概括
基因 56603
象征 CYP26B1
同义词 CYP26A2 | P450RAI-2 | P450RAI2 | RHFCA
描述 细胞色素P450家族26亚家族B成员1
参考 MIM:605207|HGNC:HGNC:20581|Ensembl:ENSG00000003137|HPRD:05550|Vega:Otthumg00000129756
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2P13.2
Pascal P值 0.008
Sherlock P值 0.205
胎儿β -2.771
主持人 海马

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
简历:PGC128 全基因组协会研究 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历:PGC128

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS3768644 CHR2 72361505 Ag 1.302E-7 内含子 CYP26B1


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CXCR4 0.86 0.79
BTG1 0.79 0.76
SLC1A5 0.77 0.77
SLC2A10 0.76 0.43
CDO1 0.76 0.58
GAS2L3 0.76 0.69
PLS3 0.75 0.20
SOAT1 0.75 0.57
IQGAP2 0.74 0.66
FZD2 0.72 0.60
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FBXO2 -0.35 -0.63
C5orf53 -0.35 -0.65
asphd1 -0.33 -0.55
HLA-F -0.33 -0.57
CA4 -0.33 -0.62
CCNI2 -0.32 -0.64
AF347015.27 -0.32 -0.68
AIFM3 -0.32 -0.57
pth1r -0.32 -0.57
AF347015.31 -0.32 -0.65

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg视黄醇代谢 64 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组生物氧化 139 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
底物类型排列的Reactome细胞色素P450 51 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Phase1化合物的功能化 70 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤 205 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni分子臂与ERMS DN 182 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jaeger转移DN 258 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 329 219 该途径中的所有SZGR 2.0基因
留置权乳腺癌化生型与导管 83 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤分化了井与中度DN 110 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB Morpholino Up 205 126 该途径中的所有SZGR 2.0基因
staege ewing家庭肿瘤 33 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Masri对他莫昔芬和芳香酶抑制剂的耐药性向上 20 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 315 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
mir15a和mir16 1的Bonci目标 91 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1靶向衰老 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Winzen通过KHSRP退化 100 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
将苯胺的固定成骨细胞分化 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durand Stroma S向上 297 194 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ghandhi直接辐照 110 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因