基因页面:PCDHAC1
总结吗?
| GeneID | 56135年 |
| 象征 | PCDHAC1 |
| 同义词 | PCDH-ALPHA-C1 |
| 描述 | protocadherinα亚C, 1 |
| 参考 | MIM: 606320|HGNC: HGNC: 8676|运用:ENSG00000248383|HPRD: 07555|织女:OTTHUMG00000129603 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 5问 |
| 帕斯卡假定值 | 6.186 e-5 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.0032 | |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005509 | 钙离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007399 | 神经系统发育 | 助教 | 神经突(术语层面:5) | 10380929 |
| 去:0007155 | 细胞粘附 | 助教 | 10380929 | |
| 去:0007156 | 亲同种抗原的细胞粘附 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005886 | 等离子体膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005887 | 不可或缺的质膜 | 助教 | 10380929 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 施莱辛格H3K27ME3在正常和甲基化在癌症 | 28 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BONCI MIR15A MIR16 1的目标 | 91年 | 75年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳人大HCP H3K4ME2 | 491年 | 319年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MEF HCP H3 UNMETHYLATED | 228年 | 119年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-124/506 | 2194年 | 2200年 | m8 | hsa - mir - 506 | UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA |
| hsa - mir - 124大脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| miR-15/16/195/424/497 | 1015年 | 1022年 | 1、m8 | hsa-miR-15a大脑 | UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG |
| hsa-miR-16大脑 | UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG | ||||
| hsa-miR-15b大脑 | UAGCAGCACAUCAUGGUUUACA | ||||
| hsa - mir - 195深圳 | UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC | ||||
| hsa - mir - 424 | CAGCAGCAAUUCAUGUUUUGAA | ||||
| hsa - mir - 497 | CAGCAGCACACUGUGGUUUGU | ||||
| mir - 153 | 841年 | 847年 | 1 | hsa - mir - 153 | UUGCAUAGUCACAAAAGUGA |
| miR-17-5p / 20/93.mr / 106/519.d | 2259年 | 2265年 | m8 | hsa-miR-17-5p | CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU |
| hsa-miR-20a大脑 | UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG | ||||
| hsa - mir - 106 a | AAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGC | ||||
| hsa - mir - 106 b深圳 | UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU | ||||
| hsa-miR-20b深圳 | CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG | ||||
| hsa - mir - 519 d | CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU | ||||
| hsa-miR-17-5p | CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU | ||||
| hsa-miR-20a大脑 | UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG | ||||
| hsa - mir - 106 a | AAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGC | ||||
| hsa - mir - 106 b深圳 | UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU | ||||
| hsa-miR-20b深圳 | CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG | ||||
| hsa - mir - 519 d | CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU | ||||
| mir - 181 | 1523年 | 1530年 | 1、m8 | hsa - mir - 181 a大脑 | AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU |
| hsa - mir - 181 b深圳 | AACAUUCAUUGCUGUCGGUGGG | ||||
| hsa - mir - 181 c大脑 | AACAUUCAACCUGUCGGUGAGU | ||||
| hsa - mir - 181 d大脑 | AACAUUCAUUGUUGUCGGUGGGUU | ||||
| mir - 185 | 52 | 58 | m8 | hsa - mir - 185大脑 | UGGAGAGAAAGGCAGUUC |
| hsa - mir - 185大脑 | UGGAGAGAAAGGCAGUUC | ||||
| mir - 186 | 791年 | 797年 | m8 | hsa - mir - 186 | CAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUU |
| miR-19 | 796年 | 803年 | 1、m8 | hsa-miR-19a | UGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGA |
| hsa-miR-19b | UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA | ||||
| mir - 218 | 1791年 | 1798年 | 1、m8 | hsa - mir - 218大脑 | UUGUGCUUGAUCUAACCAUGU |
| miR-221/222 | 60 | 67年 | 1、m8 | hsa - mir - 221大脑 | AGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUC |
| hsa - mir - 222大脑 | AGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUC | ||||
| miR-23 | 2125年 | 2131年 | 1 | hsa-miR-23a大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC |
| hsa-miR-23b大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUACC | ||||
| hsa-miR-23a大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC | ||||
| hsa-miR-23b大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUACC | ||||
| miR-29 | 2355年 | 2362年 | 1、m8 | hsa-miR-29a深圳 | UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU |
| hsa-miR-29b深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU | ||||
| hsa-miR-29c深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCGGU | ||||
| mir - 320 | 1512年 | 1518年 | 1 | hsa - mir - 320 | AAAAGCUGGGUUGAGAGGGCGAA |
| hsa - mir - 320 | AAAAGCUGGGUUGAGAGGGCGAA | ||||
| hsa - mir - 320 | AAAAGCUGGGUUGAGAGGGCGAA | ||||
| mir - 329 | 2071年 | 2078年 | 1、m8 | hsa - mir - 329大脑 | AACACACCUGGUUAACCUCUUU |
| mir - 330 | 1833年 | 1840年 | 1、m8 | hsa - mir - 330大脑 | GCAAAGCACACGGCCUGCAGAGA |
| mir - 362 | 2320年 | 2326年 | 1 | hsa - mir - 362 | AAUCCUUGGAACCUAGGUGUGAGU |
| mir - 369 - 3 - p | 1057年 | 1064年 | 1、m8 | hsa - mir - 369 - 3 - p | AAUAAUACAUGGUUGAUCUUU |
| mir - 448 | 841年 | 847年 | 1 | hsa - mir - 448 | UUGCAUAUGUAGGAUGUCCCAU |
| mir - 495 | 883年 | 889年 | m8 | hsa - mir - 495大脑 | AAACAAACAUGGUGCACUUCUUU |
| mir - 503 | 1016年 | 1022年 | 1 | hsa - mir - 503 | UAGCAGCGGGAACAGUUCUGCAG |
| mir - 505 | 1520年 | 1526年 | 1 | hsa - mir - 505 | GUCAACACUUGCUGGUUUCCUC |
| mir - 539 | 1257年 | 1263年 | 1 | hsa - mir - 539 | GGAGAAAUUAUCCUUGGUGUGU |
| 米尔- 93. - hd / 291 - 3 - p / 294/295/302/372/373/520 | 2258年 | 2264年 | m8 | hsa - mir - 93大脑 | AAAGUGCUGUUCGUGCAGGUAG |
| hsa - mir - 302 a | UAAGUGCUUCCAUGUUUUGGUGA | ||||
| hsa - mir - 302 b | UAAGUGCUUCCAUGUUUUAGUAG | ||||
| hsa - mir - 302 c | UAAGUGCUUCCAUGUUUCAGUGG | ||||
| hsa - mir - 302 d | UAAGUGCUUCCAUGUUUGAGUGU | ||||
| hsa - mir - 372 | AAAGUGCUGCGACAUUUGAGCGU | ||||
| hsa - mir - 373 | GAAGUGCUUCGAUUUUGGGGUGU | ||||
| hsa - mir - 520 e | AAAGUGCUUCCUUUUUGAGGG | ||||
| hsa - mir - 520 a | AAAGUGCUUCCCUUUGGACUGU | ||||
| hsa - mir - 520 b | AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGG | ||||
| hsa - mir - 520 c | AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGGUU | ||||
| hsa - mir - 520 d | AAAGUGCUUCUCUUUGGUGGGUU | ||||