概括
基因 5657
象征 PRTN3
同义词 acpa | agp7 | c-anca | canca | mbn | mbt | np-4 | np4 | p29 | pr-3 | pr3
描述 蛋白酶3
参考 MIM:177020|HGNC:HGNC:9495|ENSEMBL:ENSG00000196415|HPRD:01512|Vega:Otthumg00000181838
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19p13.3
Pascal P值 0.509
Sherlock P值 0.651
胎儿β -0.79
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:1.6269

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG19787694 19 846117 PRTN3 4.409E-4 -0.528 0.045 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ATP5O 0.90 0.91
Bud31 0.89 0.91
PSMB3 0.88 0.88
ATP5L 0.87 0.87
C11orf73 0.87 0.87
commd1 0.86 0.85
Znhit3 0.86 0.88
PSMB4 0.86 0.87
RBX1 0.86 0.87
PSMA5 0.85 0.86
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.26 -0.60 -0.63
AF347015.15 -0.58 -0.59
AF347015.2 -0.57 -0.59
AF347015.8 -0.57 -0.57
MT-ATP8 -0.56 -0.59
AF347015.18 -0.56 -0.61
AF347015.33 -0.54 -0.56
mt-cyb -0.53 -0.56
AF347015.27 -0.53 -0.55
EPAS1 -0.52 -0.55

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004252 丝氨酸型内肽酶活性 IEA 谷氨酸(GO期限:7) -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 15527767
去:0008233 肽酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006508 蛋白水解 IEA -
去:0008284 细胞增殖的阳性调节 塔斯 2598267
GO:0030574 胶原分解代谢过程 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005575 cellular_component nd -
GO:0043231 细胞内膜结合的细胞器 艾达 18029348

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID CMYB途径 84 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gal白血病干细胞DN 244 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mattioli Mgus vs PCL 116 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hatada甲基化在肺癌中 390 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
liang造血细胞数量大与微小 44 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath MYC带Ebox的目标 230 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
费尔南德斯(Fernandez)由迈克(Myc)约束 182 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang由Hoxa9和Meis1 Up永生 31 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HADDAD T淋巴细胞和NK祖细胞DN 63 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1突变DN的Verhaak AML 246 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向DN 292 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 281 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦凯布(McCabe)由HOXC6绑定 469 239 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe TGFB1靶向 102 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Qi Plasmacytoma Up 259 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yauch刺猬信号传导旁分泌 149 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤C D DN 252 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ichiba移植与宿主疾病35D UP 131 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
公园APL发病机理DN 50 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoffmann小型前BII至未成熟的B淋巴细胞向上 70 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带8 21易位 368 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤PCA1 UP 101 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝脏发展DN 222 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES LCP带有H3K4Me3 142 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kamikubo Myeloid Cebpa网络 28 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3靶向 387 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 549 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 321 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huang Gata2靶向 149 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因