基因页：GNG12

概括?
基因ID 55970
Symbol GNG12
同义词 -
描述 Gprotein subunit gamma 12
参考 MIM:615405|HGNC：HGNC：19663|Ensembl:ENSG00000172380|HPRD:13592|Vega:OTTHUMG00000009545
基因type protein-coding
地图位置 1p31.3
Pascal P值 5.718E-4
Fetal beta -0.133
DMG 1（＃研究）
eGene 额叶皮质BA9
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 canabinoid
DOPAMINE
G-PROTEIN RELAY
代谢性谷氨酸受体
SEROTONIN
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS
g2cdb.humanpsd
G2Cdb.humanPSP

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24). 1
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） PSR：0.02692

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 Chromosome Position Nearest gene P (dis) beta（dis） FDR (dis) Study
cg23232299 1 68212170 GNG12 5.81E-4 0.511 0.049 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID Chromosome Position eGene 基因Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
rs12447283 chr16 65595638 GNG12 55970 0.07 trans

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
NDST2 0.94 0.95
KDM2A 0.92 0.94
DEPDC5 0.92 0.93
GBF1 0.92 0.93
HMGXB3 0.91 0.94
PPRC1 0.91 0.93
ZNF142 0.91 0.93
GGA3 0.90 0.93
C22orf30 0.90 0.92
LZTR1 0.90 0.91
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
AF347015.31 -0.74 -0.77
MT-CO2 -0.73 -0.77
AF347015.21 -0.73 -0.84
AF347015.8 -0.70 -0.75
higd1b -0.70 -0.76
MT-CYB -0.70 -0.72
AF347015.27 -0.70 -0.74
AF347015.33 -0.69 -0.70
GNG11 -0.68 -0.77
FXYD1 -0.67 -0.71

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0004871 signal transducer activity IEA -
Biological process GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0007186 G-protein coupled receptor protein signaling pathway IEA -
去：0007165 signal transduction 塔斯 10819326
GO:0009755 hormone-mediated signaling EXP 12626323
细胞分量 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0005834 heterotrimeric G-protein complex IEA -
GO:0005886 质膜 IEA -

V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
KEGG MAPK SIGNALING PATHWAY 267 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG CHEMOKINE SIGNALING PATHWAY 190 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG REGULATION OF ACTIN CYTOSKELETON 216 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GASTRIN CREB SIGNALLING PATHWAY VIA PKC AND MAPK 205 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
跨化学突触的反应组传播 186 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经元系统 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME能量代谢的集成 120 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME OPIOID SIGNALLING 78 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NEUROTRANSMITTER RECEPTOR BINDING AND DOWNSTREAM TRANSMISSION IN THE POSTSYNAPTIC CELL 137 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME G PROTEIN ACTIVATION 27 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TRANSMEMBRANE TRANSPORT OF SMALL MOLECULES 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
代谢调节中的反应组胰高血糖素信号传导 34 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胰岛素分泌的反应组调节BY GLUCAGON LIKE PEPTIDE1 43 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME G ALPHA Q SIGNALLING EVENTS 184 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胰岛素分泌的反应组调节 93 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INHIBITION OF INSULIN SECRETION BY ADRENALINE NORADRENALINE 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome B类2 Secralin家族受体 88 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GLUCAGON TYPE LIGAND RECEPTORS 33 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha1213信号传导事件 74 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ADP SIGNALLING THROUGH P2RY1 25 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G Beta伽马通过PLC Beta发出信号 20 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha I信号事件 195 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME G BETA GAMMA SIGNALLING THROUGH PI3KGAMMA 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME G ALPHA S SIGNALLING EVENTS 121 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME G ALPHA Z SIGNALLING EVENTS 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME G PROTEIN BETA GAMMA SIGNALLING 28 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNAL AMPLIFICATION 31 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME THROMBOXANE SIGNALLING THROUGH TP RECEPTOR 23 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ADP SIGNALLING THROUGH P2RY12 21 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ACTIVATION OF KAINATE RECEPTORS UPON GLUTAMATE BINDING 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GPCR LIGAND BINDING 408 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME THROMBIN SIGNALLING THROUGH PROTEINASE ACTIVATED RECEPTORS PARS 32 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome血小板稳态 78 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Aquaporin介导的运输 51 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PROSTACYCLIN SIGNALLING THROUGH PROSTACYCLIN RECEPTOR 19 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME REGULATION OF WATER BALANCE BY RENAL AQUAPORINS 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过GBETA伽马亚基对电压门控Ca2通道的反应组抑制 25 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GABA B RECEPTOR ACTIVATION 38 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GABA受体激活 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME HEMOSTASIS 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome钾通道 98 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组向内纠正K通道 31 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PLATELET ACTIVATION SIGNALING AND AGGREGATION 208 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌，LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS MESENCHYMAL DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC1 TARGETS UP 457 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC3 TARGETS DN 536 332 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA ANAPLASTIC UP 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
liang造血细胞数量大与微小 44 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI WILMS TUMOR VS FETAL KIDNEY 1 UP 182 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAGI AML SURVIVAL 129 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MLL AF9融合的Kumar目标 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IVANOVA HEMATOPOIESIS LATE PROGENITOR 544 307 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LU AGING BRAIN UP 262 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制新皮层DN 88 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILD CTNNB1致癌特征 82 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 393 244 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMUNDSON POOR SURVIVAL AFTER GAMMA RADIATION 8G 95 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄达沙替尼的抵抗 81 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALONSO METASTASIS UP 198 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PASINI SUZ12 TARGETS DN 315 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TORCHIA TARGETS OF EWSR1 FLI1 FUSION DN 321 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOINUMA TARGETS OF SMAD2 OR SMAD3 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja Islet HNF1A靶向DN 109 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由SALL4同工型绑定的RAO A 182 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOUDOUKHA BOUND BY IGF2BP2 111 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family 目标位置 mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
mir-128 3799 3805 1A HSA-MIR-128A UCACAGUGAACCGGUCUCUUUU
HSA-MIR-128B UCACAGUGAACCGGUCUCUUUC
mir-22 832 838 m8 HSA-MIR-22脑 AAGCUGCCAGUUGAAGAACUGU
mir-27 3799 3805 m8 hsa-miR-27a脑 UUCACAGUGGCUAAGUUCCGC
hsa-miR-27b脑 uucacaguggcuaaguucugc
mir-29 3527 3534 1A,m8 hsa-miR-29aSZ uagcaccaucugaaaucgguu
hsa-miR-29bSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
hsa-miR-29cSZ UAGCACCAUUUGAAAUCGGU
miR-409-5p 85 92 1A,m8 hsa-miR-409-5p AGGUUACCCGAGCAACUUUGCA