基因页面:SEPT3
总结吗?
GeneID | 55964年 |
象征 | SEPT3 |
同义词 | SEP3 | bK250D10.3 |
描述 | septin 3 |
参考 | MIM: 608314|HGNC: HGNC: 10750|运用:ENSG00000100167|HPRD: 10515|织女:OTTHUMG00000030494 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 22 q13.2 |
帕斯卡假定值 | 7.165 e-9 |
夏洛克假定值 | 0.719 |
支持 | 蛋白质聚类 G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSENSUS G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS G2Cdb.humanPSD G2Cdb.humanPSP CompositeSet 达内尔FMRP目标 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SEPT3_DE_GTEx.png)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0003674 | molecular_function | ND | - - - - - - | |
去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005525 | 三磷酸鸟苷结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0000910 | 胞质分裂 | NAS | - - - - - - | |
去:0007049 | 细胞周期 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0019717 | 突触体 | 国际能源机构 | Synap,大脑(术语层面:7) | - - - - - - |
去:0045202 | 突触 | 国际能源机构 | Synap神经元,神经递质,神经胶质(术语层面:2) | - - - - - - |
去:0005634 | 核 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005886 | 等离子体膜 | 艾达 | 18029348 | |
去:0030054 | 细胞结 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0031105 | septin复杂 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
罗德里格斯DCC DN的目标 | 121年 | 84年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由阿霉素GRAESSMANN细胞凋亡 | 1142年 | 669年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
伊万诺娃造血干细胞 | 254年 | 164年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
棕熊短波紫外线反应通过TP53 D组 | 280年 | 158年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ZWANG仅由二EGF脉冲瞬变 | 1725年 | 838年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
miR-103/107 | 49 | 55 | 1 | hsa - mir - 103大脑 | AGCAGCAUUGUACAGGGCUAUGA |
hsa - mir - 107大脑 | AGCAGCAUUGUACAGGGCUAUCA | ||||
mir - 137 | 760年 | 766年 | 1 | hsa - mir - 137 | UAUUGCUUAAGAAUACGCGUAG |
mir - 181 | 914年 | 920年 | m8 | hsa - mir - 181 a大脑 | AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU |
hsa - mir - 181 b深圳 | AACAUUCAUUGCUGUCGGUGGG | ||||
hsa - mir - 181 c大脑 | AACAUUCAACCUGUCGGUGAGU | ||||
hsa - mir - 181 d大脑 | AACAUUCAUUGUUGUCGGUGGGUU | ||||
mir - 203.1 | 6 | 12 | 1 | hsa - mir - 203 | UGAAAUGUUUAGGACCACUAG |
mir - 224 | 1025年 | 1031年 | m8 | hsa - mir - 224 | CAAGUCACUAGUGGUUCCGUUUA |
miR-23 | 824年 | 830年 | m8 | hsa-miR-23a大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC |
hsa-miR-23b大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUACC | ||||
mir - 323 | 823年 | 830年 | 1、m8 | hsa - mir - 323大脑 | GCACAUUACACGGUCGACCUCU |
mir - 324 - 5 - p | 1085年 | 1092年 | 1、m8 | hsa - mir - 324 - 5 - p | CGCAUCCCCUAGGGCAUUGGUGU |
mir - 328 | 55 | 62年 | 1、m8 | hsa - mir - 328大脑 | CUGGCCCUCUCUGCCCUUCCGU |
miR-34/449 | 938年 | 944年 | m8 | hsa-miR-34a大脑 | UGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUU |
hsa-miR-34c | AGGCAGUGUAGUUAGCUGAUUGC | ||||
hsa - mir - 449 | UGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGU | ||||
hsa - mir - 449 b | AGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGC | ||||
mir - 342 | 439年 | 445年 | m8 | hsa - mir - 342大脑 | UCUCACACAGAAAUCGCACCCGUC |
mir - 493 - 5 - p | 1224年 | 1230年 | 1 | hsa - mir - 493 - 5 - p | UUGUACAUGGUAGGCUUUCAUU |
mir - 543 | 915年 | 921年 | m8 | hsa - mir - 543 | AAACAUUCGCGGUGCACUUCU |