概括
基因 5635
象征 prPSAP1
同义词 Pap39
描述 磷酸酚基磷酸合成酶相关蛋白1
参考 MIM:601249|HGNC:HGNC:9466|HPRD:03151|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17Q24-Q25
Pascal P值 0.018
Sherlock P值 0.756
胎儿beta 0.828
DMG 1(#研究)
耶和华 前扣带回皮层BA24
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
伏隔核基底神经节
梭子基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组关联研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136例对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG14816748 17 74349897 prPSAP1 1.05E-7 -0.008 2.3e-5 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 耶和华 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS346790 CHR17 74300294 prPSAP1 5635 0.02 顺式
RS447294 CHR17 74308124 prPSAP1 5635 0.06 顺式
RS421578 CHR17 74314772 prPSAP1 5635 0.01 顺式
RS164009 17 74283669 prPSAP1 ENSG00000161542.12 1.679E-6 0.01 67341 gtex_brain_ba24
RS346785 17 74283769 prPSAP1 ENSG00000161542.12 1.679E-6 0.01 67241 gtex_brain_ba24
RS4789272 17 74285783 prPSAP1 ENSG00000161542.12 1.655E-6 0.01 65227 gtex_brain_ba24
RS17509527 17 74286173 prPSAP1 ENSG00000161542.12 1.679E-6 0.01 64837 gtex_brain_ba24
RS164106 17 74290566 prPSAP1 ENSG00000161542.12 1.677E-6 0.01 60444 gtex_brain_ba24
RS2945453 17 74291158 prPSAP1 ENSG00000161542.12 9.946E-7 0.01 59852 gtex_brain_ba24
RS186985 17 74293388 prPSAP1 ENSG00000161542.12 1.044e-6 0.01 57622 gtex_brain_ba24
RS4789276 17 74294598 prPSAP1 ENSG00000161542.12 4.715E-7 0.01 56412 gtex_brain_ba24
RS12603578 17 74296079 prPSAP1 ENSG00000161542.12 3.307E-7 0.01 54931 gtex_brain_ba24
RS2585747 17 74298257 prPSAP1 ENSG00000161542.12 1.27E-7 0.01 52753 gtex_brain_ba24
RS443970 17 74303370 prPSAP1 ENSG00000161542.12 1.198E-6 0.01 47640 gtex_brain_ba24
RS379503 17 74308358 prPSAP1 ENSG00000161542.12 5.083e-7 0.01 42652 gtex_brain_ba24
RS2279057 17 74309425 prPSAP1 ENSG00000161542.12 5.615E-7 0.01 41585 gtex_brain_ba24
RS2279056 17 74309474 prPSAP1 ENSG00000161542.12 5.615E-7 0.01 41536 gtex_brain_ba24
RS407281 17 74311343 prPSAP1 ENSG00000161542.12 5.942e-7 0.01 39667 gtex_brain_ba24
RS446662 17 74313542 prPSAP1 ENSG00000161542.12 9.371E-7 0.01 37468 gtex_brain_ba24
RS186985 17 74293388 prPSAP1 ENSG00000161542.12 2.192E-7 0 57622 gtex_brain_putamen_basal
RS4789276 17 74294598 prPSAP1 ENSG00000161542.12 3.63e-7 0 56412 gtex_brain_putamen_basal
RS12603578 17 74296079 prPSAP1 ENSG00000161542.12 2.011E-6 0 54931 gtex_brain_putamen_basal
RS379503 17 74308358 prPSAP1 ENSG00000161542.12 2.546E-7 0 42652 gtex_brain_putamen_basal
RS2279057 17 74309425 prPSAP1 ENSG00000161542.12 2.966E-7 0 41585 gtex_brain_putamen_basal
RS2279056 17 74309474 prPSAP1 ENSG00000161542.12 2.966E-7 0 41536 gtex_brain_putamen_basal
RS407281 17 74311343 prPSAP1 ENSG00000161542.12 2.414E-7 0 39667 gtex_brain_putamen_basal
RS446662 17 74313542 prPSAP1 ENSG00000161542.12 2.36E-6 0 37468 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第四节蛋白质 - 蛋白质相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 来源 PubMed ID
CD2BP2 FWP010 |lin1 |SNU40 |U5-52K CD2(细胞质尾巴)结合蛋白2 亲和力捕获MS Biogrid 17353931
伊尔克 DKFZP686F1765 |P59 整联蛋白连接激酶 亲和力捕获MS Biogrid 17353931
nuak1 ark5 |KIAA0537 Nuak家族,类似SNF1的激酶,1 亲和力捕获MS Biogrid 17353931
plekhf2 FLJ13187 |phafin2 |ZFYVE18 PLECKSTRIN同源域包含Family F(带有FYVE域)成员2 两个杂交 Biogrid 16189514
Prkra dyt16 |HSD14 |协定|rax 蛋白激酶,干扰素诱导的双链RNA依赖性激活剂 亲和力捕获MS Biogrid 17353931
prps1 艺术|CMTX5 |KIAA0967 |ppribp |PRSI 磷酸磷酸磷酸合成酶1 - HPRD,Biogrid 9366267
PRPS2 prsii 磷酸磷酸磷酸合成酶2 - HPRD,Biogrid 9366267
prPSAP1 Pap39 磷酸酚基磷酸合成酶相关蛋白1 两个杂交 Biogrid 16189514
PSPH PSP 磷酸盐磷酸酶 亲和力捕获MS Biogrid 17353931
PTP4A3 prl-3 |prl-r |PRL3 蛋白酪氨酸磷酸酶类型IVA,成员3 亲和力捕获MS Biogrid 17353931
TMBIM4 CGI-119 |GAAP |S1R |Zpro 包含4的跨膜bax抑制剂基序 亲和力捕获MS Biogrid 17353931


V.途径注释

路径名 路径大小 #SZGR 2.0途径中的基因 信息
莱茵所有糖皮质激素治疗DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应FIMA DN 284 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌DN 232 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌DN 203 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标DN 366 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
量缺氧 98 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ramalho Stemness 206 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡DN 287 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zamora NOS2靶向DN 96 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3束缚的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 388 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC绑定的Dang 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期G2 m 216 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因