概括
基因 56000
象征 NXF3
同义词 -
描述 核RNA输出因子3
参考 MIM:300316|HGNC:HGNC:8073|Ensembl:ENSG00000147206|HPRD:02261|Vega:Otthumg00000022088
基因类型 蛋白质编码
地图位置 XQ22
胎儿β 0.023
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
NXF3 Chrx 102337238 一种 G NM_022052 p.279c> r 错过 精神分裂症 DNM:Fromer_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Bola1 0.81 0.77
thap7 0.80 0.81
C19orf50 0.80 0.76
commd4 0.80 0.79
Galk1 0.79 0.78
C17orf81 0.77 0.72
PEX10 0.76 0.77
C7orf47 0.76 0.70
SIVA1 0.76 0.75
FAM96B 0.76 0.73
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-ATP8 -0.42 -0.40
AF347015.8 -0.40 -0.35
AF347015.18 -0.39 -0.38
AF347015.26 -0.38 -0.35
AF347015.27 -0.38 -0.36
AF347015.15 -0.38 -0.34
mt-cyb -0.38 -0.34
AF347015.2 -0.36 -0.31
MT-CO2 -0.36 -0.31
AF347015.31 -0.35 -0.31

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wagschal EHMT2靶向 13 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ewsr1 fli1融合的骨靶标 271 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durand Stroma S向上 297 194 该途径中的所有SZGR 2.0基因