基因页面:CTTNBP2NL
总结吗?
| GeneID | 55917年 |
| 象征 | CTTNBP2NL |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | CTTNBP2 n端像 |
| 参考 | MIM: 615100|HGNC: HGNC: 25330|运用:ENSG00000143079|HPRD: 10906|织女:OTTHUMG00000011154 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 1 p13.2 |
| 帕斯卡假定值 | 0.005 |
| DMG | 1(#研究) |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了DNA的甲基化概要首发精神分裂症患者外周血细胞从18岁(FESZ)和15名正常对照组。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.0235 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg20648108 | 1 | 112939192 | CTTNBP2NL | -0.021 | 0.84 | DMG: Nishioka_2013 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005730 | 核仁 | 艾达 | 18029348 | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 | |
| 去:0015629 | 肌动蛋白细胞骨架 | 艾达 | 11256614 |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
| 扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| CTTNBP2 | C7orf8 | CORTBP2 | FLJ34229 | KIAA1758 | MGC104579 | Orf4 | cortactin结合蛋白2 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| FAM40A | FLJ14743 | KIAA1761 | MGC148091 | rp4 - 773 n10.1 | 家庭使用序列相似性40岁的成员 | 亲和力Capture-MS 亲和力Capture-Western |
BioGRID | 18782753 |
| FAM40B | - - - - - - | 家庭使用序列相似性40,成员B | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| MOBKL3 | 2 c4d | cgi - 95 | MGC12264 | MOB1 | MOB3 | PREI3 | MOB1,议员们一个活页夹激酶activator-like 3(酵母) | 亲和力Capture-MS 亲和力Capture-Western |
BioGRID | 18782753 |
| PDCD10 | CCM3 | MGC1212 | MGC24477 | TFAR15 | 程序性细胞死亡10 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| PPP2CA | PP2Ac | PP2CA | RP-C | 蛋白磷酸酶2(原2 a),催化亚基、α同种型 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| PPP2CB | PP2CB | 蛋白磷酸酶2(原2 a),催化亚基,β同种型 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| PPP2R1A | MGC786 | PR65A | 蛋白磷酸酶2(原2 A),调节亚基,α同种型 | 亲和力Capture-MS 亲和力Capture-Western |
BioGRID | 18782753 |
| PPP2R1B | MGC26454 | PR65B | 蛋白磷酸酶2(原2 A),调节亚基,β同种型 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| rp6 - 213 h19.1 | 面具| MST4 | 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶MST4 | 亲和力Capture-MS 亲和力Capture-Western |
BioGRID | 18782753 |
| STK24 | MST-3 | MST3 | MST3B | STE20 | STK3 | 丝氨酸/苏氨酸激酶24 (STE20同族体、酵母) | 亲和力Capture-MS 亲和力Capture-Western |
BioGRID | 18782753 |
| STK25 | DKFZp686J1430 | SOK1 | YSK1 | 丝氨酸/苏氨酸激酶25 (STE20同族体、酵母) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
| STRN | MGC125642 | SG2NA | striatin,钙调蛋白结合蛋白 | 亲和力Capture-MS 亲和力Capture-Western |
BioGRID | 18782753 |
| STRN3 | SG2NA | striatin,钙调蛋白结合蛋白3 | 亲和力Capture-MS 亲和力Capture-Western |
BioGRID | 18782753 |
| STRN4 | 寻FLJ35594 | | zinedin | striatin,钙调蛋白结合蛋白4 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 18782753 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PICCALUGA ANGIOIMMUNOBLASTIC淋巴瘤了 | 205年 | 140年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 刘SOX4目标了 | 137年 | 94年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 胎儿肝脏DN MARTORIATI MDM4目标 | 514年 | 319年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN DAIRKEE叔目标 | 124年 | 79年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RODWELL老化肾脏没有血液 | 222年 | 139年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陈代谢症侯群网络 | 1210年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米利伪足趋触性了 | 518年 | 299年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-1/206 | 27 | 34 | 1、m8 | hsa-miR-1 | UGGAAUGUAAAGAAGUAUGUA |
| hsa - mir - 206深圳 | UGGAAUGUAAGGAAGUGUGUGG | ||||
| hsa - mir - 613 | AGGAAUGUUCCUUCUUUGCC | ||||
| mir - 137 | 877年 | 884年 | 1、m8 | hsa - mir - 137 | UAUUGCUUAAGAAUACGCGUAG |
| mir - 181 | 480年 | 486年 | m8 | hsa - mir - 181 a大脑 | AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU |
| hsa - mir - 181 b深圳 | AACAUUCAUUGCUGUCGGUGGG | ||||
| hsa - mir - 181 c大脑 | AACAUUCAACCUGUCGGUGAGU | ||||
| hsa - mir - 181 d大脑 | AACAUUCAUUGUUGUCGGUGGGUU | ||||
| miR-26 | 802年 | 809年 | 1、m8 | hsa-miR-26a大脑 | UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGC |
| hsa-miR-26b深圳 | UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU | ||||
| mir - 544 | 335年 | 341年 | m8 | hsa - mir - 544 | AUUCUGCAUUUUUAGCAAGU |