基因页:DNAJC3
概括?
基因 | 5611 |
象征 | DNAJC3 |
同义词 | acphd | erdj6 | hp58 | p58 | p58ipk | prkri |
描述 | DNAJ热休克蛋白家族(HSP40)成员C3 |
参考 | MIM:601184|HGNC:HGNC:9439|ENSEMBL:ENSG00000102580|HPRD:03114|Vega:Otthumg0000000017227 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 13Q32.1 |
Pascal P值 | 0.002 |
主持人 | 梭子基底神经节 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS4773930 | 13 | 96529725 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 1.129E-6 | 0 | 200332 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7333045 | 13 | 96539336 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 9.419E-7 | 0 | 209943 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2389531 | 13 | 96550875 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 9.419E-7 | 0 | 221482 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9561979 | 13 | 96563586 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 2.434E-6 | 0 | 234193 | gtex_brain_putamen_basal |
RS75199622 | 13 | 96564521 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 9.43e-7 | 0 | 235128 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9525081 | 13 | 96570207 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 9.676E-7 | 0 | 240814 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1980942 | 13 | 96576524 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 9.419E-7 | 0 | 247131 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9525085 | 13 | 96578933 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 2.527E-6 | 0 | 249540 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9525086 | 13 | 96579462 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 9.419E-7 | 0 | 250069 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7992824 | 13 | 96580858 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 2.31E-6 | 0 | 251465 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9516626 | 13 | 96586106 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 9.38e-7 | 0 | 256713 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9525093 | 13 | 96589076 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 4.283E-6 | 0 | 259683 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6492826 | 13 | 96595887 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 4.283E-6 | 0 | 266494 | gtex_brain_putamen_basal |
RS200323139 | 13 | 96598008 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 4.326E-6 | 0 | 268615 | gtex_brain_putamen_basal |
RS34756863 | 13 | 96598009 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 4.283E-6 | 0 | 268616 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9525095 | 13 | 96600508 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 9.981E-7 | 0 | 271115 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9525098 | 13 | 96605062 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 4.283E-6 | 0 | 275669 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1996054 | 13 | 96607542 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 9.519E-7 | 0 | 278149 | gtex_brain_putamen_basal |
RS816139 | 13 | 96622673 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 5.014e-7 | 0 | 293280 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2774113 | 13 | 96630320 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 1.936E-6 | 0 | 300927 | gtex_brain_putamen_basal |
RS566894 | 13 | 96630347 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 4.272E-6 | 0 | 300954 | gtex_brain_putamen_basal |
RS816143 | 13 | 96636784 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 9.086e-7 | 0 | 307391 | gtex_brain_putamen_basal |
RS521235 | 13 | 96647957 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 8.339e-7 | 0 | 318564 | gtex_brain_putamen_basal |
RS472788 | 13 | 96658855 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 8.021E-7 | 0 | 329462 | gtex_brain_putamen_basal |
RS590758 | 13 | 96668927 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 4.234E-7 | 0 | 339534 | gtex_brain_putamen_basal |
RS541811 | 13 | 96672110 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 8.36e-7 | 0 | 342717 | gtex_brain_putamen_basal |
RS551457 | 13 | 96674796 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 8.36e-7 | 0 | 345403 | gtex_brain_putamen_basal |
RS473930 | 13 | 96676124 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 8.36e-7 | 0 | 346731 | gtex_brain_putamen_basal |
RS544080 | 13 | 96676209 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 8.36e-7 | 0 | 346816 | gtex_brain_putamen_basal |
RS552598 | 13 | 96698990 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 8.225e-7 | 0 | 369597 | gtex_brain_putamen_basal |
RS67766134 | 13 | 96705833 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 7.273E-8 | 0 | 376440 | gtex_brain_putamen_basal |
RS561996 | 13 | 96706931 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 8.36e-7 | 0 | 377538 | gtex_brain_putamen_basal |
RS539604 | 13 | 96708108 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 8.323e-7 | 0 | 378715 | gtex_brain_putamen_basal |
RS493109 | 13 | 96709060 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 5.775E-7 | 0 | 379667 | gtex_brain_putamen_basal |
RS517173 | 13 | 96717364 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 2.564E-6 | 0 | 387971 | gtex_brain_putamen_basal |
RS592205 | 13 | 96719114 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 2.564E-6 | 0 | 389721 | gtex_brain_putamen_basal |
RS532399 | 13 | 96720476 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 2.564E-6 | 0 | 391083 | gtex_brain_putamen_basal |
RS506474 | 13 | 96722785 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 2.564E-6 | 0 | 393392 | gtex_brain_putamen_basal |
RS536606 | 13 | 96723774 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 2.564E-6 | 0 | 394381 | gtex_brain_putamen_basal |
RS531090 | 13 | 96724006 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 2.564E-6 | 0 | 394613 | gtex_brain_putamen_basal |
RS529306 | 13 | 96724189 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 2.563E-6 | 0 | 394796 | gtex_brain_putamen_basal |
RS527680 | 13 | 96746789 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 2.564E-6 | 0 | 417396 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2849438 | 13 | 96768287 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 1.207E-6 | 0 | 438894 | gtex_brain_putamen_basal |
RS542834 | 13 | 96792150 | DNAJC3 | ENSG00000102580.10 | 2.684E-6 | 0 | 462757 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DNAJC3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005488 | 捆绑 | IEA | - | |
去:0004860 | 蛋白激酶抑制剂活性 | 塔斯 | 7511204 | |
GO:0031072 | 热激蛋白结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006986 | 对展开蛋白的反应 | IEA | - | |
去:0009615 | 对病毒的反应 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005737 | 细胞质 | 塔斯 | 8666242 | |
去:0005783 | 内质网 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Biocarta RNA途径 | 10 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome糖尿病途径 | 133 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XBP1对伴侣基因的反应组激活 | 46 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome展开的蛋白质反应 | 80 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome流感生命周期 | 203 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome流感病毒RNA转录和复制 | 169 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Basaki YBX1靶向DN | 384 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9融合8D DN的Takeda目标 | 205 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶标C向上 | 170 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张对IKK抑制剂和TNF的反应 | 223 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MLL AF9融合的Kumar目标 | 405 | 264 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成12 | 36 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染10小时 | 101 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN | 373 | 196 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lein Cerebellum标记 | 85 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fujii YBX1靶向DN | 202 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI葡萄糖剥夺 | 60 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钱德兰转移 | 221 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇8的时间反应8 | 49 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期G1 S | 147 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
突变的TP53的Stambolsky靶标 | 49 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stambolsky对维生素D3的反应 | 84 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
phong tnf响应不是通过p38 | 337 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |