基因页：ZNF395
概括？
| 基因 | 55893 |
| 象征 | ZNF395 |
| 同义词 | HDBP-2 | HDBP2 | HDRF-2 | PBF | PRF-1 | PRF1 | SI-1-8-14 |
| 描述 | 锌指蛋白395 |
| 参考 | MIM：609494|HGNC：HGNC：18737|ENSEMBL：ENSG00000186918|HPRD：11711|Vega：Otthumg00000102137 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 8p21.1 |
| Pascal P值 | 0.051 |
| Sherlock P值 | 0.966 |
| DEG P值 | DEG：Maycox_2009：cc_ba10_fold_change = 1.17：cc_ba10_disease_p = 0.0462：hbb_ba9_fold_change = 1.33：hbb_ba9_disease_p = 0.0459 |
| 胎儿β | 0.504 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DEG：Maycox_2009 | 微阵列确定验尸后30000多个mRNA转录本的表达 | 我们包括了51个基因，其表达变化在两个精神分裂症队列之间很常见。 | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.00057 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.03086 | |
| 表达 | 基因表达的荟萃分析 | p价值：2.111 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG13411962 | 8 | 28243934 | ZNF395 | 2.35E-6 | -0.311 | 0.008 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS10750127 | Chr11 | 98657918 | ZNF395 | 55893 | 0.1 | 反式 | ||
| RS10750128 | Chr11 | 98658148 | ZNF395 | 55893 | 0.08 | 反式 | ||
| RS1029287 | CHR16 | 13830449 | ZNF395 | 55893 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003677 | DNA结合 | 艾达 | 14625278 | |
| 去：0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
| GO：0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006355 | 调节转录，DNA依赖性的调节 | 我知道了 | 14625278 | |
| 去：0006350 | 转录 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
| 去：0005634 | 核 | 艾达 | 14625278 | |
| 去：0005737 | 细胞质 | 艾达 | 14625278 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 中村肿瘤区周围与中央DN | 634 | 384 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| sotiriou乳腺癌1级vs 3 DN | 52 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PAX FOXO1融合的Davicioni目标 | 255 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Davicioni Rhabdomyosarcoma PAX FOXO1融合 | 64 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周炎性反应活DN | 384 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 刘cmyb靶向 | 165 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smirnov在癌症中循环内皮细胞 | 158 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| UDayakumar Med1靶向DN | 240 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC1靶向DN | 260 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC1和HDAC2靶向DN | 232 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC3靶向DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Tien肠益生菌6小时DN | 167 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周的炎症反应FIMA DN | 284 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim WT1靶向12小时 | 162 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 埃尔维奇缺氧 | 171 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DMOG的Elvidge缺氧 | 130 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Elvidge Hif1a靶向DN | 91 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Elvidge HIF1A和HIF2A靶向DN | 104 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| AIYAR COBRA1靶向DN | 29 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WEI mir34a目标 | 148 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张对IKK抑制剂和TNF DN的响应 | 103 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马纳洛缺氧 | 207 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 江VHL目标 | 138 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 江缺氧正常 | 311 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| riggi ewing肉瘤祖先DN | 191 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN | 274 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mitsiades对aplidin DN的反应 | 249 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ERBB2 CDC25A DN的射线肿瘤发生 | 159 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 | 315 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对HGF DN的响应 | 235 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vantveer乳腺癌BRCA1 DN | 44 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Han Satb1靶向 | 395 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 钱德兰转移 | 221 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Karlsson TGFB1靶向DN | 207 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoelzel NF1靶向DN | 115 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| figueroa aml甲基化簇4 | 112 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Thillainadesan Znf217靶向 | 44 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Acosta增殖独立MYC靶向 | 84 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fardin缺氧11 | 32 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过p38部分的phong TNF响应 | 160 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smirnov对IR 6小时DN的响应 | 114 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-132/212 | 3035 | 3041 | 1a | HSA-MIR-212SZ | uaacagucuccagucacgccc |
| HSA-MIR-132脑 | uaacagucuacccaugggg | ||||
| mir-194 | 2899 | 2905 | M8 | HSA-MIR-194 | uguaacagcaacuccauga |
| MiR-200BC/429 | 3023 | 3029 | 1a | HSA-MIR-200B | uaauacugccugguaaugaugac |
| HSA-MIR-200C | uaauacugccggguaaugaugg | ||||
| HSA-MIR-429 | uaauacuguguguguguguaaaaaccgu | ||||
| mir-23 | 3056 | 3063 | 1A，M8 | HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc |
| HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||
| mir-323 | 3056 | 3062 | 1a | HSA-MIR-323脑 | gcacauuacggucgaccucu |
| mir-369-3p | 3024 | 3030 | M8 | HSA-MIR-369-3P | aauauacaugguugaucuuu |
| mir-490 | 2918 | 2924 | M8 | HSA-MIR-490 | caaccuggaggacuaugcugcug |
| mir-7 | 3015 | 3022 | 1A，M8 | HSA-MIR-7SZ | Uggaagacuaguuuuuguug |
| mir-9 | 265 | 272 | 1A，M8 | HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |