基因页面:PANX2
总结吗?
| GeneID | 56666年 |
| 象征 | PANX2 |
| 同义词 | PX2 | hPANX2 |
| 描述 | pannexin 2 |
| 参考 | MIM: 608421|HGNC: HGNC: 8600|运用:ENSG00000073150|HPRD: 09760|织女:OTTHUMG00000044649 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 22 q13.33 |
| 帕斯卡假定值 | 0.077 |
| 胎儿β | -1.267 |
| DMG | 2(#研究) |
| 支持 | G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了DNA的甲基化概要首发精神分裂症患者外周血细胞从18岁(FESZ)和15名正常对照组。 | 2 |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg26190233 | 22 | 50609610 | PANX2 | 2.758的军医 | 0.275 | 0.038 | DMG: Wockner_2014 |
| cg01606998 | 22 | 50608598 | PANX2 | -0.022 | 0.95 | DMG: Nishioka_2013 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RGS16 | 0.91 | 0.45 |
| GNG13 | 0.86 | 0.30 |
| FAM19A4 | 0.86 | 0.57 |
| CLMN | 0.86 | 0.59 |
| PTPN3 | 0.86 | 0.39 |
| TTC39A | 0.86 | 0.57 |
| FAM180B | 0.85 | 0.06 |
| RDH12 | 0.84 | 0.54 |
| CPNE9 | 0.84 | 0.57 |
| NEXN | 0.84 | 0.50 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| WDR86 | -0.30 | -0.37 |
| PLEKHO1 | -0.28 | -0.39 |
| CACNB3 | -0.27 | -0.26 |
| MEIS3P2 | -0.26 | -0.13 |
| NR2C2AP | -0.26 | -0.39 |
| SLIT1 | -0.25 | -0.31 |
| EMX1 | -0.25 | -0.41 |
| NAPRT1 | -0.25 | -0.35 |
| MPPED1 | -0.25 | -0.43 |
| IER5L | -0.25 | -0.37 |
第三部分。基因本体论注释
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005921 | 缝隙连接 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005886 | 等离子体膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0030054 | 细胞结 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| REACTOME神经系统 | 279年 | 221年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王LMO4 DN的目标 | 352年 | 225年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多亏尤文和病毒GPCR信号DN | 49 | 37 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 小山SEMA3B DN的目标 | 411年 | 249年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NIKOLSKY乳腺癌22个问题扩增子 | 17 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NIKOLSKY突变在乳腺癌和放大 | 94年 | 60 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LEIN中脑标记 | 82年 | 55 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LEIN脑桥标记 | 89年 | 59 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LEIN髓质标记 | 81年 | 48 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由喀斯特IWANAGA致癌PTEN DN | 353年 | 226年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MCV6 HCP H3K27ME3 | 435年 | 318年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马顿斯维甲酸反应了 | 857年 | 456年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过KDM3A KRIEG缺氧不 | 770年 | 480年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| let-7/98 | 956年 | 962年 | 1 | hsa-let-7a大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUU |
| hsa-let-7b大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUGUGGUU | ||||
| hsa-let-7c大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUAUGGUU | ||||
| hsa-let-7d大脑 | AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU | ||||
| hsa-let-7e大脑 | UGAGGUAGGAGGUUGUAUAGU | ||||
| hsa-let-7f大脑 | UGAGGUAGUAGAUUGUAUAGUU | ||||
| hsa - mir - 98大脑 | UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU | ||||
| hsa-let-7g深圳 | UGAGGUAGUAGUUUGUACAGU | ||||
| hsa-let-7i大脑 | UGAGGUAGUAGUUUGUGCUGU | ||||
| miR-17-5p / 20/93.mr / 106/519.d | 562年 | 568年 | m8 | hsa-miR-17-5p | CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU |
| hsa-miR-20a大脑 | UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG | ||||
| hsa - mir - 106 a | AAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGC | ||||
| hsa - mir - 106 b深圳 | UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU | ||||
| hsa-miR-20b深圳 | CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG | ||||
| hsa - mir - 519 d | CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU | ||||
| mir - 190 | 1007年 | 1013年 | 1 | hsa - mir - 190 | UGAUAUGUUUGAUAUAUUAGGU |
| mir - 361 | 1025年 | 1031年 | m8 | hsa - mir - 361大脑 | UUAUCAGAAUCUCCAGGGGUAC |