基因页：MAPK3

概括?
GeneID 5595
象征 MAPK3
Synonyms ERK-1|ERK1|ERT2|HS44KDAP|HUMKER1A|P44ERK1|P44MAPK|PRKM3|p44-ERK1|p44-MAPK
Description mitogen-activated protein kinase 3
Reference MIM：601795|HGNC：HGNC：6877|ENSEMBL：ENSG00000102882|HPRD:03479|Vega：Otthumg00000132149
基因类型 protein-coding
地图位置 16p11.2
Pascal p-value 1.32E-5
Sherlock P值 0.474
Fetal beta -1.207
eGene 皮质
额叶皮质BA9
Meta
支持 canabinoid
多巴胺
INTRACELLULAR SIGNAL TRANSDUCTION
METABOTROPIC GLUTAMATE RECEPTOR
SEROTONIN
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2Cdb.humanNRC
G2CDB.HUMANPSP
CompositeSet
潜在的突触基因

数据源中的基因
基因集名称 Method of gene set Description Info
CNV:YES 拷贝数变异研究 Manual curation
CV:PGCnp 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur High-throughput literature-search PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） PSR：0.01775
Literature High-throughput literature-search 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击to show details
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献：0.1437

第一节遗传学和表观遗传学注释


Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

无法使用

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

Top 10 positively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
SLC16A12 0.74 0.59
RBM47 0.71 0.50
KCNJ13 0.70 0.31
CP 0.68 0.11
SLC35F5 0.67 0.64
SLC5A5 0.67 0.21
SLC13A4 0.66 0.19
prlr 0.65 0.43
ABCA4 0.65 0.28
ano6 0.65 0.68
Top 10 negatively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
AF347015.21 -0.35 -0.42
AC018755.7 -0.34 -0.48
MT-CO2 -0.33 -0.47
增强 -0.33 -0.47
MT1G -0.32 -0.45
CXCL14 -0.32 -0.42
IFI27 -0.32 -0.44
AL022328.1 -0.32 -0.35
S100A13 -0.32 -0.42
AF347015.33 -0.31 -0.43

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0000166 核苷酸结合 IEA -
GO:0004707 MAP kinase activity 经验 11741541
GO:0004707 MAP kinase activity IEA -
GO:0004707 MAP kinase activity nas 7687743
GO:0005515 protein binding IPI 15950189
GO:0005524 ATP结合 IEA -
GO:0005524 ATP结合 nas -
GO:0004672 蛋白激酶活性 IEA -
GO:0004674 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 经验 16626623
GO:0004674 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 IEA -
GO：0016740 transferase activity IEA -
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0006468 protein amino acid phosphorylation 艾达 7687743
GO:0006468 protein amino acid phosphorylation IEA -
GO:0007265 RAS蛋白信号转导 经验 11520933
去：0007049 细胞周期 IEA -
GO：0044419 生物之间的种间相互作用 IEA -
Cellular component 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005829 细胞质 经验 7739560
去：0005856 cytoskeleton 艾达 18029348
GO:0005575 cellular_component ND -
去：0005634 nucleus 艾达 18029348
去：0005654 核质 经验 9687510|11741541|16456541
|16626623|17322878
GO:0005730 核仁 艾达 18029348

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b Experimental Source PubMed ID
ARRB2 ARB2 |arr2 |Barr2 |DKFZP686L0365 逮捕，beta 2 Affinity Capture-Western BioGRID 12473660
ATF2 CRE-BP1 | CREB2 | HB16 | MGC111558 | TREB7 activating transcription factor 2 ERK1 interacts with and phosphorylates ATF2. 绑定 9155018
ATP1A1 MGC3285 | MGC51750 ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 1 polypeptide - HPRD，Biogrid 15069082
AVPR2 ADHR | DI1 | DIR | DIR3 | MGC126533 | MGC138386 | NDI | V2R arginine vasopressin receptor 2 Affinity Capture-Western BioGRID 12473660
Bcl3 BCL4 | D19S37 B细胞CLL/淋巴瘤3 Erk1 interacts with and phosphorylates BCL-3. 绑定 15469820
布拉夫 B-RAF1 | BRAF1 | FLJ95109 | MGC126806 | MGC138284 | RAFB1 v-raf murine sarcoma viral oncogene homolog B1 表型增强 BioGRID 10869359
C1QBP GC1QBP | HABP1 | SF2p32 | gC1Q-R | gC1qR | p32 补体组件1，Q子分量结合蛋白 - HPRD，Biogrid 11866440
CASP9 APAF-3 |apaf3 |caspase-9c |ICE-LAP6 |MCH6 caspase 9，与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 - HPRD 12792650
DAPK1 DAPK |DKFZP781I035 死亡相关蛋白激酶1 DAPK与ERK1相互作用。 绑定 15616583
DCC CRC18 |CRCR1 在结直肠癌中删除 - HPRD，Biogrid 11986622
DUSP1 Cl100 |HVH1 |MKP-1 |MKP1 |PTPN10 dual specificity phosphatase 1 - HPRD，Biogrid 11278799
DUSP10 MKP-5 | MKP5 dual specificity phosphatase 10 - HPRD 10597297
DUSP3 VHR dual specificity phosphatase 3 - HPRD，Biogrid 10224087
DUSP4 HVH2 |MKP-2 |mkp2 |典型 dual specificity phosphatase 4 Reconstituted Complex BioGRID 11387337
DUSP4 HVH2 |MKP-2 |mkp2 |典型 dual specificity phosphatase 4 - HPRD 7535768
DUSP5 dusp |HVH3 dual specificity phosphatase 5 - HPRD，Biogrid 7836374
DUSP6 mkp3 |PYST1 dual specificity phosphatase 6 - HPRD，Biogrid 9535927
ELK1 - ELK1, member of ETS oncogene family Elk-1 is phosphorylated by ERK-1. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between human Elk-1 and ERK-1 from an unspecified species. 绑定 9130707
ELK1 - ELK1, member of ETS oncogene family - HPRD 8208531|12473660
ELK1 - ELK1, member of ETS oncogene family Mapk3 (p44Mapk) phosphorylates Elk1 at Ser383. 绑定 15782123
ELK1 - ELK1, member of ETS oncogene family ERK1 interacts with and phosphorylates Elk1. This interaction was modelled on a demonstrated interaction between rat ERK1 and human Elk1. 绑定 9235954
ELK1 - ELK1, member of ETS oncogene family Elk-1 is phosphorylated by ERK-1. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between human Elk-1 and ERK-1 from an unspecified species. 绑定 9020136
ELK1 - ELK1, member of ETS oncogene family ERK1与ELK-1相互作用并磷酸化。 绑定 9155018
ELK1 - ELK1, member of ETS oncogene family Erk1 phosphorylates Elk-1. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between Erk1 and Elk-1 from an unspecified species. 绑定 10431817
ELK4 SAP1 ELK4，ETS域蛋白（SRF辅助蛋白1） SAP-1A被ERK-1磷酸化。这种相互作用是基于未指定物种的人类SAP-1A和ERK-1之间的相互作用进行建模的。 绑定 9020136
ELK4 SAP1 ELK4，ETS域蛋白（SRF辅助蛋白1） SAP-1A被ERK-1磷酸化。这种相互作用是基于未指定物种的人类SAP-1A和ERK-1之间的相互作用进行建模的。 绑定 9130707
epor MGC138358 红细胞生成素受体 - HPRD 12538595
ETV1 DKFZP781L0674 |ER81 |MGC104699 |MGC120533 |MGC120534 ETS变体1 Biochemical Activity BioGRID 11551945
GATA4 MGC126629 GATA结合蛋白4 - HPRD 11585926
GMFB GMF 胶质成熟因子，β - HPRD，Biogrid 8639570
gtf2i BAP-135 |BAP135 |BTKAP1 |diws |FLJ38776 |FLJ56355 |IB291 |自旋|tfii-i |WBS | WBSCR6 一般转录因子II，I - HPRD，Biogrid 10648599
HDAC4 HA6116 |HD4 |HDAC-A |hdaca |KIAA0288 histone deacetylase 4 - HPRD，Biogrid 11114188
hif1a HIF-1Alpha |HIF1 |hif1-alpha |mop1 |PASD8 低氧诱导因子1，α亚基（基本螺旋 - 环螺旋转录因子） - HPRD 10551817
嗯 CD168 | IHABP | MGC119494 | MGC119495 | RHAMM hyaluronan-mediated motility receptor (RHAMM) - HPRD 11403955
HSF1 HSTF1 热休克转录因子1 ERK1与HSF-1相互作用并磷酸化。 绑定 9155018
IER3 dif-2 |dif2 |Gly96 |IEX-1 |IEX-1L |IEX1 |PRG1 立即提早回应3 Affinity Capture-Western BioGRID 12356731
INSR CD220 | HHF5 胰岛素受体 - HPRD，Biogrid 11409918
IRX2 IRXA2 iroquois homeobox 2 IRX2与MAPK3（ERK1）相互作用。这种相互作用是建立在鸡IRX2和人MAPK3之间的相互作用上的模型。 绑定 15133517
JUN AP-1 | AP1 | c-Jun Jun Oncogene - HPRD，Biogrid 1922387
KSR2 FLJ25965 RAS 2的激酶抑制剂 - HPRD 12975377
LYN FLJ26625 | JTK8 V-YES-1 Yamaguchi肉瘤病毒相关的癌基因同源物 - HPRD，Biogrid 11131153
MAP2K1 mapkk1 |MEK1 |MKK1 |prkmk1 mitogen-activated protein kinase kinase 1 Affinity Capture-Western
Biochemical Activity
共定位
Reconstituted Complex
两个杂交		 BioGRID 8226933|8626767
|9006895|9733512
|10748187
MAP2K1 mapkk1 |MEK1 |MKK1 |prkmk1 mitogen-activated protein kinase kinase 1 MEK1通过MEK中保守的对接网站与ERK1互动 绑定 11134045
MAP2K1 mapkk1 |MEK1 |MKK1 |prkmk1 mitogen-activated protein kinase kinase 1 - HPRD 8226933|8626767
|10748187
MAP2K2 FLJ26075 | MAPKK2 | MEK2 | MKK2 | PRKMK2 mitogen-activated protein kinase kinase 2 - HPRD，Biogrid 8226933|8626767
MAP2K2 FLJ26075 | MAPKK2 | MEK2 | MKK2 | PRKMK2 mitogen-activated protein kinase kinase 2 MEK2 binds and activates ERK1. 绑定 11134045
MAP2K3 MAPKK3 | MEK3 | MKK3 | PRKMK3 mitogen-activated protein kinase kinase 3 - HPRD，Biogrid 8226933
MAP3K1 mapkkk1 |mekk |mekk1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1 MEKK1与ERK1相互作用。 绑定 12049732
MAPK14 CSBP1 |CSBP2 |CSPB1 |Exip |mxi2 |PRKM14 |PRKM15 |RK |SAPK2A |p38 | p38ALPHA 有丝分裂原激活的蛋白激酶14 - HPRD，Biogrid 12697810
MAPKSP1 map2k1ip1 |MAPBP |MP1 MAPK支架蛋白1 - HPRD，Biogrid 9733512
MKNK1 MNK1 MAP激酶相互作用丝氨酸/苏氨酸激酶1 ERK1与MNK1相互作用并磷酸化。 绑定 9155018
MKNK1 MNK1 MAP激酶相互作用丝氨酸/苏氨酸激酶1 Biochemical Activity BioGRID 9155018
我的C bHLHe39 | c-Myc V-myc骨髓质体病毒性癌基因同源物（禽类） Reconstituted Complex BioGRID 15210690
我的C bHLHe39 | c-Myc V-myc骨髓质体病毒性癌基因同源物（禽类） ERK1与C-MYC相互作用并磷酸化。 绑定 9155018
MYLK DKFZp686I10125 | FLJ12216 | KRP | MLCK | MLCK1 | MLCK108 | MLCK210 | MSTP083 | MYLK1 | smMLCK myosin light chain kinase - HPRD 10402467
PEA15 HMAT1 |hummat1h |Mat1 |Mat1h |豌豆15 |ped phosphoprotein enriched in astrocytes 15 - HPRD，Biogrid 11702783
PEA15 HMAT1 |hummat1h |Mat1 |Mat1h |豌豆15 |ped phosphoprotein enriched in astrocytes 15 PEA-15 interacts with ERK 1. 绑定 11702783
平台 DKFZp686I03148 | T-PA | TPA plasminogen activator, tissue - HPRD 15861134
PTPN5 FLJ14427 | PTPSTEP | STEP protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 5 (striatum-enriched) - HPRD，Biogrid 9857190
PTPN7 BPTP-4 |HEPTP |LC-PTP |LPTP |ptpni 蛋白质酪氨酸磷酸酶，非受体7型 - HPRD，Biogrid 10206983|10559944
ptprr DKFZP781C1038 |EC-PTP |FLJ34328 |MGC131968 |MGC148170 |PCPTP1 |PTP-SL |ptpbr7 |ptprq protein tyrosine phosphatase, receptor type, R - HPRD，Biogrid 9857190
RAF1 CRAF | NS5 | Raf-1 | c-Raf v-raf-1 murine leukemia viral oncogene homolog 1 Affinity Capture-Western BioGRID 11409918
RALGDS FLJ20922 | RGF | RalGEF ral guanine nucleotide dissociation stimulator ERK1 interacts with and phosphorylates RalGDS. 绑定 9155018
RPS6KA1 Hu-1 |mapkapk1a |RSK |RSK1 ribosomal protein S6 kinase, 90kDa, polypeptide 1 - HPRD，Biogrid 12832467
RPS6KA2 Hu-2 |mapkapk1c |RSK |RSK3 |s6k-alpha |s6k-alpha2 |P90-RSK3 |pp90rsk3 ribosomal protein S6 kinase, 90kDa, polypeptide 2 - HPRD，Biogrid 8939914
RPS6KA2 Hu-2 |mapkapk1c |RSK |RSK3 |s6k-alpha |s6k-alpha2 |P90-RSK3 |pp90rsk3 ribosomal protein S6 kinase, 90kDa, polypeptide 2 ERK1与P90-RSK2的未指定同工型相互作用并磷酸化。 绑定 9155018
RPS6KA3 CLS | HU-3 | ISPK-1 | MAPKAPK1B | MRX19 | RSK | RSK2 | S6K-alpha3 | p90-RSK2 | pp90RSK2 ribosomal protein S6 kinase, 90kDa, polypeptide 3 - HPRD 12832467
RPS6KA3 CLS | HU-3 | ISPK-1 | MAPKAPK1B | MRX19 | RSK | RSK2 | S6K-alpha3 | p90-RSK2 | pp90RSK2 ribosomal protein S6 kinase, 90kDa, polypeptide 3 Affinity Capture-Western BioGRID 8939914
RPS6KA4 MSK2 |RSK-B ribosomal protein S6 kinase, 90kDa, polypeptide 4 - HPRD，Biogrid 9792677
SNCA MGC110988 |NACP |park1 |park4 |PD1 突触核蛋白，α（淀粉样蛋白前体的非A4成分） Affinity Capture-Western BioGRID 12121974
SNCG BCSG1 | SR 突触核蛋白，伽马（乳腺癌特异性蛋白1） Affinity Capture-Western BioGRID 12121974
SORBS3 SCAM-1 | SCAM1 | SH3D4 | VINEXIN 山梨糖和SH3 domain containing 3 - HPRD 15184391
SPIB SPI-B SPI-B转录因子（SPI-1/PU.1相关） - HPRD，Biogrid 8632909
SREBF1 SREBP-1C |SREBP1 |BHLHD1 sterol regulatory element binding transcription factor 1 Biochemical Activity BioGRID 10627507
SREBF2 SREBP2 |BHLHD2 sterol regulatory element binding transcription factor 2 - HPRD，Biogrid 10627507
TAL2 BHLHA19 T-cell acute lymphocytic leukemia 2 - HPRD 8152805
Th TYH 酪氨酸羟化酶 - HPRD，Biogrid 1347949
TNFSF11 CD254 | ODF | OPGL | OPTB2 | RANKL | TRANCE | hRANKL2 | sOdf 肿瘤坏死因子（配体）超家族，成员11 - HPRD 10635328
TOP2B TOPIIB | top2beta 拓扑异构酶（DNA）II Beta 180KDA ERK1与拓扑异构酶II-BetA相互作用并磷酸化。 绑定 9155018
TP53 FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 肿瘤蛋白p53 - HPRD，Biogrid 10958792
UBR5 DD5 | EDD | EDD1 | FLJ11310 | HYD | KIAA0896 | MGC57263 泛素蛋白连接酶E3成分N-验证蛋白5 Affinity Capture-Western BioGRID 12594221
ZNF7 FLJ38706 |HF.16 |kox4 |ZF30 zinc finger protein 7 ERK1与ZnF7相互作用并磷酸化。 绑定 9155018


V.途径注释

路径名 Pathway size # SZGR 2.0 genes in pathway Info
KEGG MAPK SIGNALING PATHWAY 267 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ERBB SIGNALING PATHWAY 87 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG CHEMOKINE SIGNALING PATHWAY 190 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG OOCYTE MEIOSIS 114 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG MTOR SIGNALING PATHWAY 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg血管平滑肌收缩 115 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg dorso腹轴形成 25 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg tgf beta信号通路 86 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG轴突指导 129 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg vegf信号通路 76 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG FOCAL ADHESION 201 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ADHERENS JUNCTION 75 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg间隙交界处 90 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg Toll像受体信号通路 102 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg点头喜欢受体信号通路 62 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg天然杀伤细胞介导的细胞毒性 137 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG T CELL RECEPTOR SIGNALING PATHWAY 108 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG B细胞受体信号通路 75 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG FC EPSILON RI SIGNALING PATHWAY 79 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg fc伽马r介导的吞噬作用 97 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG LONG TERM POTENTIATION 70 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG NEUROTROPHIN SIGNALING PATHWAY 126 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG长期抑郁症 70 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌动蛋白细胞骨架的KEGG调节 216 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG INSULIN SIGNALING PATHWAY 137 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg gnRH信号通路 101 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG PROGESTERONE MEDIATED OOCYTE MATURATION 86 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG MELANOGENESIS 102 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG II型糖尿病 47 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG醛固酮调节的钠重吸收 42 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg阿尔茨海默氏病 169 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg Prion疾病 35 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg Leishmania感染 72 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
癌症中的KEGG途径 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG结直肠癌 62 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG肾细胞癌 70 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg胰腺癌 70 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG子宫内膜癌 52 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG GLIOMA 65 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG PROSTATE CANCER 89 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG THYROID CANCER 29 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG MELANOMA 71 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG BLADDER CANCER 42 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG CHRONIC MYELOID LEUKEMIA 73 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ACUTE MYELOID LEUKEMIA 60 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG非小细胞肺癌 54 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA AGR PATHWAY 36 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta AT1R途径 36 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta SPPA途径 22 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta BCR途径 37 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA BIOPEPTIDES PATHWAY 45 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA CDMAC PATHWAY 16 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA CCR3 PATHWAY 23 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta神经酰胺途径 22 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA CXCR4 PATHWAY 24 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA EGF PATHWAY 31 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta EPO途径 19 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA ECM PATHWAY 24 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta ERK途径 28 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA FCER1 PATHWAY 41 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta FMLP途径 39 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA GH PATHWAY 28 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta MPR途径 34 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta HCMV途径 17 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta IGF1途径 21 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA IL2 PATHWAY 22 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta IL3途径 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta IL6途径 22 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta IL2RB途径 38 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta RaccyCD途径 26 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Gleevec途径 23 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
生物卡塔胰岛素途径 22 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta整联蛋白途径 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
生物质体角质形成细胞途径 46 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA PYK2 PATHWAY 31 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA MAPK PATHWAY 87 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta McAlpain途径 25 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA PPARA PATHWAY 58 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta IGF1R途径 23 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta NGF途径 18 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA NFAT PATHWAY 56 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA PDGF PATHWAY 32 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA EDG1 PATHWAY 27 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta CDK5途径 11 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA PTEN PATHWAY 18 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta RAS途径 23 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta nkcells途径 20 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta坏路 26 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta EIF4途径 24 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Dream Pathway 14 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA HER2 PATHWAY 22 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA ERK5 PATHWAY 18 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA MAL PATHWAY 19 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA BARR MAPK PATHWAY 12 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA BARRESTIN SRC PATHWAY 15 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA MET PATHWAY 37 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA GPCR PATHWAY 37 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA SPRY PATHWAY 18 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta TCR途径 49 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA TGFB PATHWAY 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta TPO途径 24 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Creb途径 27 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta TFF途径 21 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST DIFFERENTIATION PATHWAY IN PC12 CELLS 45 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SA B CELL RECEPTOR COMPLEXES 24 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST ERK1 ERK2 MAPK途径 32 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SIG CD40PATHWAYMAP 34 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SIG IL4RECEPTOR IN B LYPHOCYTES 27 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SIG INSULIN RECEPTOR PATHWAY IN CARDIAC MYOCYTES 51 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SIG BCR信号通路 46 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SA PTEN途径 17 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FCER1途径 62 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ENDOTHELIN PATHWAY 63 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID BCR 5 Pathway 65 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PRL SIGNALING EVENTS PATHWAY 23 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB4途径 38 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID GMCSF途径 37 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID MET PATHWAY 80 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID S1P S13途径 29 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID EPHB FWD PATHWAY 40 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AVB3 OPN途径 31 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID S1P S1P4途径 14 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PS1 PATHWAY 46 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TRAIL PATHWAY 28 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CDC42 PATHWAY 70 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID RET PATHWAY 39 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ANGIOPOIETIN RECEPTOR PATHWAY 50 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID S1P S1P1 PATHWAY 21 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TELOMERASE PATHWAY 68 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Netrin途径 32 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID NFAT 3PATHWAY 54 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid reg gr途径 82 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ARF6 DOWNSTREAM PATHWAY 15 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID MTOR 4 Pathway 69 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL2 1 Pathway 55 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB1受体近端途径 35 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TCR RAS PATHWAY 14 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CERAMIDE PATHWAY 48 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AVB3整合素途径 75 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IFNG途径 40 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB1 DOWNSTREAM PATHWAY 105 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ATF2 PATHWAY 59 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB2 ERBB3途径 44 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ALK1途径 26 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PDGFRB PATHWAY 129 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TRKR途径 62 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Syndecan 1途径 46 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID RETINOIC ACID PATHWAY 30 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AR NONGENOMIC PATHWAY 31 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CXCR3途径 43 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID VEGFR1 PATHWAY 26 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID SMAD2 3PATHWAY 17 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID KIT PATHWAY 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID VEGFR1 2 PATHWAY 69 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID SYNDECAN 2 PATHWAY 33 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID炭疽路径 17 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID S1P S1P2途径 24 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID MAPK TRK PATHWAY 34 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CD8 TCR下游途径 65 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID LYMPH ANGIOGENESIS PATHWAY 25 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ALPHA SYNUCLEIN PATHWAY 33 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FGF途径 55 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NGF的Reactome信号传导 217 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY SCF KIT 78 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SPRY REGULATION OF FGF SIGNALING 14 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GROWTH HORMONE RECEPTOR SIGNALING 24 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Trif介导的TLR3信号传导 74 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NEGATIVE REGULATION OF FGFR SIGNALING 37 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB4的Reactome信号传导 90 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ANTIVIRAL MECHANISM BY IFN STIMULATED GENES 66 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2的Reactome信号传导 101 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GRB2 EVENTS IN ERBB2 SIGNALING 22 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY EGFR IN CANCER 109 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SHC1 EVENTS IN ERBB4 SIGNALING 20 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INSULIN RECEPTOR SIGNALLING CASCADE 87 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ARMS MEDIATED ACTIVATION 17 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome长时间ERK激活事件 19 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALLING TO RAS 27 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NGF SIGNALLING VIA TRKA FROM THE PLASMA MEMBRANE 137 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALLING TO ERKS 36 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY FGFR IN DISEASE 127 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome通过RIT和RIN向p38发出信号 15 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胃胃CREB信号传导途径通过PKC和MAPK 205 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome核事件激酶和转录因子激活 24 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Erk被灭活 12 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
egfr信号中的Reactome SHC1事件 15 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ERK MAPK TARGETS 21 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol I转录 89 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY PDGF 122 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DOWNSTREAM SIGNAL TRANSDUCTION 95 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TRANSCRIPTION 210 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Axon指导 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NCAM信号传导，用于神经突的生长 64 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome FRS2介导的级联 36 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DOWNSTREAM SIGNALING OF ACTIVATED FGFR 100 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME MAP KINASE ACTIVATION IN TLR CASCADE 50 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AP1转录因子系列的反应组激活 10 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome MAPK靶向由MAP激酶介导的核事件 30 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME RNA POL I RNA POL III AND MITOCHONDRIAL TRANSCRIPTION 122 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME THROMBIN SIGNALLING THROUGH PROTEINASE ACTIVATED RECEPTORS PARS 32 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome L1CAM相互作用 86 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ILS的Reactome信号传导 107 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNAL TRANSDUCTION BY L1 34 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol I启动子开口 62 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Traf6在TLR7 8或9激活上介导的NFKB和MAP激酶的诱导 77 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ADVANCED GLYCOSYLATION ENDPRODUCT RECEPTOR SIGNALING 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INTERFERON SIGNALING 159 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NFKB AND MAP KINASES ACTIVATION MEDIATED BY TLR4 SIGNALING REPERTOIRE 72 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME IL 2 SIGNALING 41 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胰岛素受体的反应组信号传导 108 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNAL ATTENUATION 14 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SOS介导的信号传导 14 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME HEMOSTASIS 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME RAF MAP KINASE CASCADE 10 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SHC介导的信号传导 15 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome myd88 mal级联反应于质膜发起 83 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome先天免疫系统 279 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome激活的TLR4信号传导 93 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME IMMUNE SYSTEM 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TOLL RECEPTOR CASCADES 118 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome血小板激活信号传导和聚集 208 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY FGFR 112 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SHC相关事件 17 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU CMYB TARGETS UP 165 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞 233 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION ERYTHROCYTE UP 157 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTIN INTERACT WITH HDAC 44 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LOPEZ MBD TARGETS 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shin B细胞淋巴瘤簇8 36 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWN MYELOID CELL DEVELOPMENT UP 165 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ThEILGAARD NEUTROPHIL AT SKIN WOUND DN 225 163 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KUMAR TARGETS OF MLL AF9 FUSION 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莫迪海马后产后 63 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ouyang前列腺癌进展DN 21 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TSUDA ALVEOLAR SOFT PART SARCOMA 10 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS UP 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAPOSI LIVER CANCER MET UP 18 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FONTAINE PAPILLARY THYROID CARCINOMA DN 80 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG REGULATED BY MYC DN 253 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金所有障碍OLIGODENDROCYTE NUMBER CORR UP 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM ALL DISORDERS DURATION CORR DN 146 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG ADIPOGENESIS BY BMP7 14 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因

部分VI. microRNA注释

mirna家族 Target position miRNA ID miRNA seq
UTR start UTR end Match method
miR-15/16/195/424/497 388 394 M8 hsa-miR-15abrain uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16brain UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG
hsa-miR-15bbrain UAGCAGCACAUCAUGGUUUACA
hsa-miR-195SZ UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC
HSA-MIR-424 CAGCAGCAAUUCAUGUUUUGAA
HSA-MIR-497 CAGCAGCACACUGUGGUUUGU
hsa-miR-15abrain uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16brain UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG
hsa-miR-15bbrain UAGCAGCACAUCAUGGUUUACA
hsa-miR-195SZ UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC
HSA-MIR-424 CAGCAGCAAUUCAUGUUUUGAA
HSA-MIR-497 CAGCAGCACACUGUGGUUUGU
mir-205 108 114 1A HSA-MIR-205 UCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG
miR-7 120 126 1A HSA-MIR-7SZ Uggaagacuaguuuuuguug