基因页:prodh
概括?
基因 | 5625 |
象征 | prodh |
同义词 | hspox2 | pig6 | pox | prodh1 | prodh2 | tp53i6 |
描述 | 脯氨酸脱氢酶(氧化酶)1 |
参考 | MIM:606810|HGNC:HGNC:9453|Ensembl:ENSG00000100033|HPRD:08433|Vega:Otthumg00000150163 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22Q11.21 |
Pascal P值 | 0.504 |
胎儿β | -0.987 |
主持人 | 伏隔核基底神经节 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CNV:是的 | 拷贝数变异研究 | 手动策划 | |
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
协会 | 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 | 2 | 链接到Szgene |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.031 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症的关键字相同:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PRODH_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MPO | 0.79 | 0.58 |
Elane | 0.69 | 0.70 |
PRG2 | 0.67 | 0.08 |
SLC22A18 | 0.62 | 0.54 |
TNFSF9 | 0.55 | 0.53 |
S100A12 | 0.54 | 0.31 |
G6PC3 | 0.53 | 0.53 |
OLFM4 | 0.53 | 0.48 |
透明3 | 0.52 | 0.43 |
JAK3 | 0.51 | 0.64 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
anp32c | -0.26 | -0.37 |
ZRSR1 | -0.25 | -0.33 |
AC073528.1 | -0.24 | -0.27 |
EIF3S8 | -0.24 | -0.36 |
GTF2H2 | -0.24 | -0.29 |
SFRS12 | -0.24 | -0.37 |
ZNF326 | -0.23 | -0.41 |
EIF5B | -0.23 | -0.38 |
C6orf204 | -0.23 | -0.28 |
ERC1 | -0.23 | -0.32 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003674 | Molecular_Function | nd | - | |
去:0004657 | 脯氨酸脱氢酶活性 | 塔斯 | 10192398 | |
GO:0016491 | 氧化还原酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006537 | 谷氨酸生物合成过程 | IEA | 谷氨酸(GO期限:9) | - |
去:0008631 | 氧化应激诱导凋亡 | nas | 9305847 | |
去:0006562 | 脯氨酸分解代谢过程 | IEA | - | |
GO:0055114 | 还原氧化 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005575 | cellular_component | nd | - | |
去:0005739 | 线粒体 | IEA | - | |
去:0005743 | 线粒体内膜 | IEA | - | |
去:0005759 | 线粒体基质 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg精氨酸和脯氨酸代谢 | 54 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
氨基酸和衍生物的反应组代谢 | 200 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与间充质 | 450 | 256 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胡血管生成 | 21 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Galluzzi通透性线粒体 | 43 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jazag TGFB1通过SMAD4 DN发出信号 | 66 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼转移DN | 261 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark Hyppocampus 22Q11缺失DN | 20 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ross AML与PML RARA FUSION | 77 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee肝癌电纤维酸DN | 66 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee肝癌ACOX1 DN | 65 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Liver Cancer Dena DN | 74 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭谷氨酰胺剥夺DN | 337 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cromer转移DN | 81 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1突变DN的Verhaak AML | 246 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
村上紫外线响应6小时 | 37 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江缺氧正常 | 311 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggins他莫昔芬抗性 | 66 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肺DN中的Smid乳腺癌复发 | 37 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌ERBB2 UP | 147 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤D聚集 | 27 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤D | 89 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Piontek PKD1靶向 | 38 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chauhan对甲氧雌二醇的反应 | 51 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Valk AML群集12 | 30 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤DN | 267 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHYLA CBFA2T3靶向 | 387 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |