Gene Page:MAPK10
Summary？
| 基因 | 5602 |
| 象征 | MAPK10 |
| Synonyms | JNK3|JNK3A|PRKM10|SAPK1b|p493F12|p54bSAPK |
| Description | 有丝分裂原激活的蛋白激酶10 |
| Reference | MIM：602897|HGNC:HGNC:6872|ENSEMBL：ENSG00000109339|HPRD：04207|Vega：Otthumg00000130604 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| Map location | 4Q22.1-Q23 |
| Pascal p-value | 0.007 |
| Sherlock p-value | 0.637 |
| 胎儿β | -1.557 |
| DMG | 1(# studies) |
| 主持人 | Caudate basal ganglia Myers' cis & trans 元 |
| Support | G2CDB.HUMANNRC 潜在的突触基因 |
Gene in Data Sources
| 基因集名称 | Method of gene set | Description | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV:GWASdb | Genome-wide Association Studies | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| CV:PGCnp | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
差异甲基化基因
差异甲基化基因| Probe | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | Beta (dis) | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg26564072 | 4 | 86997288 | MAPK10 | 4.015E-4 | -0.291 | 0.044 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs17432613 | CHR1 | 18346091 | MAPK10 | 5602 | 0.16 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| Gene | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| CDH13 | 0.81 | 0.84 |
| LRRC4C | 0.81 | 0.85 |
| TM6SF1 | 0.81 | 0.84 |
| AC012652.1 | 0.81 | 0.85 |
| CCDC85A | 0.81 | 0.85 |
| FAM19A1 | 0.80 | 0.81 |
| OXCT1 | 0.79 | 0.84 |
| FGF12 | 0.79 | 0.86 |
| jazf1 | 0.79 | 0.79 |
| MCHR2 | 0.78 | 0.76 |
| 十大negatively co-expressed genes | ||
| Gene | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Rab13 | -0.45 | -0.57 |
| AP002478.3 | -0.45 | -0.49 |
| AL139819.3 | -0.43 | -0.43 |
| AF347015.18 | -0.43 | -0.43 |
| AF347015.26 | -0.43 | -0.37 |
| ACSF2 | -0.42 | -0.45 |
| AF347015.21 | -0.42 | -0.37 |
| Trip6 | -0.42 | -0.45 |
| phyhd1 | -0.42 | -0.47 |
| AF347015.2 | -0.41 | -0.35 |
Section IV. Protein-protein interaction annotation
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| ARRB1 | ARB1 |arr1 | arrestin, beta 1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11356842 |
| ARRB2 | ARB2 |arr2 |Barr2 |DKFZP686L0365 | arrestin, beta 2 | - | HPRD,BioGRID | 11090355|11356842 |
| ARRB2 | ARB2 |arr2 |Barr2 |DKFZP686L0365 | arrestin, beta 2 | - | HPRD | 11090355 |
| CDKN2A | ARF | CDK4I | CDKN2 | CMM2 | INK4 | INK4a | MLM | MTS1 | TP16 | p14 | p14ARF | p16 | p16INK4 | p16INK4a | p19 | cyclin-dependent kinase inhibitor 2A (melanoma, p16, inhibits CDK4) | CDKN2A（P16INK4A）与MAPK10相互作用（JNK3） | 绑定 | 16007099 |
| DUSP1 | CL100 | HVH1 | MKP-1 | MKP1 | PTPN10 | 双重特异性磷酸酶1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11359773 |
| DUSP10 | MKP-5 |MKP5 | 双重特异性磷酸酶10 | - | HPRD,BioGRID | 11359773 |
| DUSP16 | KIAA1700 |MGC129701 |MGC129702 |MKP-7 |MKP7 | 双重特异性磷酸酶16 | - | HPRD,BioGRID | 11359773 |
| GTF3C1 | DKFZP686A111 |tfiiic |tfiiic220 |tfiiicalpha | 一般转录因子IIIC，多肽1，α220KDA | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| 六月 | AP-1 |AP1 |C-Jun | jun oncogene | MAPK10（JNK3）磷酸化JUN（C-JUN） | 绑定 | 16007099 |
| 六月 | AP-1 |AP1 |C-Jun | jun oncogene | JNK3Alpha2与C-Jun相互作用。 | 绑定 | 12167088 |
| 六月 | AP-1 |AP1 |C-Jun | jun oncogene | JNK3Alpha1与C-Jun相互作用。 | 绑定 | 12167088 |
| MAPK8IP2 | IB2 |JIP2 |prkm8ipl | 有丝分裂原激活的蛋白激酶8相互作用蛋白2 | 重构的复合物 | Biogrid | 10756100 |
| MAPK8IP3 | DKFZP762N1113 |FLJ00027 |JIP3 |JSAP1 |KIAA1066 |SYD2 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶8相互作用蛋白3 | - | HPRD,BioGRID | 10523642|10629060 |12189133 |
| SH3BP5 | SAB | SH3膜结合蛋白5（与BTK相关） | SAB与JNK3-Alpha-1相互作用。 | 绑定 | 12167088 |
| SH3BP5 | SAB | SH3膜结合蛋白5（与BTK相关） | SAB与JNK3-Alpha-2相互作用。 | 绑定 | 12167088 |
| SH3BP5 | SAB | SH3膜结合蛋白5（与BTK相关） | - | HPRD,BioGRID | 12167088 |
| STMN2 | SCG10 |SCGN10 |SGC10 | 类似于Stathmin的2 | 体外 | Biogrid | 11718727 |
| TP53 | FLJ92943 | LFS1 | TRP53 | p53 | 肿瘤蛋白p53 | - | HPRD,BioGRID | 9393873 |
| UNC119 | HRG4 | unc-119 homolog (C. elegans) | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |