基因页：PCDHB2
概括？
| 基因 | 56133 |
| 象征 | PCDHB2 |
| 同义词 | PCDH-BETA2 |
| 描述 | 原钙粘蛋白β2 |
| 参考 | MIM：606328|HGNC：HGNC：8687|HPRD：07558| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 5Q31 |
| Pascal P值 | 0.009 |
| 主持人 | 小脑半球 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0032 | |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Athl1 | 0.78 | 0.82 |
| C1orf175 | 0.74 | 0.75 |
| COL16A1 | 0.73 | 0.76 |
| micall2 | 0.72 | 0.72 |
| ITIH4 | 0.72 | 0.77 |
| COL5A3 | 0.72 | 0.77 |
| LCN12 | 0.70 | 0.68 |
| adcy4 | 0.70 | 0.75 |
| RGL3 | 0.67 | 0.68 |
| itga7 | 0.67 | 0.71 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| txnl1 | -0.49 | -0.56 |
| mobkl3 | -0.47 | -0.54 |
| MRPL44 | -0.46 | -0.56 |
| mmadhc | -0.46 | -0.53 |
| TAF9 | -0.45 | -0.51 |
| CCT4 | -0.45 | -0.53 |
| Med19 | -0.45 | -0.51 |
| EIF3M | -0.45 | -0.53 |
| ASNSD1 | -0.45 | -0.51 |
| mettl9 | -0.45 | -0.52 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005509 | 钙离子结合 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | nas | 11322959 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007416 | 突触发生 | 塔斯 | 突触（GO期限：6） | 12231349 |
| 去：0007268 | 突触传输 | 塔斯 | 神经元，突触，神经递质（GO期限：6） | 12231349 |
| 去：0007155 | 细胞粘附 | 塔斯 | 10380929 | |
| 去：0007156 | 同粒细胞粘附 | IEA | - | |
| GO：0016339 | 钙依赖性细胞 - 细胞粘附 | nas | 11322959 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| 去：0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 10380929 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 哈马凋亡通过小径dn | 186 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 里克曼头颈癌 | 100 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen IPS ICP带有H3K27Me3 | 54 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |