SZGR2 - Beplay体育中心

概括?

基因	5590
Symbol	PRKCZ
同义词	PKC-Zeta \| PKC2
描述	protein kinase C zeta
参考	MIM：176982\|HGNC：HGNC：9412\|Ensembl：ENSG0000000067606\|HPRD：01504\|Vega：Otthumg00000001238
Gene type	protein-coding
地图位置	1p36.33-p36.2
Pascal P值	0.002
Sherlock P值	0.994
Fetal beta	1.517
DMG	1（＃研究）
eGene	元
支持	细胞内信号转导

数据源中的基因

Gene set name	基因组方法	描述	Info
CV:GWAScat	全基因组关联研究	该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV：GWASDB	全基因组关联研究	gwasdbrecords for schizophrenia
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
DMG:Wockner_2014	Genome-wide DNA methylation analysis	This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24).	7
go_annotation	Mapping neuro-related keywords to Gene Ontology annotations	与神经相关的关键字的命中：1
网络	人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离	PPI网络中最短路径的贡献：1.9141

第一节遗传学和表观遗传学注释

差异甲基化基因

探测	Chromosome	Position	最近的基因	P (dis)	beta（dis）	FDR (dis)	Study
cg01974180	1	2084246	PRKCZ	2.66E-5	0.468	0.018	DMG:Wockner_2014
cg04347414	1	2084519	PRKCZ	7.42e-5	0.628	0.025	DMG:Wockner_2014
cg02393699	1	2106620	PRKCZ	1.142E-4	0.412	0.029	DMG:Wockner_2014
cg00300046	1	2084595	PRKCZ	1.387E-4	0.671	0.031	DMG:Wockner_2014
cg24445388	1	2084391	PRKCZ	1.412E-4	0.743	0.031	DMG:Wockner_2014
cg17426766	1	2046864	PRKCZ	4.131E-4	0.365	0.044	DMG:Wockner_2014
CG18269141	1	2063966	PRKCZ	5.803E-4	0.353	0.049	DMG:Wockner_2014

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function	GO term	Evidence	Neuro keywords	PubMed ID
GO:0000166	核苷酸结合	IEA		-
去：0004700	非典型蛋白激酶C活性	塔斯		8224878
GO:0005515	protein binding	新闻学会		11755531\|12893243
GO:0005524	ATP结合	IEA		-
GO:0016740	transferase activity	IEA		-
去：0008270	锌离子结合	IEA		-
GO:0019992	二酰基甘油结合	IEA		-
GO：0046872	金属离子结合	IEA		-
Biological process	GO term	Evidence	Neuro keywords	PubMed ID
GO：0000226	微管细胞骨架组织	IEA		-
GO:0006468	蛋白氨基酸磷酸化	塔斯		10477520
去：0007242	intracellular signaling cascade	IEA		-
去：0006916	anti-apoptosis	塔斯		10770953
细胞分量	GO term	Evidence	Neuro keywords	PubMed ID
去：0005923	tight junction	IEA	Brain (GO term level: 10)	-
GO:0005624	膜分数	塔斯		7925449
GO:0005737	细胞质	塔斯		7925449
GO:0005768	内体	IEA		-
去：0005938	cell cortex	IEA		-
GO:0005886	质膜	塔斯		7925449
GO:0045179	根尖皮层	IEA		-

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors	Aliases B	Official full name B	Experimental	资源	PubMed ID
ADAP1	Centa1 \|GCS1L \|P42IP4	ArfGAP with dual PH domains 1	-	HPRD，Biogrid	12893243
ADCY5	AC5	adenylate cyclase 5	-	HPRD	8206971
AFAP1	AFAP \| AFAP-110 \| FLJ56849	actin filament associated protein 1	-	HPRD	12134071
AKT1	AKT \| MGC99656 \| PKB \| PKB-ALPHA \| PRKBA \| RAC \| RAC-ALPHA	V-Akt鼠胸腺瘤病毒癌基因同源1	-	HPRD，Biogrid	10085094
AKT3	DKFZp434N0250 \| PKB-GAMMA \| PKBG \| PRKBG \| RAC-PK-gamma \| RAC-gamma \| STK-2	V-Akt鼠胸腺瘤病毒癌基因同源物3（蛋白激酶B，伽马）	-	HPRD，Biogrid	12162751
C1QBP	GC1QBP \|HABP1 \|sf2p32 \|GC1Q-R \|GC1QR \|p32	complement component 1, q subcomponent binding protein	-	HPRD，Biogrid	10831594
CDC42	cdc42hs \|G25K	细胞分裂周期42（GTP结合蛋白，25KDA）	-	HPRD	10733591
CSNK2B	CK2B \|CK2N \|CSK2B \|g5a \|MGC138222 \|MGC138224	casein kinase 2, beta polypeptide	-	HPRD，Biogrid	10764587
DAPK3	FLJ36473 \|zip \|Zipk	death-associated protein kinase 3	Reconstituted Complex	BioGRID	12242277
ECT2	FLJ10461 \| MGC138291	上皮细胞转化序列2癌基因	Affinity Capture-Western	BioGRID	15254234
fadd	Gig3 \|MGC8528 \|Mort1	FAS（TNFRSF6）通过死亡域关联	-	HPRD，Biogrid	11739185
FEZ1	-	魅力和伸长蛋白Zeta 1（Zygin I）	-	HPRD，Biogrid	9971736
FEZ2	hum3cl \|MGC117372	fasciculation and elongation protein zeta 2 (zygin II)	-	HPRD，Biogrid	14697253
GRB14	-	生长因子受体结合蛋白14	-	HPRD，Biogrid	12242277
HABP4	ihabp4 \|Ki-1/57 \|MGC825 \|serbp1l	透明质酸结合蛋白质n 4	-	HPRD	14699138
HNRNPA1	HNRPA1 \|MGC102835	异质核核糖核蛋白A1	PKC-Zeta磷酸化并与HNRNPA1相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的PKC-Zeta和HnRNPA1之间的相互作用进行建模的。	BIND	10383403
irak1	irak \|佩尔	interleukin-1 receptor-associated kinase 1	-	HPRD，Biogrid	11937546
IRS4	IRS-4 \|PY160	胰岛素受体底物4	-	HPRD	12774026
KRT10	CK10 \| K10 \| KPP	角蛋白10	-	HPRD，Biogrid	11585925
MAP2K5	HST17454 \|MAPKK5 \|mek5 \|prkmk5	有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶5	-	HPRD，Biogrid	11158308
MBP	MGC99675	髓磷脂碱性蛋白质	PKC-Zeta磷酸化并与MBP相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的PKC-Zeta和MBP之间的相互作用进行建模的。	BIND	10383403
NCL	C23 \|FLJ45706	nucleolin	-	HPRD，Biogrid	9388266
NFATC2	KIAA0611 \| NFAT1 \| NFATP	活化的T细胞，细胞质，钙调蛋白依赖性2的核因子2	-	HPRD，Biogrid	12021260
PARD3	ASIP \|巴兹\|火箭筒\|FLJ21015 \|PAR3 \|par3alpha \|pard3a \|SE2-5L16 \|SE2-5LT1 \|SE2-5T2	par-3 partitioning defective 3 homolog (C. elegans)	Affinity Capture-Western	BioGRID	12459187
PARD6A	Par-6a \|PAR6 \|PAR6C \|par6alpha \|税务40 \|提示40	PAR-6分区有缺陷的6个同源α（C.秀丽隐杆线）	-	HPRD，Biogrid	11260256
PARD6G	FLJ45701 \| PAR-6G \| PAR6gamma	par-6 partitioning defective 6 homolog gamma (C. elegans)	-	HPRD，Biogrid	11260256
PAWR	PAR4 \| Par-4	PRKC, apoptosis, WT1, regulator	Par-4 interacts with PKC-zeta. This interaction was modelled on a demonstrated interaction between human Par-4 and rat PKC-zeta.	BIND	8797824
PAWR	PAR4 \| Par-4	PRKC, apoptosis, WT1, regulator	Affinity Capture-Western Reconstituted Complex 两个杂交	BioGRID	8797824
PDLIM7	LMP1	PDZ和LIM域7（Enigma）	-	HPRD	8940095
PDPK1	MGC20087 \|MGC35290 \|PDK1 \|Pro0461	3-磷酸肌醇依赖蛋白激酶-1	PRKCZ（PKCZ）与PDPK1（PDK1）相互作用。这种相互作用是在人类PrkCZ和大鼠PDPK1之间的相互作用上建模的。	BIND	11781095
PDPK1	MGC20087 \|MGC35290 \|PDK1 \|Pro0461	3-磷酸肌醇依赖蛋白激酶-1	PDPK1（PDK1）的未指定同工型磷酸化PRKCZ（PKC-ZETA）。这种相互作用是根据未指定物种的PDPK1与来自未指定物种的PRKCZ之间的相互作用进行建模的。	BIND	12223477
PDPK1	MGC20087 \|MGC35290 \|PDK1 \|Pro0461	3-磷酸肌醇依赖蛋白激酶-1	-	HPRD，Biogrid	9748166\|10764742 \|11781095
PPP1R14A	CPI-17 \|CPI17 \|ppp1inl	蛋白质磷酸酶1，调节（抑制剂）亚基14A	-	HPRD	15003508
PPP3CA	CALN \| CALNA \| CALNA1 \| CCN1 \| CNA1 \| PPP2B	protein phosphatase 3 (formerly 2B), catalytic subunit, alpha isoform	-	HPRD	12021260
prkcsh	AGE-R2 \| G19P1 \| PCLD \| PLD1	蛋白激酶C底物80K-H	PRKCZ（PKCZ）与PRKCSH（80K-H）相互作用。	BIND	15707389
PRKCZ	PKC-Zeta \|PKC2	protein kinase C, zeta	PKC-Zeta自磷酸化。	BIND	15665819
RAF1	CRAF \| NS5 \| Raf-1 \| c-Raf	V-RAF-1鼠白血病病毒癌基因同源1	-	HPRD，Biogrid	10620507
Rela	MGC131774 \| NFKB3 \| p65	v-rel reticuloendotheliosis viral oncogene homolog A (avian)	-	HPRD，Biogrid	11684013
RPS6KB1	PS6K \| S6K \| S6K1 \| STK14A \| p70(S6K)-alpha \| p70-S6K \| p70-alpha	ribosomal protein S6 kinase, 70kDa, polypeptide 1	Affinity Capture-Western	BioGRID	16931574
SQSTM1	A170 \|OSIL \|PDB3 \|zip3 \|p60 \|p62 \|p62b	隔离1	zetapkc与p62相互作用。这种相互作用是在大鼠zetapkc和人p62之间证明的相互作用上建模的。	BIND	12813044
SQSTM1	A170 \|OSIL \|PDB3 \|zip3 \|p60 \|p62 \|p62b	隔离1	-	HPRD	9566925\|10356400
SQSTM1	A170 \|OSIL \|PDB3 \|zip3 \|p60 \|p62 \|p62b	隔离1	Affinity Capture-Western	BioGRID	10747026
SRC	ASV \|src1 \|C-SRC \|P60-SRC	v-src sarcoma (Schmidt-Ruppin A-2) viral oncogene homolog (avian)	-	HPRD，Biogrid	10527887
提亚姆1	FLJ36302	T-cell lymphoma invasion and metastasis 1	Biochemical Activity	BioGRID	10212259
TRAF6	MGC：3310 \|RNF85	TNF受体相关因子6	-	HPRD，Biogrid	10747026
WWC1	FLJ10865 \| FLJ23369 \| KIAA0869 \| KIBRA	WW and C2 domain containing 1	-	HPRD，Biogrid	15081397
ywhab	GW128 \| HS1 \| KCIP-1	tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, beta polypeptide	-	HPRD，Biogrid	10620507
是的	14-3-3-GAMMA	酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白，伽马多肽	Affinity Capture-Western	BioGRID	10620507
是的	ywha1	酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白，ETA多肽	Affinity Capture-Western	BioGRID	10620507
ywhaq	14-3-3 \| 1C5 \| HS1	tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, theta polypeptide	Affinity Capture-Western Biochemical Activity Reconstituted Complex	BioGRID	10620507
ywhaz	KCIP-1 \| MGC111427 \| MGC126532 \| MGC138156	酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白，Zeta多肽	Biochemical Activity Reconstituted Complex	BioGRID	10620507\|12893243

V.途径注释

Pathway name	Pathway size	＃szgr 2.0基因	Info
KEGG CHEMOKINE SIGNALING PATHWAY	190	128	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ENDOCYTOSIS	183	132	该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg thright连接点	134	86	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG胰岛素信号通路	137	103	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG TYPE II DIABETES MELLITUS	47	41	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA PTDINS PATHWAY	23	16	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID RHOA PATHWAY	45	33	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID胰岛素途径	45	32	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID WNT NONCANONICAL PATHWAY	32	26	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID遇到了路径	80	60	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CDC42 PATHWAY	70	51	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TXA2 Pathway	57	43	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL1途径	34	28	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID NFAT 3 Pathway	54	47	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CXCR4途径	102	78	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IGF1 PATHWAY	30	23	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TNF途径	46	33	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL2 PI3K通路	34	27	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CERAMIDE PATHWAY	48	37	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P75 NTR PATHWAY	69	51	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AMB2中性粒细胞途径	41	32	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB1下游途径	105	78	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TRKR途径	62	48	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID肾素Neph1途径	31	24	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID胰岛素葡萄糖途径	26	24	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID RAS路径	30	22	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome TGFβ受体信号在EMT上皮向间充质转变中	16	7	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GPVI MEDIATED ACTIVATION CASCADE	31	25	该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血	466	331	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY TGF BETA RECEPTOR COMPLEX	63	42	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PLATELET ACTIVATION SIGNALING AND AGGREGATION	208	138	该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌	1821年	933	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIN BREAST CANCER COPY NUMBER DN	16	10	该途径中的所有SZGR 2.0基因
环氧化物素的浓凋亡	239	157	该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡	1781年	1082	该途径中的所有SZGR 2.0基因
pDGFB DN的Johansson神经胶质作用	21	16	该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn	800	473	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Scheidereit IKK相互作用蛋白	58	45	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA ERCC3 ALLELE XPCS VS TTD DN	36	27	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN	464	276	该途径中的所有SZGR 2.0基因
JECHLINGER EPITHELIAL TO MESENCHYMAL TRANSITION DN	66	47	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Goldrath免疫记忆	65	42	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标DN	366	238	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PETROVA ENDOTHELIUM LYMPHATIC VS BLOOD UP	131	87	该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu衰老的脑dn	153	120	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHATI G2M ARREST BY 2METHOXYESTRADIOL DN	127	75	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI GLUCOSE DEPRIVATION	60	44	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向	1305	895	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MEISSNER NPC HCP WITH H3K27ME3	79	59	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MEISSNER BRAIN HCP WITH H3K4ME3 AND H3K27ME3	1069	729	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIKKELSEN NPC HCP WITH H3K27ME3	341	243	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3	590	403	该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向	682	433	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIM MAMMARY STEM CELL DN	428	246	该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

miRNA family	目标位置			mirna id	miRNA seq
miRNA family	UTR start	UTR end	Match method	mirna id	miRNA seq
miR-338	203	209	1a	HSA-MIR-338^脑	UCCAGCAUCAGUGAUUUUGUUGA

SZ: miRNAs which differentially expressed in brain cortex of schizophrenia patients comparing with control samples using microarray. Click这里查看与SZ相关的miRNA列表。
Brain: miRNAs which are expressed in brain based on miRNA microarray expression studies. Click这里to see the list of brain related miRNAs.

基因页：PRKCZ