Gene Page:PRLR
概括?
| GeneID | 5618 |
| Symbol | PRLR |
| Synonyms | HPRL|MFAB|hPRLrI |
| Description | prolactin receptor |
| 参考 | MIM:176761|HGNC:HGNC:9446|Ensembl：ENSG00000113494|HPRD:01457|Vega:OTTHUMG00000090789 |
| Gene type | protein-coding |
| Map location | 5p13.2 |
| Pascal p-value | 0.203 |
| Fetal beta | -0.582 |
| eGene | Caudate basal ganglia Nucleus accumbens basal ganglia Putamen basal ganglia |
数据源中的基因
| Gene set name | Method of gene set | Description | Info |
|---|---|---|---|
| CV:PGCnp | Genome-wide Association Study | GWAS | |
| PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included. | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | Click to show details |
第一节遗传学和表观遗传学注释
eQTL annotation
eQTL annotation| SNP ID | Chromosome | Position | eGene | Gene Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS distance | eQTL type |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs6897259 | 5 | 35188444 | PRLR | ENSG00000113494.12 | 8.942E-7 | 0.01 | 42350 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7721404 | 5 | 35189624 | PRLR | ENSG00000113494.12 | 4.778E-7 | 0.01 | 41170 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9292573 | 5 | 35199433 | PRLR | ENSG00000113494.12 | 6.211E-7 | 0.01 | 31361 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs873456 | 5 | 35199657 | PRLR | ENSG00000113494.12 | 3.666E-6 | 0.01 | 31137 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs875701 | 5 | 35200656 | PRLR | ENSG00000113494.12 | 9.41E-7 | 0.01 | 30138 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs72456163 | 5 | 35201798 | PRLR | ENSG00000113494.12 | 1.523E-6 | 0.01 | 28996 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS55902512 | 5 | 35202270 | PRLR | ENSG00000113494.12 | 2.562E-6 | 0.01 | 28524 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2047739 | 5 | 35203338 | PRLR | ENSG00000113494.12 | 1.358E-6 | 0.01 | 27456 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2047740 | 5 | 35203392 | PRLR | ENSG00000113494.12 | 1.23E-6 | 0.01 | 27402 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS72734580 | 5 | 35204923 | PRLR | ENSG00000113494.12 | 2.55E-6 | 0.01 | 25871 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs75915490 | 5 | 35205592 | PRLR | ENSG00000113494.12 | 2.548E-6 | 0.01 | 25202 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs74383180 | 5 | 35209548 | PRLR | ENSG00000113494.12 | 2.913E-6 | 0.01 | 21246 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs72734599 | 5 | 35218764 | PRLR | ENSG00000113494.12 | 2.812E-6 | 0.01 | 12030 | gtex_brain_putamen_basal |
Section II. Transcriptome annotation
General gene expression (GTEx)
Gene expression during devlopment (BrainCloud)
脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.
Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
Top co-expressed genes in brain regions
| Top 10 positively co-expressed genes | ||
| Gene | Pearson's Correlation | Spearman's Correlation |
| MAPK3 | 0.75 | 0.69 |
| AC019206.3 | 0.71 | 0.66 |
| LRMP | 0.70 | 0.69 |
| PDK2 | 0.69 | 0.68 |
| ANXA11 | 0.67 | 0.84 |
| SLC25A45 | 0.66 | 0.76 |
| ALDOA | 0.66 | 0.76 |
| EXTL1 | 0.65 | 0.82 |
| GJB3 | 0.64 | 0.70 |
| CPEB1 | 0.64 | 0.81 |
| Top 10 negatively co-expressed genes | ||
| Gene | Pearson's Correlation | Spearman's Correlation |
| NKIRAS2 | -0.39 | -0.57 |
| MMP25 | -0.39 | -0.61 |
| PKN1 | -0.38 | -0.66 |
| KIAA1949 | -0.38 | -0.65 |
| TUBB2B | -0.37 | -0.68 |
| RP9 | -0.37 | -0.64 |
| SH2B2 | -0.37 | -0.69 |
| SH3BP2 | -0.37 | -0.70 |
| YBX1 | -0.37 | -0.66 |
| MARCKSL1 | -0.37 | -0.63 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| Interactors | Aliases B | Official full name B | Experimental | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| CSH1 | CSA |CSMT |FLJ75407 |pl | chorionic somatomammotropin hormone 1 (placental lactogen) | - | HPRD | 10966654 |
| GH1 | GH |GH-N |GHN |HGH-N | growth hormone 1 | - | HPRD,BioGRID | 9556914 |
| JAK2 | JTK10 | Janus kinase 2 (a protein tyrosine kinase) | - | HPRD,BioGRID | 10772872 |
| NEK3 | HSPK36 | MGC29949 | NIMA (never in mitosis gene a)-related kinase 3 | Nek3 interacts with PRLr. | BIND | 15618286 |
| PPIA | cypa |Cyph |MGC117158 |MGC12404 |MGC23397 | peptidylprolyl isomerase A (cyclophilin A) | - | HPRD,BioGRID | 12668872 |
| PRL | - | prolactin | - | HPRD | 9626554 |
| PTPN11 | BPTP3 | CFC | MGC14433 | NS1 | PTP-1D | PTP2C | SH-PTP2 | SH-PTP3 | SHP2 | 蛋白质酪氨酸磷酸酶，非受体11型 | Affinity Capture-Western | BioGRID | 10991949 |
| SOCS2 | CIS2 | Cish2 | SOCS-2 | SSI-2 | SSI2 | STATI2 | 吃晚饭pressor of cytokine signaling 2 | - | HPRD,BioGRID | 9202403|10455112 |
| SOCS3 | atod4 |顺式3 |cish3 |MGC71791 |SOCS-3 |SSI-3 |SSI3 | 抑制细胞因子信号3 | - | HPRD,BioGRID | 11713228 |
| tec | MGC126760 | MGC126762 | PSCTK4 | tec protein tyrosine kinase | - | HPRD,BioGRID | 11328862 |
| VAV1 | VAV | vav 1 guanine nucleotide exchange factor | - | HPRD,BioGRID | 7768923 |
| VAV2 | - | vav 2 guanine nucleotide exchange factor | Vav2 interacts with PRLr. | BIND | 15618286 |
V.途径注释
| Pathway name | Pathway size | ＃szgr 2.0基因 | Info |
|---|---|---|---|
| KEGG CYTOKINE CYTOKINE RECEPTOR INTERACTION | 267 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG NEUROACTIVE LIGAND RECEPTOR INTERACTION | 272 | 195 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG JAK STAT SIGNALING PATHWAY | 155 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID ERBB4 PATHWAY | 38 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID PTP1B PATHWAY | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组生长激素受体信号传导 | 24 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ERBB4的Reactome信号传导 | 90 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME PROLACTIN RECEPTOR SIGNALING | 14 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ERBB4的Reactome核信号传导 | 38 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME IMMUNE SYSTEM | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 | 270 | 204 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Huttmann B Cll生存不佳 | 276 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LIU CMYB TARGETS UP | 165 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS BASAL UP | 380 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS MESENCHYMAL UP | 450 | 256 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DOANE BREAST CANCER CLASSES UP | 72 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RODRIGUES NTN1 TARGETS DN | 158 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GOZGIT ESR1 TARGETS DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MCBRYAN PUBERTAL BREAST 4 5WK UP | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RASHI RESPONSE TO IONIZING RADIATION 5 | 147 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FARMER BREAST CANCER APOCRINE VS BASAL | 330 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| AIYAR COBRA1 TARGETS UP | 39 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MOHANKUMAR TLX1 TARGETS UP | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SHETH LIVER CANCER VS TXNIP LOSS PAM4 | 261 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KHETCHOUMIAN TRIM24 TARGETS DN | 8 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC目标DN | 366 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAGI AML SURVIVAL | 129 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| XU GH1 AUTOCRINE TARGETS DN | 142 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lein脉络丛标记 | 103 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KYNG DNA DAMAGE BY GAMMA AND UV RADIATION | 88 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KYNG DNA DAMAGE UP | 226 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Massarweh他莫昔芬抵抗DN | 258 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMID BREAST CANCER BASAL DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BERNARD PPAPDC1B TARGETS DN | 58 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MATZUK LUTEAL GENES | 8 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HUANG DASATINIB RESISTANCE DN | 69 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BOYLAN MULTIPLE MYELOMA C D DN | 252 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ICHIBA GRAFT VERSUS HOST DISEASE D7 DN | 40 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ICHIBA GRAFT VERSUS HOST DISEASE 35D DN | 49 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BOYLAN MULTIPLE MYELOMA PCA1 UP | 101 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DANG REGULATED BY MYC DN | 253 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHANDRAN METASTASIS UP | 221 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MIKKELSEN MEF HCP WITH H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PANGAS TUMOR SUPPRESSION BY SMAD1 AND SMAD5 DN | 157 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BRUINS UVC RESPONSE VIA TP53 GROUP A | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LEE BMP2 TARGETS UP | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Servitja Islet HNF1A靶向DN | 109 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PEDERSEN METASTASIS BY ERBB2 ISOFORM 7 | 403 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RAO BOUND BY SALL4 ISOFORM B | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LIM MAMMARY STEM CELL DN | 428 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LIM MAMMARY LUMINAL MATURE UP | 116 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |