.89 |
| 纳尔克 | 0.89 | 0.91 |
| SYN2 | 0.88 | 0.86 |
| htr5a | 0.88 | 0.87 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Bcl7c | -0.53 | -0.61 |
| C9orf46 | -0.49 | -0.52 |
| RPL35 | -0.48 | -0.55 |
| exosc8 | -0.48 | -0.47 |
| rps19p3 | -0.47 | -0.60 |
| RBMX2 | -0.47 | -0.53 |
| RPL23A | -0.47 | -0.52 |
| RPL18 | -0.46 | -0.56 |
| RPS23 | -0.46 | -0.51 |
| RPLP1 | -0.46 | -0.53 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome术后翻译蛋白修饰 | 188 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome天冬酰胺N连接的糖基化 | 81 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome钙网蛋白钙网蛋白周期 | 11 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome N Glycan修剪ER和钙网蛋白钙网蛋白周期 | 13 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome晚期糖基化终产受体信号传导 | 13 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome先天免疫系统 | 279 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gary CD5目标 | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Huttmann B Cll生存不佳 | 276 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 维克曼石棉肺癌DN | 28 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang LMO4靶向 | 372 | 227 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chow RASSF1目标DN | 29 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lucas HNF4A靶向 | 58 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 悍马皮肤癌进展 | 88 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wood EBV EBNA1靶向 | 110 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LIN APC目标 | 77 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| faelt b cll与VH3 21 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee Calorie限制肌肉 | 43 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee衰老的肌肉DN | 46 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng对H2O2的响应 | 71 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rizki肿瘤侵入性3D DN | 270 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |