概括
基因 5611
象征 DNAJC3
同义词 acphd | erdj6 | hp58 | p58 | p58ipk | prkri
描述 DNAJ热休克蛋白家族(HSP40)成员C3
参考 MIM:601184|HGNC:HGNC:9439|ENSEMBL:ENSG00000102580|HPRD:03114|Vega:Otthumg0000000017227
基因类型 蛋白质编码
地图位置 13Q32.1
Pascal P值 0.002
主持人 梭子基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS4773930 13 96529725 DNAJC3 ENSG00000102580.10 1.129E-6 0 200332 gtex_brain_putamen_basal
RS7333045 13 96539336 DNAJC3 ENSG00000102580.10 9.419E-7 0 209943 gtex_brain_putamen_basal
RS2389531 13 96550875 DNAJC3 ENSG00000102580.10 9.419E-7 0 221482 gtex_brain_putamen_basal
RS9561979 13 96563586 DNAJC3 ENSG00000102580.10 2.434E-6 0 234193 gtex_brain_putamen_basal
RS75199622 13 96564521 DNAJC3 ENSG00000102580.10 9.43e-7 0 235128 gtex_brain_putamen_basal
RS9525081 13 96570207 DNAJC3 ENSG00000102580.10 9.676E-7 0 240814 gtex_brain_putamen_basal
RS1980942 13 96576524 DNAJC3 ENSG00000102580.10 9.419E-7 0 247131 gtex_brain_putamen_basal
RS9525085 13 96578933 DNAJC3 ENSG00000102580.10 2.527E-6 0 249540 gtex_brain_putamen_basal
RS9525086 13 96579462 DNAJC3 ENSG00000102580.10 9.419E-7 0 250069 gtex_brain_putamen_basal
RS7992824 13 96580858 DNAJC3 ENSG00000102580.10 2.31E-6 0 251465 gtex_brain_putamen_basal
RS9516626 13 96586106 DNAJC3 ENSG00000102580.10 9.38e-7 0 256713 gtex_brain_putamen_basal
RS9525093 13 96589076 DNAJC3 ENSG00000102580.10 4.283E-6 0 259683 gtex_brain_putamen_basal
RS6492826 13 96595887 DNAJC3 ENSG00000102580.10 4.283E-6 0 266494 gtex_brain_putamen_basal
RS200323139 13 96598008 DNAJC3 ENSG00000102580.10 4.326E-6 0 268615 gtex_brain_putamen_basal
RS34756863 13 96598009 DNAJC3 ENSG00000102580.10 4.283E-6 0 268616 gtex_brain_putamen_basal
RS9525095 13 96600508 DNAJC3 ENSG00000102580.10 9.981E-7 0 271115 gtex_brain_putamen_basal
RS9525098 13 96605062 DNAJC3 ENSG00000102580.10 4.283E-6 0 275669 gtex_brain_putamen_basal
RS1996054 13 96607542 DNAJC3 ENSG00000102580.10 9.519E-7 0 278149 gtex_brain_putamen_basal
RS816139 13 96622673 DNAJC3 ENSG00000102580.10 5.014e-7 0 293280 gtex_brain_putamen_basal
RS2774113 13 96630320 DNAJC3 ENSG00000102580.10 1.936E-6 0 300927 gtex_brain_putamen_basal
RS566894 13 96630347 DNAJC3 ENSG00000102580.10 4.272E-6 0 300954 gtex_brain_putamen_basal
RS816143 13 96636784 DNAJC3 ENSG00000102580.10 9.086e-7 0 307391 gtex_brain_putamen_basal
RS521235 13 96647957 DNAJC3 ENSG00000102580.10 8.339e-7 0 318564 gtex_brain_putamen_basal
RS472788 13 96658855 DNAJC3 ENSG00000102580.10 8.021E-7 0 329462 gtex_brain_putamen_basal
RS590758 13 96668927 DNAJC3 ENSG00000102580.10 4.234E-7 0 339534 gtex_brain_putamen_basal
RS541811 13 96672110 DNAJC3 ENSG00000102580.10 8.36e-7 0 342717 gtex_brain_putamen_basal
RS551457 13 96674796 DNAJC3 ENSG00000102580.10 8.36e-7 0 345403 gtex_brain_putamen_basal
RS473930 13 96676124 DNAJC3 ENSG00000102580.10 8.36e-7 0 346731 gtex_brain_putamen_basal
RS544080 13 96676209 DNAJC3 ENSG00000102580.10 8.36e-7 0 346816 gtex_brain_putamen_basal
RS552598 13 96698990 DNAJC3 ENSG00000102580.10 8.225e-7 0 369597 gtex_brain_putamen_basal
RS67766134 13 96705833 DNAJC3 ENSG00000102580.10 7.273E-8 0 376440 gtex_brain_putamen_basal
RS561996 13 96706931 DNAJC3 ENSG00000102580.10 8.36e-7 0 377538 gtex_brain_putamen_basal
RS539604 13 96708108 DNAJC3 ENSG00000102580.10 8.323e-7 0 378715 gtex_brain_putamen_basal
RS493109 13 96709060 DNAJC3 ENSG00000102580.10 5.775E-7 0 379667 gtex_brain_putamen_basal
RS517173 13 96717364 DNAJC3 ENSG00000102580.10 2.564E-6 0 387971 gtex_brain_putamen_basal
RS592205 13 96719114 DNAJC3 ENSG00000102580.10 2.564E-6 0 389721 gtex_brain_putamen_basal
RS532399 13 96720476 DNAJC3 ENSG00000102580.10 2.564E-6 0 391083 gtex_brain_putamen_basal
RS506474 13 96722785 DNAJC3 ENSG00000102580.10 2.564E-6 0 393392 gtex_brain_putamen_basal
RS536606 13 96723774 DNAJC3 ENSG00000102580.10 2.564E-6 0 394381 gtex_brain_putamen_basal
RS531090 13 96724006 DNAJC3 ENSG00000102580.10 2.564E-6 0 394613 gtex_brain_putamen_basal
RS529306 13 96724189 DNAJC3 ENSG00000102580.10 2.563E-6 0 394796 gtex_brain_putamen_basal
RS527680 13 96746789 DNAJC3 ENSG00000102580.10 2.564E-6 0 417396 gtex_brain_putamen_basal
RS2849438 13 96768287 DNAJC3 ENSG00000102580.10 1.207E-6 0 438894 gtex_brain_putamen_basal
RS542834 13 96792150 DNAJC3 ENSG00000102580.10 2.684E-6 0 462757 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005488 捆绑 IEA -
去:0004860 蛋白激酶抑制剂活性 塔斯 7511204
GO:0031072 热激蛋白结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006986 对展开蛋白的反应 IEA -
去:0009615 对病毒的反应 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005737 细胞质 塔斯 8666242
去:0005783 内质网 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Biocarta RNA途径 10 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome糖尿病途径 133 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XBP1对伴侣基因的反应组激活 46 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome展开的蛋白质反应 80 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome流感生命周期 203 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome流感病毒RNA转录和复制 169 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basaki YBX1靶向DN 384 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9融合8D DN的Takeda目标 205 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶标C向上 170 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2B 392 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张对IKK抑制剂和TNF的反应 223 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MLL AF9融合的Kumar目标 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成12 36 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染10小时 101 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN 373 196 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein Cerebellum标记 85 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fujii YBX1靶向DN 202 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI葡萄糖剥夺 60 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移 221 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇8的时间反应8 49 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期G1 S 147 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
突变的TP53的Stambolsky靶标 49 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stambolsky对维生素D3的反应 84 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
phong tnf响应不是通过p38 337 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因