基因页：prkg1
概括？
| 基因 | 5592 |
| 象征 | prkg1 |
| 同义词 | aat8 | pkg | prkg1b | prkgr1b | cgk | cgk 1 | cgk1 | cgki | cgki-beta | cgki-alpha |
| 描述 | 蛋白激酶，CGMP依赖性，I型 |
| 参考 | MIM：176894|HGNC：HGNC：9414|ENSEMBL：ENSG00000185532|HPRD：08910|Vega：Otthumg0000000018248 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 10q11.2 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 尾状基底神经节 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 2 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：3 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG11212172 | 10 | 53459438 | prkg1 | 1.16e-8 | -0.013 | 4.82E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
| CG00407729 | 10 | 52751144 | prkg1 | 2.25e-8 | -0.011 | 7.53e-6 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| aqp3 | 0.68 | 0.33 |
| RIN1 | 0.64 | 0.65 |
| FBXL8 | 0.61 | 0.54 |
| clec4g | 0.61 | 0.61 |
| KCNG2 | 0.60 | 0.57 |
| mettl7b | 0.58 | 0.41 |
| P2RX2 | 0.58 | 0.47 |
| CNGB1 | 0.55 | 0.48 |
| 传统 | 0.55 | 0.51 |
| PNCK | 0.54 | 0.55 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| mllt3 | -0.28 | -0.24 |
| CBLB | -0.28 | -0.26 |
| C1orf26 | -0.28 | -0.26 |
| ZNF286 | -0.28 | -0.24 |
| Dact1 | -0.28 | -0.22 |
| NFIL3 | -0.28 | -0.24 |
| kcnrg | -0.28 | -0.24 |
| CEP170 | -0.28 | -0.23 |
| KLF11 | -0.28 | -0.24 |
| LRCH1 | -0.28 | -0.28 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| 去：0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
| 去：0004674 | 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 | IEA | - | |
| 去：0004692 | CGMP依赖性蛋白激酶活性 | IEA | - | |
| GO：0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
| 去：0008603 | cAMP依赖性蛋白激酶调节剂活性 | IEA | - | |
| 去：0030553 | CGMP结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0001764 | 神经元迁移 | IEA | 神经元（GO期限：8） | - |
| 去：0030900 | 前脑发展 | IEA | 大脑（GO期限：8） | - |
| GO：0016358 | 树突开发 | IEA | 神经突，树突（GO期限：11） | - |
| 去：0001932 | 调节蛋白氨基酸磷酸化 | IEA | - | |
| 去：0006468 | 蛋白氨基酸磷酸化 | IEA | - | |
| 去：0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
| 去：0007165 | 信号转导 | 塔斯 | 2792381 | |
| 去：0030036 | 肌动蛋白细胞骨架组织 | 塔斯 | 10851246 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005794 | 高尔基体 | IEA | - | |
| 去：0005634 | 核 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005730 | 核仁 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005952 | cAMP依赖性蛋白激酶复合物 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg血管平滑肌收缩 | 115 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg间隙交界处 | 90 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG长期抑郁症 | 70 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg嗅觉转导 | 389 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta No1途径 | 33 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID p38 alpha beta途径 | 31 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID TXA2 Pathway | 57 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome CGMP效应 | 19 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组一氧化氮刺激鸟苷酸环化酶 | 25 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome血小板稳态 | 78 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Rap1信号传导 | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gaussmann MLL AF4融合靶向G | 238 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 加鲁兹防止线粒体通透性 | 22 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schlesinger甲基化的癌症 | 88 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肺癌吸烟者 | 80 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 霍夫曼细胞淋巴瘤DN | 39 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染24小时DN | 148 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王顺铂反应和XPC DN | 228 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血干细胞 | 254 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rizki肿瘤侵入性3D DN | 270 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Firestein增殖 | 175 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vantveer乳腺癌BRCA1 DN | 44 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McMurray TP53 HRAS合作响应DN | 67 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| fontaine卵泡甲状腺腺瘤 | 75 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| fontaine乳头状甲状腺癌 | 66 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-103/107 | 121 | 127 | M8 | HSA-MIR-103脑 | agcagcauuguacggcuauga |
| HSA-MIR-107脑 | agcagcauuguacgggcuauca | ||||
| mir-149 | 1039 | 1045 | 1a | HSA-MIR-149脑 | Ucuggcuccucuucuucacuccc |
| mir-15/16/195/424/497 | 122 | 128 | M8 | HSA-MIR-15A脑 | uagcagcacauaugguugug |
| HSA-MIR-16脑 | uagcagcacguaaauauuggcg | ||||
| HSA-MIR-15B脑 | uagcagcacaucaugguuaca | ||||
| HSA-MIR-195SZ | uagcagaaaaauauuggc | ||||
| HSA-MIR-424 | Cagcagcaauucauguuuugaa | ||||
| HSA-MIR-497 | cagcagcacacuguguuugu | ||||
| mir-203.1 | 775 | 781 | 1a | HSA-MIR-203 | ugaaauguuuaggaccacuag |
| mir-218 | 627 | 634 | 1A，M8 | HSA-MIR-218脑 | uugugcuugaucuaaccaugu |
| mir-29 | 965 | 971 | 1a | HSA-MIR-29ASZ | uagcaccaucugaaaucgguu |
| HSA-MIR-29BSZ | uagcaccauuugaaaucaguguu | ||||
| HSA-MIR-29CSZ | uagcaccauuugaaaucggu | ||||
| mir-320 | 36 | 42 | M8 | HSA-MIR-320 | aaaagcugggugagaggggcgaa |
| mir-330 | 281 | 287 | M8 | HSA-MIR-330脑 | GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA |
| mir-365 | 143 | 149 | 1a | HSA-MIR-365 | uaaugccccuaaaaaauccuuau |
| mir-539 | 4 | 10 | M8 | HSA-MIR-539 | ggagaauuauccuuggugugu |