概括
基因 5625
象征 prodh
同义词 hspox2 | pig6 | pox | prodh1 | prodh2 | tp53i6
描述 脯氨酸脱氢酶(氧化酶)1
参考 MIM:606810|HGNC:HGNC:9453|Ensembl:ENSG00000100033|HPRD:08433|Vega:Otthumg00000150163
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22Q11.21
Pascal P值 0.504
胎儿β -0.987
主持人 伏隔核基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CNV:是的 拷贝数变异研究 手动策划
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 2 链接到Szgene
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.031
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症的关键字相同:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MPO 0.79 0.58
Elane 0.69 0.70
PRG2 0.67 0.08
SLC22A18 0.62 0.54
TNFSF9 0.55 0.53
S100A12 0.54 0.31
G6PC3 0.53 0.53
OLFM4 0.53 0.48
透明3 0.52 0.43
JAK3 0.51 0.64
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
anp32c -0.26 -0.37
ZRSR1 -0.25 -0.33
AC073528.1 -0.24 -0.27
EIF3S8 -0.24 -0.36
GTF2H2 -0.24 -0.29
SFRS12 -0.24 -0.37
ZNF326 -0.23 -0.41
EIF5B -0.23 -0.38
C6orf204 -0.23 -0.28
ERC1 -0.23 -0.32

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003674 Molecular_Function nd -
去:0004657 脯氨酸脱氢酶活性 塔斯 10192398
GO:0016491 氧化还原酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006537 谷氨酸生物合成过程 IEA 谷氨酸(GO期限:9) -
去:0008631 氧化应激诱导凋亡 nas 9305847
去:0006562 脯氨酸分解代谢过程 IEA -
GO:0055114 还原氧化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005575 cellular_component nd -
去:0005739 线粒体 IEA -
去:0005743 线粒体内膜 IEA -
去:0005759 线粒体基质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg精氨酸和脯氨酸代谢 54 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
氨基酸和衍生物的反应组代谢 200 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质 450 256 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胡血管生成 21 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Galluzzi通透性线粒体 43 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jazag TGFB1通过SMAD4 DN发出信号 66 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼转移DN 261 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark Hyppocampus 22Q11缺失DN 20 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ross AML与PML RARA FUSION 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee肝癌电纤维酸DN 66 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee肝癌ACOX1 DN 65 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer Dena DN 74 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cromer转移DN 81 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1突变DN的Verhaak AML 246 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
村上紫外线响应6小时 37 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江缺氧正常 311 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggins他莫昔芬抗性 66 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肺DN中的Smid乳腺癌复发 37 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌ERBB2 UP 147 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤D聚集 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤D 89 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Piontek PKD1靶向 38 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chauhan对甲氧雌二醇的反应 51 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集12 30 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤DN 267 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3靶向 387 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因