Summary
基因ID 5655
象征 KLK10
同义词 NES1 | PRSSL1
描述 Kallikrein相关肽酶10
参考 MIM:602673|HGNC:HGNC:6358|ENSEMBL:ENSG00000129451|HPRD:04054|Vega:Otthumg00000182916
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13
Pascal P值 0.721
胎儿β -0.48
DMG 2(#研究)
主持人 小脑
额叶皮质BA9
梭子基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 2
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG24512400 19 51522561 KLK10 9.2e-6 -0.439 0.013 DMG:Wockner_2014
CG21869055 19 51522454 KLK10 8.31e-10 -0.023 1.07E-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2739430 19 51516345 KLK10 ENSG00000129451.7 1.116E-6 0.02 7086 gtex_brain_putamen_basal
RS2691258 19 51517286 KLK10 ENSG00000129451.7 1.45843E-6 0.02 6145 gtex_brain_putamen_basal
RS2075691 19 51519114 KLK10 ENSG00000129451.7 5.92453E-7 0.02 4317 gtex_brain_putamen_basal
RS2075690 19 51519236 KLK10 ENSG00000129451.7 1.03656E-6 0.02 4195 gtex_brain_putamen_basal
RS2075689 19 51519259 KLK10 ENSG00000129451.7 1.05238E-6 0.02 4172 gtex_brain_putamen_basal
RS2075687 19 51519451 KLK10 ENSG00000129451.7 1.69221E-6 0.02 3980 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MRPL1 0.92 0.93
ATP5C1 0.92 0.91
CHMP5 0.92 0.90
Fundc2 0.91 0.88
PPP2R3C 0.89 0.89
VPS29 0.89 0.90
Znhit3 0.88 0.86
NFU1 0.88 0.90
PFDN4 0.88 0.90
PSMA2 0.87 0.91
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FAM38A -0.62 -0.76
DOCK6 -0.60 -0.69
GATA2 -0.60 -0.69
RRBP1 -0.60 -0.69
tenc1 -0.59 -0.68
sema3g -0.58 -0.66
工程 -0.58 -0.64
SLC6A12 -0.58 -0.67
梨1 -0.57 -0.66
ZBTB47 -0.56 -0.60

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004252 丝氨酸型内肽酶活性 IEA 谷氨酸(GO期限:7) -
去:0008233 肽酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006508 蛋白水解 IEA -
GO:0045786 细胞周期的负调控 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 塔斯 8764136

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PYEON HPV阳性肿瘤DN 10 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期 430 232 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jaeger转移DN 258 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周炎性反应lps up 431 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
sabates结直肠腺瘤 141 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hahtola兄弟姐妹Fungoides皮肤DN 27 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤分化了井和DN不良 382 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤分化了井与中度DN 110 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼头颈癌C 113 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林被肿瘤微环境沉默 108 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标1 DN 169 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标3 DN 59 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cromer转移DN 81 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 2 50 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张抗病毒对利巴韦林的反应 30 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durchdewald皮肤致癌DN 264 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 315 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Poola侵入性乳腺癌DN 134 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移DN 306 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP与H3未甲基化 228 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 211 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delpuech FOXO3靶向 68 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rattenbacher由Celf1绑定 467 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
寄养KDM1A靶向 266 142 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang EGF间隔DN 214 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因