基因页：barx1
概括？
| 基因 | 56033 |
| 象征 | barx1 |
| 同义词 | - |
| 描述 | Barx Homeobox 1 |
| 参考 | MIM：603260|HGNC：HGNC：955|ENSEMBL：ENSG00000131668|HPRD：16017|Vega：Otthumg00000020255 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 9Q12 |
| Pascal P值 | 7.118E-4 |
| 胎儿β | 0.279 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG14374754 | 9 | 96714295 | barx1 | 9.99e-10 | -0.013 | 1.17E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AP1G1 | 0.95 | 0.96 |
| TP53BP1 | 0.94 | 0.95 |
| MAP3K7 | 0.94 | 0.95 |
| CPSF6 | 0.94 | 0.95 |
| FBXO38 | 0.94 | 0.95 |
| DCTN4 | 0.94 | 0.95 |
| C4ORF41 | 0.94 | 0.95 |
| BCLAF1 | 0.94 | 0.97 |
| WHSC1L1 | 0.94 | 0.96 |
| PDS5A | 0.94 | 0.95 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FXYD1 | -0.80 | -0.86 |
| AF347015.31 | -0.78 | -0.85 |
| MT-CO2 | -0.78 | -0.86 |
| higd1b | -0.77 | -0.85 |
| ifi27 | -0.76 | -0.84 |
| AF347015.33 | -0.75 | -0.81 |
| mt-cyb | -0.73 | -0.81 |
| AC021016.1 | -0.73 | -0.78 |
| AF347015.21 | -0.73 | -0.84 |
| AF347015.8 | -0.73 | -0.83 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 哈马凋亡通过小径dn | 186 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mori成熟B淋巴细胞向上 | 90 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KIM胃癌化学敏感性 | 103 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕酮簇4的时间反应4 | 15 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |