基因页:NXF3
概括?
基因 | 56000 |
象征 | NXF3 |
同义词 | - |
描述 | 核RNA输出因子3 |
参考 | MIM:300316|HGNC:HGNC:8073|Ensembl:ENSG00000147206|HPRD:02261|Vega:Otthumg00000022088 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | XQ22 |
胎儿β | 0.023 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NXF3 | Chrx | 102337238 | 一种 | G | NM_022052 | p.279c> r | 错过 | 精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NXF3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Bola1 | 0.81 | 0.77 |
thap7 | 0.80 | 0.81 |
C19orf50 | 0.80 | 0.76 |
commd4 | 0.80 | 0.79 |
Galk1 | 0.79 | 0.78 |
C17orf81 | 0.77 | 0.72 |
PEX10 | 0.76 | 0.77 |
C7orf47 | 0.76 | 0.70 |
SIVA1 | 0.76 | 0.75 |
FAM96B | 0.76 | 0.73 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-ATP8 | -0.42 | -0.40 |
AF347015.8 | -0.40 | -0.35 |
AF347015.18 | -0.39 | -0.38 |
AF347015.26 | -0.38 | -0.35 |
AF347015.27 | -0.38 | -0.36 |
AF347015.15 | -0.38 | -0.34 |
mt-cyb | -0.38 | -0.34 |
AF347015.2 | -0.36 | -0.31 |
MT-CO2 | -0.36 | -0.31 |
AF347015.31 | -0.35 | -0.31 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wagschal EHMT2靶向 | 13 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ewsr1 fli1融合的骨靶标 | 271 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Durand Stroma S向上 | 297 | 194 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |