基因页:KLK10
Summary?
基因ID | 5655 |
象征 | KLK10 |
同义词 | NES1 | PRSSL1 |
描述 | Kallikrein相关肽酶10 |
参考 | MIM:602673|HGNC:HGNC:6358|ENSEMBL:ENSG00000129451|HPRD:04054|Vega:Otthumg00000182916 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13 |
Pascal P值 | 0.721 |
胎儿β | -0.48 |
DMG | 2(#研究) |
主持人 | 小脑 额叶皮质BA9 梭子基底神经节 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 2 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG24512400 | 19 | 51522561 | KLK10 | 9.2e-6 | -0.439 | 0.013 | DMG:Wockner_2014 |
CG21869055 | 19 | 51522454 | KLK10 | 8.31e-10 | -0.023 | 1.07E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2739430 | 19 | 51516345 | KLK10 | ENSG00000129451.7 | 1.116E-6 | 0.02 | 7086 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2691258 | 19 | 51517286 | KLK10 | ENSG00000129451.7 | 1.45843E-6 | 0.02 | 6145 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2075691 | 19 | 51519114 | KLK10 | ENSG00000129451.7 | 5.92453E-7 | 0.02 | 4317 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2075690 | 19 | 51519236 | KLK10 | ENSG00000129451.7 | 1.03656E-6 | 0.02 | 4195 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2075689 | 19 | 51519259 | KLK10 | ENSG00000129451.7 | 1.05238E-6 | 0.02 | 4172 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2075687 | 19 | 51519451 | KLK10 | ENSG00000129451.7 | 1.69221E-6 | 0.02 | 3980 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/KLK10_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MRPL1 | 0.92 | 0.93 |
ATP5C1 | 0.92 | 0.91 |
CHMP5 | 0.92 | 0.90 |
Fundc2 | 0.91 | 0.88 |
PPP2R3C | 0.89 | 0.89 |
VPS29 | 0.89 | 0.90 |
Znhit3 | 0.88 | 0.86 |
NFU1 | 0.88 | 0.90 |
PFDN4 | 0.88 | 0.90 |
PSMA2 | 0.87 | 0.91 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FAM38A | -0.62 | -0.76 |
DOCK6 | -0.60 | -0.69 |
GATA2 | -0.60 | -0.69 |
RRBP1 | -0.60 | -0.69 |
tenc1 | -0.59 | -0.68 |
sema3g | -0.58 | -0.66 |
工程 | -0.58 | -0.64 |
SLC6A12 | -0.58 | -0.67 |
梨1 | -0.57 | -0.66 |
ZBTB47 | -0.56 | -0.60 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004252 | 丝氨酸型内肽酶活性 | IEA | 谷氨酸(GO期限:7) | - |
去:0008233 | 肽酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006508 | 蛋白水解 | IEA | - | |
GO:0045786 | 细胞周期的负调控 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | 塔斯 | 8764136 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PYEON HPV阳性肿瘤DN | 10 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与基础DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌早期 | 430 | 232 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jaeger转移DN | 258 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周炎性反应lps up | 431 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
sabates结直肠腺瘤 | 141 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
hahtola兄弟姐妹Fungoides皮肤DN | 27 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼肿瘤分化了井和DN不良 | 382 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼肿瘤分化了井与中度DN | 110 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼头颈癌C | 113 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林被肿瘤微环境沉默 | 108 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标1 DN | 169 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标3 DN | 59 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cromer转移DN | 81 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 2 | 50 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张抗病毒对利巴韦林的反应 | 30 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Durchdewald皮肤致癌DN | 264 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 | 315 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Poola侵入性乳腺癌DN | 134 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钱德兰转移DN | 306 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP与H3未甲基化 | 228 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 | 211 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 | 281 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delpuech FOXO3靶向 | 68 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
寄养KDM1A靶向 | 266 | 142 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang EGF间隔DN | 214 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |