基因页:prPSAP1
概括?
基因 | 5635 |
象征 | prPSAP1 |
同义词 | Pap39 |
描述 | 磷酸酚基磷酸合成酶相关蛋白1 |
参考 | MIM:601249|HGNC:HGNC:9466|HPRD:03151| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17Q24-Q25 |
Pascal P值 | 0.018 |
Sherlock P值 | 0.756 |
胎儿beta | 0.828 |
DMG | 1(#研究) |
耶和华 | 前扣带回皮层BA24 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136例对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG14816748 | 17 | 74349897 | prPSAP1 | 1.05E-7 | -0.008 | 2.3e-5 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 耶和华 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS346790 | CHR17 | 74300294 | prPSAP1 | 5635 | 0.02 | 顺式 | ||
RS447294 | CHR17 | 74308124 | prPSAP1 | 5635 | 0.06 | 顺式 | ||
RS421578 | CHR17 | 74314772 | prPSAP1 | 5635 | 0.01 | 顺式 | ||
RS164009 | 17 | 74283669 | prPSAP1 | ENSG00000161542.12 | 1.679E-6 | 0.01 | 67341 | gtex_brain_ba24 |
RS346785 | 17 | 74283769 | prPSAP1 | ENSG00000161542.12 | 1.679E-6 | 0.01 | 67241 | gtex_brain_ba24 |
RS4789272 | 17 | 74285783 | prPSAP1 | ENSG00000161542.12 | 1.655E-6 | 0.01 | 65227 | gtex_brain_ba24 |
RS17509527 | 17 | 74286173 | prPSAP1 | ENSG00000161542.12 | 1.679E-6 | 0.01 | 64837 | gtex_brain_ba24 |
RS164106 | 17 | 74290566 | prPSAP1 | ENSG00000161542.12 | 1.677E-6 | 0.01 | 60444 | gtex_brain_ba24 |
RS2945453 | 17 | 74291158 | prPSAP1 | ENSG00000161542.12 | 9.946E-7 | 0.01 | 59852 | gtex_brain_ba24 |
RS186985 | 17 | 74293388 | prPSAP1 | ENSG00000161542.12 | 1.044e-6 | 0.01 | 57622 | gtex_brain_ba24 |
RS4789276 | 17 | 74294598 | prPSAP1 | ENSG00000161542.12 | 4.715E-7 | 0.01 | 56412 | gtex_brain_ba24 |
RS12603578 | 17 | 74296079 | prPSAP1 | ENSG00000161542.12 | 3.307E-7 | 0.01 | 54931 | gtex_brain_ba24 |
RS2585747 | 17 | 74298257 | prPSAP1 | ENSG00000161542.12 | 1.27E-7 | 0.01 | 52753 | gtex_brain_ba24 |
RS443970 | 17 | 74303370 | prPSAP1 | ENSG00000161542.12 | 1.198E-6 | 0.01 | 47640 | gtex_brain_ba24 |
RS379503 | 17 | 74308358 | prPSAP1 | ENSG00000161542.12 | 5.083e-7 | 0.01 | 42652 | gtex_brain_ba24 |
RS2279057 | 17 | 74309425 | prPSAP1 | ENSG00000161542.12 | 5.615E-7 | 0.01 | 41585 | gtex_brain_ba24 |
RS2279056 | 17 | 74309474 | prPSAP1 | ENSG00000161542.12 | 5.615E-7 | 0.01 | 41536 | gtex_brain_ba24 |
RS407281 | 17 | 74311343 | prPSAP1 | ENSG00000161542.12 | 5.942e-7 | 0.01 | 39667 | gtex_brain_ba24 |
RS446662 | 17 | 74313542 | prPSAP1 | ENSG00000161542.12 | 9.371E-7 | 0.01 | 37468 | gtex_brain_ba24 |
RS186985 | 17 | 74293388 | prPSAP1 | ENSG00000161542.12 | 2.192E-7 | 0 | 57622 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4789276 | 17 | 74294598 | prPSAP1 | ENSG00000161542.12 | 3.63e-7 | 0 | 56412 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12603578 | 17 | 74296079 | prPSAP1 | ENSG00000161542.12 | 2.011E-6 | 0 | 54931 | gtex_brain_putamen_basal |
RS379503 | 17 | 74308358 | prPSAP1 | ENSG00000161542.12 | 2.546E-7 | 0 | 42652 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2279057 | 17 | 74309425 | prPSAP1 | ENSG00000161542.12 | 2.966E-7 | 0 | 41585 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2279056 | 17 | 74309474 | prPSAP1 | ENSG00000161542.12 | 2.966E-7 | 0 | 41536 | gtex_brain_putamen_basal |
RS407281 | 17 | 74311343 | prPSAP1 | ENSG00000161542.12 | 2.414E-7 | 0 | 39667 | gtex_brain_putamen_basal |
RS446662 | 17 | 74313542 | prPSAP1 | ENSG00000161542.12 | 2.36E-6 | 0 | 37468 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PRPSAP1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第四节蛋白质 - 蛋白质相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 来源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
CD2BP2 | FWP010 |lin1 |SNU40 |U5-52K | CD2(细胞质尾巴)结合蛋白2 | 亲和力捕获MS | Biogrid | 17353931 |
伊尔克 | DKFZP686F1765 |P59 | 整联蛋白连接激酶 | 亲和力捕获MS | Biogrid | 17353931 |
nuak1 | ark5 |KIAA0537 | Nuak家族,类似SNF1的激酶,1 | 亲和力捕获MS | Biogrid | 17353931 |
plekhf2 | FLJ13187 |phafin2 |ZFYVE18 | PLECKSTRIN同源域包含Family F(带有FYVE域)成员2 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
Prkra | dyt16 |HSD14 |协定|rax | 蛋白激酶,干扰素诱导的双链RNA依赖性激活剂 | 亲和力捕获MS | Biogrid | 17353931 |
prps1 | 艺术|CMTX5 |KIAA0967 |ppribp |PRSI | 磷酸磷酸磷酸合成酶1 | - | HPRD,Biogrid | 9366267 |
PRPS2 | prsii | 磷酸磷酸磷酸合成酶2 | - | HPRD,Biogrid | 9366267 |
prPSAP1 | Pap39 | 磷酸酚基磷酸合成酶相关蛋白1 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
PSPH | PSP | 磷酸盐磷酸酶 | 亲和力捕获MS | Biogrid | 17353931 |
PTP4A3 | prl-3 |prl-r |PRL3 | 蛋白酪氨酸磷酸酶类型IVA,成员3 | 亲和力捕获MS | Biogrid | 17353931 |
TMBIM4 | CGI-119 |GAAP |S1R |Zpro | 包含4的跨膜bax抑制剂基序 | 亲和力捕获MS | Biogrid | 17353931 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
---|---|---|---|
莱茵所有糖皮质激素治疗DN | 362 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应FIMA DN | 284 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌DN | 232 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gruetzmann胰腺癌DN | 203 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标DN | 366 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
量缺氧 | 98 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ramalho Stemness | 206 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡DN | 287 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zamora NOS2靶向DN | 96 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3束缚的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 | 388 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC绑定的Dang | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期G2 m | 216 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |